More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1288 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1288  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  100 
 
 
227 aa  457  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.924033  normal  0.845056 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4008  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.78 
 
 
161 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6243400000000003e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3924  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.1 
 
 
161 aa  119  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0146493  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1542  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.67 
 
 
179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0340  NADH dehydrogenase I, C subunit  35.14 
 
 
162 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3633  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.8 
 
 
187 aa  108  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4242  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  34.01 
 
 
164 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000475487  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1309  NADH dehydrogenase subunit C  48.42 
 
 
215 aa  106  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.0849556 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0522  NADH dehydrogenase subunit C  38.73 
 
 
250 aa  105  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3224  NADH dehydrogenase subunit C  44.86 
 
 
200 aa  102  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0405196  normal  0.943012 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3353  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35 
 
 
162 aa  102  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000103894  normal  0.0125346 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2693  NADH dehydrogenase subunit C  34.88 
 
 
252 aa  102  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1287  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.5 
 
 
190 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.420943  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2005  NADH dehydrogenase subunit C  47.37 
 
 
200 aa  101  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1118  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  43.9 
 
 
592 aa  101  9e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.374283  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0743  NADH dehydrogenase subunit C  47.37 
 
 
201 aa  100  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1176  NADH dehydrogenase subunit C  46.32 
 
 
200 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.410937  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7689  NADH dehydrogenase subunit C  39.53 
 
 
235 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.800892  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4483  NADH dehydrogenase subunit C  33.73 
 
 
226 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00208368 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2514  NADH dehydrogenase subunit C  46.32 
 
 
200 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1578  NADH dehydrogenase subunit C  35.37 
 
 
231 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1602  NADH dehydrogenase subunit C  35.37 
 
 
231 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.949933  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1548  NADH dehydrogenase subunit C  35.37 
 
 
231 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559128  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4392  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.23 
 
 
215 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165622  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1883  NADH dehydrogenase subunit C  34.15 
 
 
225 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2301  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40 
 
 
309 aa  99  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0890  NADH dehydrogenase subunit C  35.66 
 
 
201 aa  98.2  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13168  NADH dehydrogenase subunit C  32.32 
 
 
236 aa  98.2  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5419  NADH dehydrogenase subunit C  37.11 
 
 
421 aa  98.2  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2834  NADH dehydrogenase subunit C  48.98 
 
 
214 aa  97.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  0.125217 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4998  NADH dehydrogenase subunit C  36.05 
 
 
409 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1276  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  34.36 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.662944  normal  0.334332 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0140  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  32.68 
 
 
266 aa  97.1  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5531  NADH dehydrogenase subunit C  35.47 
 
 
412 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000346603 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03180  NADH dehydrogenase subunit C  30.86 
 
 
253 aa  97.1  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2154  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  34.04 
 
 
230 aa  96.3  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.818422  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0283  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  35.85 
 
 
229 aa  96.3  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3298  NADH dehydrogenase subunit C  41.03 
 
 
204 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2984  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.92 
 
 
217 aa  95.9  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401685  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0923  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.38 
 
 
213 aa  95.9  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0484  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.99 
 
 
209 aa  95.5  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0586  NADH:ubiquinone oxidoreductase 27 kD subunit- like protein  36.2 
 
 
225 aa  95.5  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3136  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.57 
 
 
162 aa  95.5  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000631094  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0976  NADH dehydrogenase subunit C  39.73 
 
 
275 aa  95.1  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1353  NADH dehydrogenase subunit C  37.06 
 
 
200 aa  95.1  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1827  NADH dehydrogenase subunit C  34.38 
 
 
268 aa  94.7  9e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.181589  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5798  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.03 
 
 
205 aa  95.1  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323776  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1261  NADH dehydrogenase subunit C  36.36 
 
 
200 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.841588  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4631  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.17 
 
 
209 aa  93.6  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.247115 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  34.73 
 
 
794 aa  93.6  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2397  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.17 
 
 
212 aa  94  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29035  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1171  NADH dehydrogenase subunit C  44.21 
 
