38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1957 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1957  membrane protein-like protein  100 
 
 
473 aa  969    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.217761  hitchhiker  0.00755155 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20820  predicted membrane protein  33.97 
 
 
428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.716498  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1765  hypothetical protein  47.03 
 
 
214 aa  195  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0161759 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0394  hypothetical protein  46.77 
 
 
212 aa  195  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.625345  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0830  hypothetical protein  47.03 
 
 
212 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1048  hypothetical protein  46.19 
 
 
215 aa  177  3e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.864097 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2664  protein of unknown function DUF161  42.72 
 
 
220 aa  156  6e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.15293e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0658  putative cytidylate kinase  36.92 
 
 
207 aa  152  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3531  hypothetical protein  32.35 
 
 
209 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0110536  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  32.32 
 
 
204 aa  126  7e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0147  uncharacterized membrane protein  38.86 
 
 
216 aa  123  8e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.108653  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3706  hypothetical protein  35.38 
 
 
204 aa  121  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3450  uncharacterized membrane protein  39.49 
 
 
225 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.218534  normal  0.0629267 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0106  cytidylate kinase  34.07 
 
 
201 aa  110  7.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2290  uncharacterized membrane protein  36.04 
 
 
219 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.360161 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0194  protein of unknown function DUF161  35.48 
 
 
214 aa  106  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414884 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1470  membrane protein-like  29.65 
 
 
236 aa  93.2  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0148532  normal  0.115701 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3903  hypothetical protein  30.14 
 
 
210 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00027123  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1768  hypothetical protein  28.89 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0547207  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2114  hypothetical protein  25.5 
 
 
202 aa  70.1  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000150815  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1705  hypothetical protein  26.24 
 
 
209 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.298807 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3022  hypothetical protein  28 
 
 
276 aa  62  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4038  hypothetical protein  24.39 
 
 
210 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2500  protein of unknown function DUF161  26.99 
 
 
218 aa  56.6  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  25 
 
 
275 aa  56.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0922  hypothetical protein  23.9 
 
 
209 aa  55.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0365  hypothetical protein  24.55 
 
 
242 aa  53.5  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0656462  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0517  hypothetical protein  25.9 
 
 
231 aa  52.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1911  transport-associated protein  26.56 
 
 
271 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.551319 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2312  transport-associated  26.56 
 
 
271 aa  52.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000102264  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3885  hypothetical protein  24.67 
 
 
219 aa  51.6  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  22.28 
 
 
275 aa  50.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1652  hypothetical protein  22.8 
 
 
229 aa  50.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202399  normal  0.336802 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  22.71 
 
 
273 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0901  putative cytidylate kinase, putative  21.9 
 
 
214 aa  48.9  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00118892  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1336  hypothetical protein  24.06 
 
 
259 aa  47  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1653  hypothetical protein  20.61 
 
 
229 aa  43.9  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000117481  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2398  response regulator receiver protein  24.24 
 
 
271 aa  43.5  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>