246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0576 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0576  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 
177 aa  353  5.999999999999999e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0413434  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1226  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.43 
 
 
176 aa  246  8e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0176208  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1981  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.29 
 
 
176 aa  244  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1029  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.57 
 
 
174 aa  243  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000258699  unclonable  0.0000000048858 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3713  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.14 
 
 
176 aa  242  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.77 
 
 
181 aa  230  8.000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1105  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.92 
 
 
180 aa  229  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000745772  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0485  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.71 
 
 
185 aa  229  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182784 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1556  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.71 
 
 
181 aa  227  5e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.910696  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1997  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.71 
 
 
180 aa  226  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.34 
 
 
177 aa  225  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3653  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.02 
 
 
180 aa  222  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00119552  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2482  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.02 
 
 
180 aa  221  4e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000211786  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1338  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.09 
 
 
181 aa  219  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00663055  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1315  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.45 
 
 
180 aa  219  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  unclonable  7.14384e-26 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1313  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.09 
 
 
181 aa  219  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0603  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.23 
 
 
177 aa  219  9.999999999999999e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124989  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3928  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.55 
 
 
180 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00131744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.55 
 
 
180 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3571  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.55 
 
 
180 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000211087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3589  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.55 
 
 
180 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000154758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3968  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.55 
 
 
180 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000710132  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1099  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.71 
 
 
182 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3842  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.55 
 
 
180 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.01545e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3872  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.55 
 
 
180 aa  218  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0375524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3877  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.55 
 
 
180 aa  218  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000521125  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2179  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.43 
 
 
176 aa  216  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00206199  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.66 
 
 
204 aa  216  1e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.43 
 
 
184 aa  216  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0819  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.95 
 
 
180 aa  216  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1384  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.43 
 
 
181 aa  215  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.53 
 
 
176 aa  216  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1699  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.57 
 
 
176 aa  215  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000408331  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  60 
 
 
187 aa  214  4e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.66 
 
 
181 aa  214  4e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.09 
 
 
182 aa  214  5e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1449  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.63 
 
 
177 aa  214  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0416  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.71 
 
 
176 aa  214  5.9999999999999996e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00178551  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0400  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.71 
 
 
176 aa  214  5.9999999999999996e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000263629  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.52 
 
 
182 aa  213  8e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0533  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.63 
 
 
176 aa  213  9e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1384  ATP-dependent protease peptidase subunit  56 
 
 
181 aa  213  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000068782  normal  0.819068 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0230  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.93 
 
 
176 aa  211  3.9999999999999995e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000355363  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.95 
 
 
183 aa  211  5.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0843  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 
178 aa  211  5.999999999999999e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.60508  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2411  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.58 
 
 
177 aa  210  7.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0141789  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0441  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.63 
 
 
174 aa  210  9e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.4 
 
 
178 aa  210  9e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2541  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.4 
 
 
188 aa  209  1e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.29 
 
 
178 aa  209  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 
178 aa  209  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0375  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.05 
 
 
174 aa  209  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.29 
 
 
179 aa  208  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4191  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.63 
 
 
174 aa  207  5e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4369  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.3 
 
 
172 aa  207  6e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5000  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.16 
 
 
176 aa  207  8e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5050  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.16 
 
 
176 aa  207  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4874  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.16 
 
 
176 aa  207  8e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441904  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3781  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.72 
 
 
174 aa  206  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171501  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3492  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.76 
 
 
182 aa  206  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  56.25 
 
 
180 aa  206  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1323  20S proteasome A and B subunits  62.43 
 
 
179 aa  206  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0930  ATP-dependent protease peptidase subunit  56 
 
 
182 aa  206  2e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3599  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 
187 aa  205  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000487409  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0149  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.69 
 
 
186 aa  206  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0600  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.3 
 
 
172 aa  206  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.059342  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3797  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.88 
 
 
176 aa  205  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0782  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.86 
 
 
182 aa  204  4e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.639301  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1439  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.14 
 
 
182 aa  204  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1541  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.54 
 
 
175 aa  204  4e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0114  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.3 
 
 
176 aa  204  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4041  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.3 
 
 
176 aa  204  4e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45380  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.05 
 
 
180 aa  204  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.479981  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2000  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.38 
 
 
184 aa  204  4e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.299358  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03817  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.3 
 
 
176 aa  204  6e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4053  20S proteasome A and B subunits  59.3 
 
 
176 aa  204  6e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4086  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.3 
 
 
176 aa  204  6e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0127  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.96 
 
 
184 aa  204  6e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4164  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.3 
 
 
176 aa  204  6e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5389  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.3 
 
 
176 aa  204  6e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4468  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.3 
 
 
176 aa  204  6e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4374  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.3 
 
 
176 aa  204  6e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.712688 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03766  hypothetical protein  59.3 
 
 
176 aa  204  6e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4414  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.3 
 
 
176 aa  204  6e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0890704  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2080  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.38 
 
 
184 aa  204  7e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2248  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.47 
 
 
185 aa  204  7e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0709  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.3 
 
 
188 aa  203  8e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0214  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.3 
 
 
180 aa  203  9e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248061  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4424  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.3 
 
 
176 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4492  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.3 
 
 
176 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4338  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.3 
 
 
176 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0829  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.84 
 
 
178 aa  203  1e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000238243  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3440  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 
185 aa  202  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.952306  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4422  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.3 
 
 
176 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4308  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.3 
 
 
176 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0180  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.72 
 
 
176 aa  202  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1210  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.27 
 
 
178 aa  202  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0166  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.72 
 
 
176 aa  202  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.14 
 
 
174 aa  202  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0303  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.96 
 
 
190 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>