More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4236 on replicon NC_008765
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008765  Ajs_4236  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 91 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1551  histone-like DNA-binding protein  56.18 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00525571  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3067  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 92 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0353619 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0065  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 92 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3933  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 92 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3247  histone-like DNA-binding protein  56.18 
 
 		 92 aa  99  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0084  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 92 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4504  DNA-binding protein HU-alpha  56.18 
 
 		 92 aa  99  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0005  histone-like DNA-binding protein  56.18 
 
 		 92 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129264  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0055  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 92 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0065  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 92 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0066  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 92 aa  99  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0004  DNA-binding protein HU-alpha  55.06 
 
 		 126 aa  98.2  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2913  DNA-binding protein HU, form B  55.06 
 
 		 92 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0004  DNA-binding protein HU-alpha  55.06 
 
 		 92 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4958  histone-like DNA-binding protein  55.06 
 
 		 103 aa  97.8  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.674818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0004  DNA-binding protein HU-alpha  55.06 
 
 		 92 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1629  DNA-binding protein HU, form B  55.06 
 
 		 92 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2972  DNA-binding protein HU-alpha  55.06 
 
 		 92 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3397  DNA-binding protein HU, form B  55.06 
 
 		 92 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.218557  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1633  histone family protein DNA-binding protein  52.87 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3460  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0312988  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1014  histone family protein DNA-binding protein  52.87 
 
 		 90 aa  89.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0628  histone-like DNA-binding protein  51.65 
 
 		 93 aa  89.7  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2292  nucleoid protein Hbs  52.87 
 
 		 90 aa  89.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337722  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1187  histone family protein DNA-binding protein  52.87 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1909  histone family protein DNA-binding protein  51.72 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2621  histone family protein DNA-binding protein  52.87 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.348082  normal  0.0833374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2879  histone family protein DNA-binding protein  52.87 
 
 		 90 aa  88.6  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2386  histone family protein DNA-binding protein  51.72 
 
 		 94 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405821  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2521  DNA-binding protein HU-beta  51.72 
 
 		 94 aa  88.6  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0944475  normal  0.0105947 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2793  histone family protein DNA-binding protein  51.72 
 
 		 94 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3065  nucleoid protein Hbs  52.87 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135138  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1789  histone family protein DNA-binding protein  51.72 
 
 		 90 aa  88.6  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.970942  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1910  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  88.2  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000311196  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1666  histone family protein DNA-binding protein  51.72 
 
 		 90 aa  88.2  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1956  nucleoid protein Hbs  51.72 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.582961  normal  0.45981 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2800  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 98 aa  87  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.224088  normal  0.168856 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1873  HU family DNA-binding protein  50.56 
 
 		 91 aa  86.7  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.972501  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0007  histone-like DNA-binding protein  52.94 
 
 		 98 aa  86.7  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4682  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 92 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0505442  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1714  DNA-binding protein HU-beta  49.43 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.606946  normal  0.0324854 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0956  DNA-binding protein HU-alpha  49.44 
 
 		 92 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7326  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 92 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.076405 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2697  histone family protein DNA-binding protein  49.43 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3619  histone-like DNA-binding protein  43.82 
 
 		 94 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0576  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2337  histone family protein DNA-binding protein  45.05 
 
 		 185 aa  84.3  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2005  histone family protein DNA-binding protein  45.05 
 
 		 188 aa  84.3  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2337  histone-like DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  84.3  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000498066  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3512  histone-like DNA-binding protein  49.44 
 
 		 99 aa  84  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.848806  normal  0.0177296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1115  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 94 aa  84  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.545347  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1051  transcriptional regulator HU subunit beta  50.56 
 
 		 90 aa  84  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.593082  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3261  transcriptional regulator HU subunit beta  50.56 
 
 		 90 aa  84  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2805  histone family protein DNA-binding protein  45.05 
 
 		 187 aa  84  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.535515  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2063  HU family DNA-binding protein  49.44 
 
 		 91 aa  83.6  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.832344  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1533  histone family protein DNA-binding protein  47.13 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.753498  normal  0.353479 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0133  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 91 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116647  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1360  histone family protein DNA-binding protein  43.96 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.659546  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  45.56 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1743  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1674  histone-like DNA-binding protein  48.28 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.171237 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0187  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 93 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1234  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.253249  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2248  histone-like DNA-binding protein  50.57 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.117837  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0440  histone family protein DNA-binding protein  45.35 
 
 		 91 aa  82.8  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2026  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000760647  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  46.07 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1866  histone family protein DNA-binding protein  47.13 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0187787  hitchhiker  0.00274705 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1227  HU family DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000165625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1611  nucleoid protein HU beta subunit  48.31 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3008  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 91 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.341575 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1275  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 91 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000292942  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3296  nucleoid protein Hbs  47.19 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.58524  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3065  transcriptional regulator HU subunit beta  49.44 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8015  histone-like DNA-binding protein  46.07 
 
 		 99 aa  80.9  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3110  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000105676  hitchhiker  0.00000299463 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  43.82 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  46.07 
 
 		 96 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0712  histone family protein DNA-binding protein  48.84 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2873  transcriptional regulator HU subunit beta  48.31 
 
 		 90 aa  80.1  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1364  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3132  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 94 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246817  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0022  DNA-binding protein HU  47.19 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00102315  hitchhiker  0.000567997 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1544  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000007734  hitchhiker  0.000745392 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0355  histone-like DNA-binding protein  43.82 
 
 		 94 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00204011  normal  0.390975 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10750  nucleoid DNA-binding protein  43.96 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0258  normal  0.262164 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2492  histone-like DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00401844  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3493  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.175993  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0500  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759527 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1172  histone-like DNA-binding protein  40.45 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856335  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41210  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0758892  normal  0.416187 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2505  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791734  normal  0.581146 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3781  HU family DNA-binding protein  49.43 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.0095051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>