More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0185 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0185  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 311 aa  642    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0052  protein of unknown function DUF323  61.36 
 
 		 303 aa  379  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2259  hypothetical protein  40 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1234  protein of unknown function DUF323  40 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1031  protein of unknown function DUF323  38.96 
 
 		 265 aa  132  6e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  41.55 
 
 		 621 aa  132  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  37.86 
 
 		 861 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1321  protein of unknown function DUF323  35.54 
 
 		 270 aa  125  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.329702  hitchhiker  0.00614552 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0125  hypothetical protein  42.05 
 
 		 781 aa  122  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4578  hypothetical protein  38.28 
 
 		 852 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.54262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  37.31 
 
 		 251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  38.25 
 
 		 263 aa  115  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  34.36 
 
 		 253 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3081  XRE family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 81 aa  103  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.634194 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.56 
 
 		 416 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  34.56 
 
 		 416 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  28.2 
 
 		 923 aa  101  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  34.58 
 
 		 766 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  35.59 
 
 		 412 aa  96.7  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  32.43 
 
 		 337 aa  96.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  33.02 
 
 		 1818 aa  94  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0602  protein of unknown function DUF323  32.8 
 
 		 273 aa  94  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0325143  normal  0.360547 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  40.72 
 
 		 444 aa  93.6  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  43.8 
 
 		 965 aa  93.2  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  27.55 
 
 		 351 aa  92.8  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1282  serine/threonine kinase  33.2 
 
 		 327 aa  91.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0376412  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  31.42 
 
 		 358 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  36 
 
 		 444 aa  92  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  31.47 
 
 		 439 aa  91.3  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  33.83 
 
 		 437 aa  91.3  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  30.36 
 
 		 1190 aa  91.7  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 		 442 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  30.23 
 
 		 1049 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  36.36 
 
 		 417 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  35.15 
 
 		 468 aa  89.7  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  37.28 
 
 		 447 aa  89.4  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  28.87 
 
 		 318 aa  89.4  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  32.72 
 
 		 331 aa  88.6  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  27.57 
 
 		 319 aa  87.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  32.7 
 
 		 1186 aa  87.8  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1994  hypothetical protein  29.55 
 
 		 304 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  32.08 
 
 		 330 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.43 
 
 		 303 aa  87  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1626  hypothetical protein  42.22 
 
 		 329 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  29.03 
 
 		 614 aa  86.7  5e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  32.42 
 
 		 334 aa  86.3  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.88 
 
 		 308 aa  86.3  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  32.02 
 
 		 338 aa  85.5  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  33.19 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  27.01 
 
 		 1049 aa  84.3  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  25.27 
 
 		 436 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  31.82 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  33.73 
 
 		 446 aa  83.2  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  31.82 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  31.82 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  30.2 
 
 		 314 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  34.55 
 
 		 442 aa  81.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  28.75 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  33 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0084  TRP-2  37.23 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1587  hypothetical protein  37.23 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  34.39 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2381  hypothetical protein  27.78 
 
 		 481 aa  80.5  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00647578  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  38.71 
 
 		 1053 aa  80.1  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1155  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 		 328 aa  80.5  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094568 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  32.88 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  33.33 
 
 		 437 aa  80.5  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  34.34 
 
 		 487 aa  79.7  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6045  serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 		 842 aa  79.7  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  30.36 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  33.95 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  29.44 
 
 		 1007 aa  78.2  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  34.84 
 
 		 1183 aa  78.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  26.45 
 
 		 510 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1504  hypothetical protein  36.7 
 
 		 327 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.898087  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0142  hypothetical protein  28 
 
 		 633 aa  78.6  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0534916  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  37.19 
 
 		 1200 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0064  hypothetical protein  32.64 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0760  protein of unknown function DUF323  30.77 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3264  hypothetical protein  30.08 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.42 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1012  hypothetical protein  29.11 
 
 		 480 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  36.09 
 
 		 446 aa  77  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3353  hypothetical protein  29.96 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  39.34 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2121  hypothetical protein  31.31 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  normal  0.0571528 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  30.39 
 
 		 1581 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  33.53 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2850  hypothetical protein  46.75 
 
 		 445 aa  75.9  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431926  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  32 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  33.33 
 
 		 351 aa  75.9  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  32.79 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  42.73 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  26.81 
 
 		 325 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  42.27 
 
 		 960 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4948  protein of unknown function DUF323  29.91 
 
 		 349 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.864459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  31.1 
 
 		 506 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  26.13 
 
 		 1492 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>