More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1211 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1211  MiaB-like tRNA modifying enzyme  100 
 
 		 495 aa  1019    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.496163 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6578  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.65 
 
 		 425 aa  316  7e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.745679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1643  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.37 
 
 		 429 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.119605  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1490  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.67 
 
 		 444 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2568  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.1 
 
 		 434 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2570  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.89 
 
 		 429 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005255 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1857  putative MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.98 
 
 		 432 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0874  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.38 
 
 		 431 aa  301  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249518 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1050  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.1 
 
 		 438 aa  301  2e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09066  putative Fe-S oxidoreductase  37.16 
 
 		 458 aa  299  8e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276137  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.9 
 
 		 441 aa  297  3e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1770  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.43 
 
 		 435 aa  296  4e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000207484  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3217  RNA modification enzyme, MiaB family  37.42 
 
 		 435 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000221997  hitchhiker  0.000000785503 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1350  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.01 
 
 		 449 aa  288  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2492  RNA modification protein  38.03 
 
 		 436 aa  288  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131013  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2316  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.12 
 
 		 427 aa  287  4e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000240078  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1333  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.37 
 
 		 449 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0807  RNA modification enzyme, MiaB family  38.08 
 
 		 450 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137858  decreased coverage  2.64257e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4429  hypothetical protein  38.08 
 
 		 450 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111241  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1737  2-methylthioadenine synthetase  36.28 
 
 		 438 aa  283  6.000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4391  hypothetical protein  37.86 
 
 		 450 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.115711  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4161  RNA modification protein  37.36 
 
 		 450 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.556145  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4443  RNA modification enzyme, MiaB family  37.86 
 
 		 450 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4209  hypothetical protein  38.03 
 
 		 450 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4047  hypothetical protein  37.86 
 
 		 450 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4057  hypothetical protein  37.86 
 
 		 450 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4535  hypothetical protein  38.03 
 
 		 450 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4332  RNA modification enzyme, MiaB family  37.86 
 
 		 450 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16472e-48 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3036  RNA modification protein  36.91 
 
 		 450 aa  282  1e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0366508  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2241  RNA modification enzyme, MiaB family  34.46 
 
 		 454 aa  281  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150078  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0150  RNA modification protein  34.73 
 
 		 434 aa  281  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.839753  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1992  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.8 
 
 		 471 aa  281  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.130467  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1164  RNA modification enzyme, MiaB family  32.29 
 
 		 431 aa  281  2e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2433  RNA modification enzyme, MiaB family  36.44 
 
 		 451 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000747616  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2053  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.65 
 
 		 450 aa  280  4e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5039  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.47 
 
 		 444 aa  280  4e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2937  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.59 
 
 		 439 aa  280  4e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.673839  normal  0.173134 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0223  hypothetical protein  35.52 
 
 		 441 aa  280  4e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.180201 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1017  RNA modification enzyme, MiaB family  36.76 
 
 		 449 aa  277  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0166  RNA modification protein  37.16 
 
 		 440 aa  277  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.684419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1634  RNA modification protein  37.16 
 
 		 448 aa  277  4e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.654078  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2224  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.98 
 
 		 442 aa  276  4e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.490633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1668  RNA modification protein  37.16 
 
 		 448 aa  277  4e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0611  RNA modification enzyme, MiaB family  36.82 
 
 		 437 aa  275  9e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.920211  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0422  RNA modification protein  35.89 
 
 		 446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0536856  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0444  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.18 
 
 		 442 aa  271  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0474351  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1144  hypothetical protein  35.65 
 
 		 448 aa  272  1e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1790  RNA modification enzyme, MiaB family  37.23 
 
 		 452 aa  272  1e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0115132  normal  0.0236064 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1711  hypothetical protein  37 
 
 		 436 aa  271  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1560  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.84 
 
 		 411 aa  271  2e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1749  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.5 
 
 		 451 aa  268  2e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000349639  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12760  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.48 
 
