238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_2003 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_2003  Ion transport 2 domain protein  100 
 
 
269 aa  545  1e-154  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.191416 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0882  Ion transport 2 domain-containing protein  34.57 
 
 
241 aa  132  6e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000375333  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  34.69 
 
 
240 aa  104  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2671  ion transporter  31.74 
 
 
280 aa  103  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0363  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  28.18 
 
 
292 aa  100  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112983 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1424  Ion transport 2 domain protein  33.18 
 
 
253 aa  98.6  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.287794  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0287  hypothetical protein  34.78 
 
 
231 aa  96.7  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  30.19 
 
 
253 aa  96.7  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  28.15 
 
 
272 aa  95.5  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004526  cAMP-dependent Kef-type K+ transport system  32.32 
 
 
257 aa  92  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0919  Ion transport 2 domain-containing protein  28.81 
 
 
274 aa  92  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0885  Ion transport 2 domain-containing protein  28.81 
 
 
274 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.543733  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0909  Ion transport 2 domain protein  28.81 
 
 
274 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497907  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3453  Ion transport 2 domain-containing protein  28.81 
 
 
274 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.837221  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2923  Ion transport protein  30.62 
 
 
271 aa  88.6  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0620  ion transport 2 domain-containing protein  26.51 
 
 
264 aa  87.4  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2564  Ion transport 2 domain-containing protein  28.02 
 
 
268 aa  86.3  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108416  decreased coverage  0.00000252987 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0719  Ion transport 2 domain-containing protein  29.32 
 
 
270 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000693847  hitchhiker  0.000000252906 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0824  Ion transport 2 domain-containing protein  26.05 
 
 
274 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.978487 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3094  Ion transport 2 domain-containing protein  25.62 
 
 
273 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.533818  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0262  Ion transport 2 domain-containing protein  33.14 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1581  Ion transport 2 domain-containing protein  29.46 
 
 
262 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1192  Ion transport protein  27.31 
 
 
277 aa  82  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.645124  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3485  Ion transport 2 domain-containing protein  28.64 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319934  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0694  Ion transport 2  28.72 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3117  Ion transport 2 domain-containing protein  25.96 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0962789  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0855  Ion transport 2 domain-containing protein  25.96 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.289459  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1082  putative potassium channel protein  33.93 
 
 
280 aa  79.7  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  32.12 
 
 
265 aa  79  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0129  Ion transport 2 domain protein  37.39 
 
 
241 aa  79  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000177719  hitchhiker  0.0000693343 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3768  ion transporter  25.64 
 
 
274 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0929  Ion transport protein  33.33 
 
 
274 aa  78.2  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765221  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4447  Ion transport 2  28.02 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0874617  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4534  Ion transport 2 domain-containing protein  28.02 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.480815 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  28.33 
 
 
299 aa  77.8  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  28.87 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3269  Ion transport 2 domain-containing protein  27.08 
 
 
269 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1745  Ion transport 2 domain-containing protein  31.28 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4829  Ion transport 2 domain-containing protein  28.02 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.700731  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3841  ion transport 2 domain-containing protein  25.33 
 
 
268 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  unclonable  0.000000000129627 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2413  Ion transport 2 domain-containing protein  27.59 
 
 
268 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592727  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  27.44 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  26.14 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5008  Ion transport 2 domain-containing protein  26.97 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  26.97 
 
 
325 aa  71.6  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  32.24 
 
 
279 aa  70.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  28.84 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  27.73 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  27.73 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  27.73 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  29.48 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  26.92 
 
 
277 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  32.75 
 
 
282 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  29.69 
 
 
275 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0253  Ion transport 2 domain protein  38.64 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  24.9 
 
 
284 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1402  Ion transport protein  38.89 
 
 
331 aa  67  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0277452  hitchhiker  0.00237581 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  24.9 
 
 
284 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  24.9 
 
 
284 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  24.9 
 
 
284 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  32 
 
 
271 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0462  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  30.32 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1457  Kef-type K+ transport system NAD-binding protein  32.61 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1615  Ion transport protein  25.41 
 
 
271 aa  65.9  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  31.43 
 
 
269 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3869  Ion transport protein  26.5 
 
 
273 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.519934  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  28.65 
 
 
279 aa  65.1  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0605  Ion transport 2 domain protein  41.67 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1725  Ion transport protein  26.34 
 
 
292 aa  65.1  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0536813  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3630  Ion transport protein  27.27 
 
 
274 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  31.03 
 
 
276 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  28.99 
 
 
282 aa  64.7  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  30.41 
 
 
289 aa  64.3  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002929  possible potassium channel VIC family  30.48 
 
 
287 aa  63.5  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000118679  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  28 
 
 
272 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41153  VIC family transporter: calcium-activated outward-rectifying potassium ion channel  31.88 
 
 
265 aa  63.2  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4304  cation transporter, voltage-gated ion channel cation transporter  26.82 
 
 
273 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2531  hypothetical protein  47.22 
 
 
276 aa  63.2  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1566  Ion transport protein  26.82 
 
 
273 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0452104  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2774  Ion transport 2 domain protein  30.95 
 
 
244 aa  62.8  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000298794 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  27 
 
 
311 aa  62.4  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  27.08 
 
 
302 aa  62  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3225  Ion transport protein  28.43 
 
 
258 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.55 
 
 
408 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0040  Ion transport protein  29.67 
 
 
272 aa  61.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3070  Ion transport 2 domain-containing protein  32.56 
 
 
244 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.550123  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  24.88 
 
 
288 aa  60.8  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1014  Ion transport protein  28.19 
 
 
276 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000934363  hitchhiker  0.000116097 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3382  Ion transport protein  30.21 
 
 
277 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0078085  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  27.7 
 
 
273 aa  60.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4286  Ion transport protein  30.1 
 
 
272 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361083  normal  0.259623 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6685  Ion transport protein  31.32 
 
 
273 aa  60.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  34.34 
 
 
344 aa  60.5  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21361  potassium channel, VIC family protein  27.43 
 
 
212 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.5958 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2916  TrkA-N domain protein  29.05 
 
 
477 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.380494  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  35.51 
 
 
531 aa  60.1  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1097  Ion transport 2 domain-containing protein  30.7 
 
 
140 aa  59.7  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168795  normal  0.504261 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3624  ion transport protein, putative  29.69 
 
 
277 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  34.21 
 
 
279 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  28.16 
 
 
276 aa  59.7  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>