More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1609 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 		 187 aa  390  1e-108  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.999472 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0478  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  49.47 
 
 		 180 aa  176  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5106  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.36 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4080  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.72 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0562629 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3865  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36 
 
 		 222 aa  109  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1374  NADH dehydrogenase I chain I  35.63 
 
 		 175 aa  107  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00228535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2631  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.64 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.87866  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1238  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.29 
 
 		 181 aa  104  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0164  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 8  39.87 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4074  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.29 
 
 		 165 aa  101  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1296  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.02 
 
 		 238 aa  99.4  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1385  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.85 
 
 		 239 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.236148  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2564  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  37.85 
 
 		 239 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1284  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.85 
 
 		 239 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  33.74 
 
 		 163 aa  96.3  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  42.15 
 
 		 162 aa  95.9  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  32.54 
 
 		 179 aa  95.9  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  37.09 
 
 		 162 aa  95.1  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  33.55 
 
 		 182 aa  94.7  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1757  NADH dehydrogenase subunit I  32.93 
 
 		 163 aa  94  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  34.21 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1962  NADH dehydrogenase subunit I  34.81 
 
 		 163 aa  94  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.528282  normal  0.0448739 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  33.55 
 
 		 182 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  33.55 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1011  NADH dehydrogenase subunit I  38.64 
 
 		 162 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210818  normal  0.566427 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4134  NADH dehydrogenase subunit I  37.88 
 
 		 162 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181277  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1206  NADH dehydrogenase subunit I  38.64 
 
 		 162 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1077  NADH dehydrogenase subunit I  38.64 
 
 		 162 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0820  NADH dehydrogenase subunit I  38.02 
 
 		 160 aa  92.8  3e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4515  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.95 
 
 		 204 aa  92.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4398  NADH dehydrogenase subunit I  36.36 
 
 		 162 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  36.03 
 
 		 167 aa  91.3  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  33.56 
 
 		 182 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  36.03 
 
 		 167 aa  91.3  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  33.56 
 
 		 182 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  32.89 
 
 		 182 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.55 
 
 		 169 aa  91.3  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  32.89 
 
 		 182 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  32.89 
 
 		 182 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0691  NADH dehydrogenase subunit I  40 
 
 		 169 aa  91.3  8e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.438917  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  32.89 
 
 		 182 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1363  NADH dehydrogenase subunit I  40 
 
 		 162 aa  91.3  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.353821  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2051  NADH dehydrogenase subunit I  41.44 
 
 		 162 aa  91.3  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100158  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  33.55 
 
 		 182 aa  90.9  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1361  NADH dehydrogenase subunit I  33.12 
 
 		 163 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2390  NADH dehydrogenase subunit I  32.52 
 
 		 162 aa  90.1  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000573568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2993  NADH dehydrogenase subunit I  32.34 
 
 		 161 aa  90.9  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0361  NADH dehydrogenase subunit I  40 
 
 		 167 aa  90.1  2e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.326031  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2212  NADH dehydrogenase subunit I  38.52 
 
 		 162 aa  89.7  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.199823  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2926  NADH dehydrogenase subunit I  39.17 
 
 		 162 aa  90.1  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  38.33 
 
 		 169 aa  89.4  3e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1536  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.84 
 
 		 170 aa  89.4  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2412  NADH dehydrogenase subunit I  38.02 
 
 		 162 aa  89  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0701412  normal  0.0109704 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4064  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 		 171 aa  89.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0149353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4625  NADH dehydrogenase subunit I  31.85 
 
 		 162 aa  88.6  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.11536 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1879  NADH dehydrogenase subunit I  38.02 
 
 		 162 aa  89  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.262119 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  34.25 
 
 		 163 aa  89  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2582  NADH dehydrogenase subunit I  38.02 
 
 		 162 aa  88.6  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561308  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  39.17 
 
 		 164 aa  89  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1723  NADH dehydrogenase subunit I  41.75 
 
 		 163 aa  88.6  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341479  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1322  NADH dehydrogenase subunit I  38.33 
 
 		 164 aa  88.6  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323962  normal  0.0547108 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2877  NADH dehydrogenase subunit I  38.02 
 
 		 162 aa  88.6  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.670141  normal  0.245456 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  35.56 
 
 		 167 aa  88.6  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1030  NADH dehydrogenase subunit I  35.57 
 
 		 163 aa  88.6  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206882  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4553  NADH dehydrogenase subunit I  40.78 
 
 		 162 aa  88.2  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.128776 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0898  NADH dehydrogenase subunit I  32.91 
 
 		 163 aa  88.2  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  31.29 
 
 		 161 aa  88.2  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3218  NADH dehydrogenase subunit I  38.02 
 
 		 163 aa  88.2  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2824  NADH dehydrogenase subunit I  38.28 
 
 		 164 aa  87.8  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.704342  normal  0.0688011 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2415  NADH dehydrogenase subunit I  31.61 
 
 		 163 aa  87.8  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0810  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 		 163 aa  87  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719018  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0786  NADH dehydrogenase subunit I  39.02 
 
 		 163 aa  87.4  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.079686  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  32.5 
 
 		 273 aa  87.4  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1269  NADH dehydrogenase subunit I  40.78 
 
 		 163 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0805  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 		 163 aa  87  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3290  NADH dehydrogenase subunit I  37.19 
 
 		 162 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221287  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0754  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 		 164 aa  87.4  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  37.7 
 
 		 162 aa  87.4  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  37.21 
 
 		 164 aa  87.4  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0704772 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0554  NADH dehydrogenase subunit I  35 
 
 		 168 aa  86.7  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3502  NADH dehydrogenase subunit I  30.95 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.61 
 
 		 168 aa  86.3  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2238  NADH dehydrogenase subunit I  34.81 
 
 		 163 aa  86.7  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.180184 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1609  NADH dehydrogenase subunit I  35 
 
 		 163 aa  86.7  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0711  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.03 
 
 		 170 aa  85.9  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1411  NADH dehydrogenase subunit I  31.21 
 
 		 165 aa  86.3  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328529 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.61 
 
 		 165 aa  86.3  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88630  mitochondrial complex I NUIM TYKY subunit (proton translocation)  39.13 
 
 		 226 aa  85.9  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.970128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2993  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.91 
 
 		 440 aa  85.5  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0994  NADH dehydrogenase subunit I  32.28 
 
 		 163 aa  85.5  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.91 
 
 		 170 aa  85.5  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182151  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.61 
 
 		 165 aa  85.5  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1120  NADH dehydrogenase subunit I  32.7 
 
 		 180 aa  85.1  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1956  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.59 
 
 		 162 aa  85.1  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198639  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1352  NADH dehydrogenase subunit I  35.57 
 
 		 171 aa  84.7  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14260  predicted protein  37.19 
 
 		 163 aa  84.7  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  31.45 
 
 		 163 aa  84.3  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1567  NADH dehydrogenase subunit I  37.39 
 
 		 180 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997394  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2460  NADH dehydrogenase subunit I  37.39 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2430  NADH dehydrogenase subunit I  35.34 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>