More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2434 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2434  putative aldolase  100 
 
 
211 aa  423  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5014  putative aldolase  76.78 
 
 
224 aa  332  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0583347  normal  0.341145 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1030  putative aldolase  74.88 
 
 
228 aa  330  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2896  putative aldolase  74.41 
 
 
220 aa  327  6e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0811936 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1137  putative aldolase  77.03 
 
 
226 aa  325  3e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2628  putative aldolase  77.25 
 
 
218 aa  325  3e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4650  putative aldolase  77.73 
 
 
221 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.590566  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  75.12 
 
 
225 aa  324  5e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  74.88 
 
 
222 aa  323  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2082  putative aldolase  73.93 
 
 
220 aa  322  2e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1853  putative aldolase  72.86 
 
 
220 aa  309  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1553  putative aldolase  64.29 
 
 
216 aa  278  5e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal  0.465696 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3180  putative aldolase  56.19 
 
 
219 aa  230  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3382  class II aldolase/adducin family protein  60.1 
 
 
217 aa  220  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1632  putative aldolase  54.55 
 
 
220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  48.6 
 
 
243 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  48.6 
 
 
231 aa  209  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1425  putative aldolase  53.4 
 
 
217 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1837  putative aldolase  55.08 
 
 
212 aa  204  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0769134  normal  0.0677306 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0129  putative aldolase  51.96 
 
 
224 aa  194  9e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0144  putative aldolase  51.96 
 
 
210 aa  194  9e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.349251  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2485  class II aldolase/adducin family protein  53.73 
 
 
226 aa  194  9e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3734  putative aldolase  52.15 
 
 
214 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3411  putative aldolase  51.2 
 
 
214 aa  191  8e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02588  hypothetical protein  48.29 
 
 
212 aa  189  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0950  class II aldolase/adducin family protein  48.29 
 
 
212 aa  189  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02553  hypothetical protein  48.29 
 
 
212 aa  189  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2876  putative aldolase  48.29 
 
 
212 aa  189  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3035  putative aldolase  48.29 
 
 
212 aa  189  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0116  putative aldolase  47.03 
 
 
218 aa  190  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3136  putative aldolase  48.29 
 
 
212 aa  189  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0974  putative aldolase  48.29 
 
 
212 aa  189  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.776053  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0110  putative aldolase  46.53 
 
 
218 aa  187  7e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4425  putative aldolase  51.03 
 
 
218 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5062  class II aldolase/adducin domain protein  49.23 
 
 
212 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3066  putative aldolase  49.02 
 
 
212 aa  185  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.494057 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3037  putative aldolase  49.02 
 
 
212 aa  185  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0464  putative aldolase  48.72 
 
 
212 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3121  putative aldolase  49.02 
 
 
212 aa  185  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0531321 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3225  putative aldolase  49.02 
 
 
212 aa  185  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3105  putative aldolase  48.29 
 
 
212 aa  184  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1490  putative aldolase  47.83 
 
 
210 aa  182  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  43.94 
 
 
215 aa  181  7e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  41.35 
 
 
210 aa  179  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2170  putative aldolase  50 
 
 
220 aa  179  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842805  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3498  putative aldolase  48.08 
 
 
213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392898  normal  0.194137 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3143  putative aldolase  52.91 
 
 
209 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5929  putative aldolase  50 
 
 
220 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2023  class II aldolase/adducin family protein  50.75 
 
 
208 aa  178  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0841682  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1445  class II aldolase/adducin family protein  50.25 
 
 
208 aa  176  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1553  class II aldolase/adducin family protein  50.51 
 
 
204 aa  175  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4877  putative aldolase  47.32 
 
 
224 aa  175  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  45.32 
 
 
210 aa  174  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  41.79 
 
 
210 aa  171  5.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1859  putative aldolase  48.56 
 
 
213 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0575  putative aldolase  48.56 
 
 
213 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1922  putative aldolase  48.56 
 
 
213 aa  170  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0440  putative aldolase  48.56 
 
 
213 aa  170  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0476  putative aldolase  46.41 
 
 
212 aa  170  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369646  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0975  putative aldolase  48.08 
 
 
213 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0444  putative aldolase  48.66 
 
 
224 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5075  putative aldolase  45.93 
 
 
212 aa  170  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5143  putative aldolase  47.51 
 
 
222 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0892  putative aldolase  48.56 
 
 
213 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2015  putative aldolase  48.08 
 
 
213 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435503  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2814  putative aldolase  48.13 
 
 
212 aa  168  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.216378 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3210  putative aldolase  47.37 
 
 
212 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5157  putative aldolase  47.37 
 
 
212 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117752  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5122  putative aldolase  47.37 
 
 
212 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2331  class II aldolase/adducin family protein  45.41 
 
 
216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4552  putative aldolase  45.45 
 
 
213 aa  161  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.211976 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3731  class II aldolase/adducin family protein  46.84 
 
 
220 aa  142  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  32.27 
 
 
264 aa  121  8e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  33.98 
 
 
214 aa  115  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  35.5 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  32.12 
 
 
303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  34.62 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  30.88 
 
 
216 aa  107  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  33.33 
 
 
234 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  36.54 
 
 
215 aa  105  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  32.34 
 
 
219 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  30.92 
 
 
215 aa  100  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  35.64 
 
 
225 aa  99.8  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1298  class II aldolase/adducin family protein  30.85 
 
 
398 aa  99.4  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65057  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  31.69 
 
 
265 aa  99.8  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  34.97 
 
 
227 aa  99  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1451  L-fuculose phosphate aldolase  33.18 
 
 
215 aa  99  5e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32120  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  38.19 
 
 
216 aa  98.6  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.441837  normal  0.216686 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0128  class II aldolase/adducin family protein  27.49 
 
 
214 aa  96.3  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.717156  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  30.99 
 
 
220 aa  95.5  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1302  class II aldolase/adducin family protein  33.67 
 
 
427 aa  94.7  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0324  class II aldolase/adducin family protein  34.13 
 
 
218 aa  94.4  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7708  class II aldolase/adducin family protein  34.33 
 
 
215 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0695  class II aldolase/adducin family protein  30.05 
 
 
428 aa  92.8  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09610  class II aldolase/adducin family protein  28.71 
 
 
214 aa  93.2  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3764  class II aldolase/adducin family protein  32.7 
 
 
212 aa  92.4  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00716825  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1110  L-fuculose phosphate aldolase, putative  35.21 
 
 
219 aa  92.4  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0434  class II aldolase/adducin family protein  31.52 
 
 
180 aa  92.4  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192772  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  27.59 
 
 
214 aa  91.7  7e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4482  class II aldolase/adducin-like  31.5 
 
 
220 aa  90.9  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0177289  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>