 		 438 aa  265  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00265105  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0588  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.39 
 
 		 450 aa  263  6.999999999999999e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2299  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.3 
 
 		 466 aa  263  6.999999999999999e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.198843  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1282  RNA modification enzyme, MiaB family  31.9 
 
 		 434 aa  260  3e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2282  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.11 
 
 		 434 aa  259  7e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4295  RNA modification enzyme, MiaB family  37.14 
 
 		 439 aa  259  8e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00281289  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0174  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.81 
 
 		 430 aa  258  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.89 
 
 		 434 aa  257  3e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0976  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.22 
 
 		 467 aa  257  4e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  0.0700259 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1996  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.91 
 
 		 451 aa  256  8e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal  0.0920131 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2722  hypothetical protein  36.43 
 
 		 435 aa  256  9e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0522  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.53 
 
 		 420 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1574  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.19 
 
 		 456 aa  252  9.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000454579  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1728  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.55 
 
 		 438 aa  252  1e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.479022  decreased coverage  0.00502843 
 
 
-
 
NC_002950  PG2221  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.08 
 
 		 444 aa  251  2e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000670309 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1187  RNA modification enzyme, MiaB family  32.44 
 
 		 446 aa  251  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0386779 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1331  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.41 
 
 		 417 aa  250  5e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000562047  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1182  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.78 
 
 		 441 aa  249  6e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0484271  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2350  RNA modification protein  38.73 
 
 		 450 aa  249  7e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787285  normal  0.113226 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0674  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.1 
 
 		 429 aa  248  3e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2087  RNA modification protein  36.43 
 
 		 458 aa  246  8e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.464184  normal  0.0294097 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1402  RNA modification enzyme, MiaB family  36.84 
 
 		 462 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1414  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.37 
 
 		 420 aa  244  3.9999999999999997e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0570  RNA modification enzyme, MiaB family  34.38 
 
 		 447 aa  243  5e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0352  RNA modification enzyme, MiaB family  35.86 
 
 		 458 aa  243  7e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.135679  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0459  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.86 
 
 		 453 aa  242  9e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.240377  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2810  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.02 
 
 		 421 aa  242  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0566  hypothetical protein  38.58 
 
 		 470 aa  241  2e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.59061  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1699  RNA modification enzyme, MiaB family  30.23 
 
 		 478 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000319842  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2852  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.26 
 
 		 444 aa  239  6.999999999999999e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2497  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.99 
 
 		 411 aa  238  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0715823  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0969  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.44 
 
 		 421 aa  238  1e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1294  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.18 
 
 		 409 aa  237  4e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2123  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  31.21 
 
 		 451 aa  233  5e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000417118  normal  0.0490217 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0298  RNA modification enzyme, MiaB family  34.1 
 
 		 431 aa  233  8.000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2775  2-methylthioadenine synthetase  37.54 
 
 		 422 aa  232  1e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.254506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3574  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.25 
 
 		 423 aa  231  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0412  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.34 
 
 		 437 aa  229  6e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.908018  normal  0.498454 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1807  RNA modification enzyme, MiaB family  31.44 
 
 		 451 aa  228  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000210311  decreased coverage  0.000315868 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0319  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.15 
 
 		 419 aa  228  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0926  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.43 
 
 		 427 aa  228  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.084888  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.73 
 
 		 434 aa  227  3e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3229  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.88 
 
 		 416 aa  227  4e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0152656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0673  RNA modification enzyme, MiaB family  34.5 
 
 		 496 aa  227  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.323598 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_835  tRNA modification enzyme, MiaB family  31.69 
 
 		 416 aa  226  6e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.258618  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0252  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.77 
 
 		 423 aa  226  9e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0774  RNA modification enzyme, MiaB family  32.09 
 
 		 455 aa  225  1e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0255462  normal  0.23064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1442  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.12 
 
 		 499 aa  226  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0783  RNA modification protein  30.94 
 
 		 480 aa  225  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>