36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6234 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6234  protein of unknown function DUF1023  100 
 
 		 234 aa  440  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3243  hypothetical protein  51.34 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000222563  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1256  protein of unknown function DUF1023  43.12 
 
 		 280 aa  135  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0652  protein of unknown function DUF1023  41.3 
 
 		 355 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3329  protein of unknown function DUF1023  42.08 
 
 		 339 aa  85.9  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.369843  normal  0.505117 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0558  hypothetical protein  31.78 
 
 		 368 aa  82  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2678  hypothetical protein  29.64 
 
 		 507 aa  79.7  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0838169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6229  hypothetical protein  32.45 
 
 		 619 aa  79  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0260  protein of unknown function DUF1023  30.43 
 
 		 554 aa  79  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.160803 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4380  hypothetical protein  29.89 
 
 		 556 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4871  hypothetical protein  31.97 
 
 		 554 aa  76.3  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213174  normal  0.122523 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1665  hypothetical protein  33.33 
 
 		 609 aa  75.5  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.671206  normal  0.521419 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0049  hypothetical protein  30.99 
 
 		 627 aa  75.1  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.124758 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1812  hypothetical protein  34.52 
 
 		 590 aa  72  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2874  hypothetical protein  28.51 
 
 		 525 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1233  hypothetical protein  30.86 
 
 		 563 aa  68.6  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19530  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  27.95 
 
 		 533 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208558  normal  0.423038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0412  hypothetical protein  30.49 
 
 		 545 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2509  protein of unknown function DUF1023  31.39 
 
 		 516 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0670827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6862  protein of unknown function DUF1023  31.19 
 
 		 654 aa  66.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1110  hypothetical protein  25.63 
 
 		 501 aa  66.2  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4801  hypothetical protein  30.04 
 
 		 526 aa  65.9  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0789  hypothetical protein  33.05 
 
 		 615 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.189931 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12116  hypothetical protein  30.74 
 
 		 656 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000797505  normal  0.720195 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0770  hypothetical protein  33.05 
 
 		 615 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321584  normal  0.712966 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0775  hypothetical protein  33.05 
 
 		 615 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2415  protein of unknown function DUF1023  29.33 
 
 		 557 aa  60.1  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.952384  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0437  protein of unknown function DUF1023  35.15 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10981  hypothetical protein  31.32 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123037  normal  0.880306 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12810  hypothetical protein  31.28 
 
 		 562 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000669373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12562  hypothetical protein  28.9 
 
 		 403 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000553876  normal  0.0832968 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07790  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  29.41 
 
 		 561 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0405  protein of unknown function DUF1023  28.98 
 
 		 469 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0667  hypothetical protein  30.14 
 
 		 594 aa  48.9  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144802  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3284  protein of unknown function DUF1023  32.95 
 
 		 569 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  normal  0.024568 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3447  hypothetical protein  28.83 
 
 		 538 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276502  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>