 
207 aa  93.2  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1309  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.05 
 
 
274 aa  92.8  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.620386  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5096  NADH dehydrogenase subunit C  42.86 
 
 
485 aa  92.8  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2714  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  34.5 
 
 
309 aa  92.8  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2248  NADH dehydrogenase subunit C  42.06 
 
 
208 aa  92.8  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0117858  normal  0.111894 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4063  NADH dehydrogenase subunit C  36.02 
 
 
245 aa  92.4  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5148  NADH dehydrogenase subunit C  37.01 
 
 
317 aa  92.4  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5540  NADH dehydrogenase subunit C  37.01 
 
 
317 aa  92.4  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1292  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.32 
 
 
174 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.232426  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4980  NADH dehydrogenase subunit C  37.25 
 
 
449 aa  92  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2402  NADH dehydrogenase subunit C  33.57 
 
 
199 aa  92  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0037532 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0780  NADH dehydrogenase subunit C  35.92 
 
 
205 aa  92  6e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.575172  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4128  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.04 
 
 
215 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2920  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.92 
 
 
204 aa  92  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5389  NADH dehydrogenase subunit C  37.01 
 
 
387 aa  92  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.92226e-22 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6680  NADH dehydrogenase subunit C  34.22 
 
 
252 aa  92  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1314  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.89 
 
 
165 aa  92  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5474  NADH dehydrogenase subunit C  36.48 
 
 
421 aa  91.7  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0979  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.84 
 
 
148 aa  91.7  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6092  NADH dehydrogenase subunit C  43.36 
 
 
229 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0471  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.28 
 
 
283 aa  91.3  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.665178  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1357  NADH dehydrogenase subunit C  40.19 
 
 
200 aa  91.3  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.357714  normal  0.0381949 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3676  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.01 
 
 
174 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00982408 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1275  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.05 
 
 
196 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1376  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.05 
 
 
196 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.842396  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2573  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.44 
 
 
196 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3330  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.15 
 
 
213 aa  90.1  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.345672  normal  0.0583392 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0269  NADH dehydrogenase subunit C  38.03 
 
 
192 aa  90.5  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.148576  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1122  NADH dehydrogenase I, C subunit  41.75 
 
 
190 aa  90.1  3e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4461  NADH dehydrogenase subunit C  35.4 
 
 
245 aa  90.1  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2058  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.61 
 
 
215 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.313982 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0540  NADH dehydrogenase subunit C  45.31 
 
 
236 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.363465  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3858  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  32.21 
 
 
162 aa  90.1  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4080  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.75 
 
 
170 aa  89.4  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.352325  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5423  NADH dehydrogenase subunit C  42.02 
 
 
481 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03360  NADH-ubiquinone oxidoreductase 30.4 kDa subunit, putative  32.93 
 
 
284 aa  89.4  5e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1322  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.21 
 
 
174 aa  89.4  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.671955  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4556  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.59 
 
 
245 aa  89.4  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3227  NADH dehydrogenase subunit C  38.58 
 
 
240 aa  89  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.754321  normal  0.0249404 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4519  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.46 
 
 
163 aa  89  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.77546  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74163  NADH-ubiquinone oxidoreductase 30.4 kDa subunit, mitochondrial precursor  43.16 
 
 
281 aa  89  6e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0353139  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1024  NADH dehydrogenase subunit C  37.61 
 
 
200 aa  89  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0804  NADH dehydrogenase subunit C  34.97 
 
 
202 aa  88.6  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.215567  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3817  NADH dehydrogenase subunit C  41.18 
 
 
291 aa  88.6  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5055  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.2 
 
 
246 aa  88.2  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0799  NADH dehydrogenase subunit C  34.97 
 
 
202 aa  88.6  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.557773  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2422  NADH dehydrogenase subunit C  34.27 
 
 
202 aa  88.2  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0963  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.55 
 
 
166 aa  88.2  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0424624  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2574  NADH dehydrogenase subunit C  37.6 
 
 
204 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0228869  normal  0.121819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>