More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1827 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1827  NADH dehydrogenase subunit C  100 
 
 
268 aa  553  1e-156  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.181589  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0140  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  59.7 
 
 
266 aa  333  2e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1527  NADH dehydrogenase subunit C  47.37 
 
 
264 aa  255  6e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.132763  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1748  NADH dehydrogenase subunit C  46.97 
 
 
263 aa  247  2e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.285742  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1562  NADH dehydrogenase subunit C  46.97 
 
 
263 aa  245  4.9999999999999997e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.145966  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1928  NADH dehydrogenase subunit C  46.97 
 
 
263 aa  245  4.9999999999999997e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.267434  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1443  NADH dehydrogenase subunit C  45.15 
 
 
264 aa  229  5e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0693614  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0183  NADH dehydrogenase subunit C  44.53 
 
 
262 aa  225  6e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4008  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.67 
 
 
161 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6243400000000003e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3924  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.91 
 
 
161 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0146493  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3136  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.47 
 
 
162 aa  112  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000631094  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1322  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.73 
 
 
174 aa  109  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.671955  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3676  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.03 
 
 
174 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00982408 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1047  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.73 
 
 
172 aa  108  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.634523  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2154  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  31.49 
 
 
230 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.818422  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1176  NADH dehydrogenase subunit C  35.42 
 
 
200 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.410937  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2514  NADH dehydrogenase subunit C  35.42 
 
 
200 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2005  NADH dehydrogenase subunit C  34.72 
 
 
200 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03360  NADH-ubiquinone oxidoreductase 30.4 kDa subunit, putative  38.71 
 
 
284 aa  103  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4063  NADH dehydrogenase subunit C  37.8 
 
 
245 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1314  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.6 
 
 
165 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2248  NADH dehydrogenase subunit C  32 
 
 
208 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0117858  normal  0.111894 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4461  NADH dehydrogenase subunit C  38.58 
 
 
245 aa  102  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1276  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  36.51 
 
 
213 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.662944  normal  0.334332 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4242  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.71 
 
 
164 aa  102  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000475487  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0743  NADH dehydrogenase subunit C  32.89 
 
 
201 aa  101  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4631  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  34.59 
 
 
209 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.247115 
 
 
-
 
NC_004310  BR0804  NADH dehydrogenase subunit C  35.88 
 
 
202 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.215567  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2422  NADH dehydrogenase subunit C  34.35 
 
 
202 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5798  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.34 
 
 
205 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323776  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0799  NADH dehydrogenase subunit C  35.88 
 
 
202 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.557773  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1024  NADH dehydrogenase subunit C  34.04 
 
 
200 aa  99.8  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3633  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.71 
 
 
187 aa  100  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3224  NADH dehydrogenase subunit C  34.44 
 
 
200 aa  99.4  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0405196  normal  0.943012 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0159  NADH-quinone oxidoreductase chain c/d  36.31 
 
 
561 aa  98.2  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3298  NADH dehydrogenase subunit C  35.16 
 
 
204 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3353  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.46 
 
 
162 aa  97.8  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000103894  normal  0.0125346 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2574  NADH dehydrogenase subunit C  35.16 
 
 
204 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0228869  normal  0.121819 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4392  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  32.33 
 
 
215 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165622  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0340  NADH dehydrogenase I, C subunit  34.75 
 
 
162 aa  97.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1557  NADH dehydrogenase subunit C  40.18 
 
 
213 aa  97.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1330  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.01 
 
 
179 aa  96.7  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2834  NADH dehydrogenase subunit C  34.76 
 
 
214 aa  96.7  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  0.125217 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2984  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  33.56 
 
 
217 aa  96.7  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401685  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_002978  WD1122  NADH dehydrogenase I, C subunit  38.58 
 
 
190 aa  96.3  5e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1151  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.65 
 
 
169 aa  96.3  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10229  NADH-ubiquinone oxidoreductase 30.4 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  32.26 
 
