46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1938 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1938  SMC domain protein  100 
 
 		 946 aa  1779    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1236  putative GTP-binding protein  28.4 
 
 		 874 aa  94.4  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0710819  normal  0.307614 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1763  SMC domain-containing protein  25.74 
 
 		 880 aa  89  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0913667  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4435  hypothetical protein  37.31 
 
 		 885 aa  85.5  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5376  SMC domain protein  26.82 
 
 		 874 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558222  normal  0.369083 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4008  hypothetical protein  34.93 
 
 		 877 aa  81.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3934  hypothetical protein  34.93 
 
 		 877 aa  81.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3949  hypothetical protein  34.93 
 
 		 877 aa  81.6  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.028786 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2256  hypothetical protein  34.67 
 
 		 883 aa  78.2  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11304  hypothetical protein  36.57 
 
 		 875 aa  73.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1218  SMC domain protein  35.61 
 
 		 877 aa  73.2  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  24.16 
 
 		 901 aa  72.4  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2464  hypothetical protein  33 
 
 		 1051 aa  72  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0821  SMC domain-containing protein  26.78 
 
 		 917 aa  70.1  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0839342 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0398  putative GTP-binding protein  26.94 
 
 		 878 aa  68.9  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126462  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13301  RecF protein:ABC transporter  24.9 
 
 		 918 aa  62.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23970  hypothetical protein  35.04 
 
 		 874 aa  60.8  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1248  hypothetical protein  30.84 
 
 		 888 aa  56.6  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.836772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0671  NADH:ubiquinone oxidoreductase,subunit RnfB  57.41 
 
 		 104 aa  56.2  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.464175  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1226  GTP-binding protein  26.27 
 
 		 875 aa  54.7  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  27.32 
 
 		 873 aa  53.9  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  38.03 
 
 		 1284 aa  51.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  32 
 
 		 1201 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6698  hypothetical protein  29.35 
 
 		 1156 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000566514  normal  0.196198 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6633  hypothetical protein  29.35 
 
 		 1156 aa  50.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0515539  normal  0.197368 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  31.53 
 
 		 711 aa  49.3  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0855  chromosome segregation protein SMC  33 
 
 		 1200 aa  48.9  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00379552  normal  0.0307887 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  25.91 
 
 		 968 aa  48.9  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  30.22 
 
 		 1171 aa  48.9  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5856  hypothetical protein  28.86 
 
 		 1156 aa  47.8  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0304556  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5338  hypothetical protein  32.31 
 
 		 1156 aa  47.8  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498426  decreased coverage  0.0063225 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6222  hypothetical protein  28.86 
 
 		 1156 aa  47.8  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266733  normal  0.0150279 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3540  hypothetical protein  36.84 
 
 		 1153 aa  47.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5217  putative GTP-binding protein  27.58 
 
 		 878 aa  47.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81586  normal  0.196826 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  25.26 
 
 		 812 aa  46.6  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  26.76 
 
 		 1280 aa  47  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  33.78 
 
 		 787 aa  46.6  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5978  hypothetical protein  32.31 
 
 		 1156 aa  47  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1092  hypothetical protein  30 
 
 		 1210 aa  46.2  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69355  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5733  hypothetical protein  32.61 
 
 		 1156 aa  46.2  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0311006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1270  hypothetical protein  42.86 
 
 		 1181 aa  46.2  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1157 aa  45.4  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1149  SMC domain protein  33.8 
 
 		 1163 aa  45.8  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.166006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1422  nuclease SbcCD, C subunit, putative  33.88 
 
 		 724 aa  45.1  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  45.83 
 
 		 1065 aa  45.1  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  30.37 
 
 		 1160 aa  44.3  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>