167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0478 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0478  protein of unknown function DUF159  100 
 
 		 209 aa  409  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  30.16 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1441  hypothetical protein  29.38 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  26.87 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3104  hypothetical protein  28.81 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20440  hypothetical protein  31.68 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00702652  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  33.91 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  33.91 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  28.49 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  33.04 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  32.98 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  31.47 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  28.11 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0386  hypothetical protein  36.89 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.782275  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  35.96 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  31.91 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  25.35 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2013  protein of unknown function DUF159  23.08 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  29.79 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  31 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  29.51 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  32.49 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  28.26 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  28.23 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  24.78 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2142  hypothetical protein  32.22 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312675 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  27.03 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 		 226 aa  62  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  27.17 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  25.95 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1100  protein of unknown function DUF159  29.65 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0567  protein of unknown function DUF159  26.46 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  30.6 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12701  hypothetical protein  24.59 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25410  hypothetical protein  49.09 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0698226  normal  0.491918 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  28.49 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  26.84 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28660  hypothetical protein  29.17 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15591  hypothetical protein  24.04 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19201  hypothetical protein  30 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2049  protein of unknown function DUF159  27.69 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012263 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  27.64 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  27.8 
 
 		 248 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0318  protein of unknown function DUF159  25.13 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.527161  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12631  hypothetical protein  25.14 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3924  hypothetical protein  27.69 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405964  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1107  protein of unknown function DUF159  30.63 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.485434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1568  hypothetical protein  25 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000595888  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2598  protein of unknown function DUF159  25.68 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.107736 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  35.14 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2605  hypothetical protein  28.49 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  28.29 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  28.95 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  29.27 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  24.06 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  26.63 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3110  hypothetical protein  31.11 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1263  hypothetical protein  29.57 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0853  protein of unknown function DUF159  31.93 
 
 		 270 aa  55.1  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000182403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  26.67 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0786  hypothetical protein  39.18 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0851  protein of unknown function DUF159  30.93 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00651427  normal  0.246274 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0758  hypothetical protein  39.18 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  35.66 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4430  hypothetical protein  28.41 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  29.6 
 
 		 266 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  29.6 
 
 		 266 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0095  protein of unknown function DUF159  28.57 
 
 		 250 aa  54.3  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  32.54 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0983  hypothetical protein  27.81 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.015485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4716  hypothetical protein  28.88 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.752414  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1207  hypothetical protein  24 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  32.62 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1044  protein of unknown function DUF159  28.31 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  26.92 
 
 		 261 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1024  protein of unknown function DUF159  30.43 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  27.32 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  29.23 
 
 		 261 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  31.48 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  26.61 
 
 		 281 aa  53.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  25.27 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0800  hypothetical protein  38.14 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1085  hypothetical protein  25.52 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0480767  normal  0.170252 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  27.96 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  32.41 
 
 		 222 aa  52.4  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1143  hypothetical protein  27.78 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284928  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  26.29 
 
 		 253 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  30.81 
 
 		 257 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1918  hypothetical protein  29.03 
 
 		 229 aa  52.4  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.78991 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  29.19 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0315  hypothetical protein  28.57 
 
 		 197 aa  52  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.555967 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1254  hypothetical protein  26.24 
 
 		 338 aa  52  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0999798 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0311  hypothetical protein  28.57 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  27.89 
 
 		 239 aa  51.6  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16700  hypothetical protein  28.5 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3713  hypothetical protein  30.47 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1248  hypothetical protein  26.23 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61122  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  28.36 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2383  hypothetical protein  42.31 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  0.518006 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4181  protein of unknown function DUF159  28.89 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>