 
290 aa  95.9  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.048814  normal  0.463288 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1714  NADH dehydrogenase subunit C  31.82 
 
 
200 aa  95.5  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1171  NADH dehydrogenase subunit C  33.33 
 
 
207 aa  95.5  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2058  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  30.97 
 
 
215 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.313982 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1886  NADH dehydrogenase subunit C  33.59 
 
 
206 aa  94.7  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1309  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.11 
 
 
274 aa  94.7  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.620386  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5474  NADH dehydrogenase subunit C  38.1 
 
 
421 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1292  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.6 
 
 
174 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.232426  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2301  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.45 
 
 
309 aa  94.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2402  NADH dehydrogenase subunit C  32.87 
 
 
199 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0037532 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1288  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  33.59 
 
 
227 aa  94.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.924033  normal  0.845056 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5423  NADH dehydrogenase subunit C  38.1 
 
 
481 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0287  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.53 
 
 
192 aa  93.6  3e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.282798  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1357  NADH dehydrogenase subunit C  35.97 
 
 
200 aa  93.6  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.357714  normal  0.0381949 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4998  NADH dehydrogenase subunit C  38.1 
 
 
409 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0890  NADH dehydrogenase subunit C  31.58 
 
 
201 aa  92.8  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1309  NADH dehydrogenase subunit C  33.08 
 
 
215 aa  92.8  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.0849556 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2219  NADH dehydrogenase subunit C  32.03 
 
 
206 aa  92.4  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534462  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0522  NADH dehydrogenase subunit C  35.38 
 
 
250 aa  92.4  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1542  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  31.98 
 
 
179 aa  92.4  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2568  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.44 
 
 
175 aa  92  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1265  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  32.72 
 
 
202 aa  92  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1017  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  32.33 
 
 
219 aa  92  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5148  NADH dehydrogenase subunit C  38.1 
 
 
317 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4980  NADH dehydrogenase subunit C  38.1 
 
 
449 aa  91.3  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1212  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  32.81 
 
 
219 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5389  NADH dehydrogenase subunit C  38.1 
 
 
387 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.92226e-22 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1353  NADH dehydrogenase subunit C  32.81 
 
 
200 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5540  NADH dehydrogenase subunit C  38.1 
 
 
317 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2920  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  29.14 
 
 
204 aa  91.7  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1083  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  32.81 
 
 
219 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0788  NADH dehydrogenase I, C subunit  38.05 
 
 
192 aa  91.7  1e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.879269  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0780  NADH dehydrogenase subunit C  37.12 
 
 
205 aa  91.7  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.575172  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2885  NADH dehydrogenase subunit C  31.25 
 
 
204 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.419864  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3330  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  33.58 
 
 
213 aa  91.7  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.345672  normal  0.0583392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4121  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  34.93 
 
 
593 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4128  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  31.58 
 
 
215 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4556  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  34.33 
 
 
245 aa  90.9  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4561  NADH dehydrogenase subunit C  33.59 
 
 
201 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3693  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  35.51 
 
 
593 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210857  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1381  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.22 
 
 
175 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.800351  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1744  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  35.51 
 
 
593 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0734404  normal  0.199576 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1280  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.22 
 
 
175 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1663  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.03 
 
 
186 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1871  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  35.51 
 
 
593 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.200942 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0976  NADH dehydrogenase subunit C  35.04 
 
 
275 aa  90.1  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1261  NADH dehydrogenase subunit C  32.03 
 
 
200 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.841588  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3081  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.4 
 
 
171 aa  89.4  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.876993  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3306  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  34.06 
 
 
598 aa  89.4  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00420635  normal  0.503981 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03180  NADH dehydrogenase subunit C  34.62 
 
 
253 aa  89  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0959  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  33.82 
 
 
202 aa  89  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000653552 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0874  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  33.82 
 
 
202 aa  89  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.714577  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3605  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  31.88 
 
 
594 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1814  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  33.58 
 
 
598 aa  88.2  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.394715  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>