81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1181 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1181  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  483  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2464  hypothetical protein  47.5 
 
 
225 aa  192  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.96143  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2347  hypothetical protein  46.31 
 
 
274 aa  190  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3454  hypothetical protein  40.18 
 
 
231 aa  180  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0652967 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3182  protein of unknown function DUF500  42.5 
 
 
231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00271235  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1078  protein of unknown function DUF500  42 
 
 
231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64686e-30 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3108  hypothetical protein  42.34 
 
 
230 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1635  hypothetical protein  41.31 
 
 
257 aa  159  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00848244  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3990  protein of unknown function DUF500  44.44 
 
 
299 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.571133 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0733  hypothetical protein  41.87 
 
 
233 aa  155  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000336107  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2146  protein of unknown function DUF500  41.12 
 
 
222 aa  154  8e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0013338  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1665  hypothetical protein  39.91 
 
 
301 aa  149  5e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2073  protein of unknown function DUF500  40 
 
 
222 aa  148  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000191857 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03841  hypothetical protein  44.63 
 
 
297 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1737  hypothetical protein  39.44 
 
 
301 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4764  hypothetical protein  37.44 
 
 
260 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00104284  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0540  protein of unknown function DUF500  38.54 
 
 
233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1196  hypothetical protein  33.82 
 
 
209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3682  hypothetical protein  35.11 
 
 
219 aa  119  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0328  protein of unknown function DUF500  32.24 
 
 
225 aa  116  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00857832 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0638  hypothetical protein  33.67 
 
 
225 aa  115  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.608568  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59246  predicted protein  37.43 
 
 
399 aa  107  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.518781 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04168  DUF500 and SH3 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07880)  34.15 
 
 
410 aa  104  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4192  protein of unknown function DUF500  36.67 
 
 
236 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0886  protein of unknown function DUF500  31.45 
 
 
221 aa  102  6e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0538  protein of unknown function DUF500  33.7 
 
 
230 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0432  hypothetical protein  30.32 
 
 
242 aa  99.8  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1450  protein of unknown function DUF500  29.69 
 
 
230 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.552801  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3380  hypothetical protein  30.36 
 
 
327 aa  92.8  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3410  protein of unknown function DUF500  32.6 
 
 
279 aa  92  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01250  conserved hypothetical protein  34.44 
 
 
242 aa  91.7  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0234  hypothetical protein  29.52 
 
 
217 aa  90.1  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0232  hypothetical protein  29.52 
 
 
217 aa  90.1  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.111994  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3834  protein of unknown function DUF500  30.73 
 
 
229 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1499  hypothetical protein  26.37 
 
 
228 aa  90.1  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10288  conserved hypothetical protein  32.67 
 
 
362 aa  82.8  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02236  DUF500 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07310)  29.38 
 
 
604 aa  80.1  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217493  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2385  protein of unknown function DUF500  32.92 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440615  normal  0.201549 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48746  predicted protein  31.68 
 
 
556 aa  78.2  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00830  conserved hypothetical protein  33.15 
 
 
663 aa  68.2  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1086  hypothetical protein  25 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0525  putative secreted protein  28.12 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0732  putative secreted protein  28.3 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1381  hypothetical protein  26.28 
 
 
221 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0802704  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1399  hypothetical protein  29.28 
 
 
195 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44183  predicted protein  26.56 
 
 
1316 aa  60.1  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125536  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3083  hypothetical protein  31.62 
 
 
231 aa  60.1  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3102  putative lipoprotein  31.62 
 
 
198 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0926165  normal  0.0477167 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1331  hypothetical protein  28.06 
 
 
188 aa  58.9  0.00000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0503  hypothetical protein  25.17 
 
 
194 aa  58.9  0.00000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1878  putative lipoprotein  28.31 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1385  hypothetical protein  25.5 
 
 
220 aa  55.8  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1692  hypothetical protein  31.69 
 
 
195 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5337  putative lipoprotein  31.34 
 
 
195 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  0.0273099 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2123  putative lipoprotein  31.16 
 
 
194 aa  53.1  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0746601 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0772  putative lipoprotein  32.61 
 
 
196 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.661854  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4453  putative lipoprotein  31.88 
 
 
196 aa  52  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00120805  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2079  putative lipoprotein  26.51 
 
 
205 aa  52  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_006686  CND04590  actin filament organization-related protein, putative  33.58 
 
 
522 aa  51.2  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0392  hypothetical protein  30.48 
 
 
187 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1757  putative lipoprotein  26.51 
 
 
205 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0708212  normal  0.314425 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2882  putative lipoprotein  27.34 
 
 
192 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1705  hypothetical protein  29.5 
 
 
195 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.255734  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4205  hypothetical protein  30.48 
 
 
188 aa  48.9  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4203  putative lipoprotein  28.57 
 
 
195 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3821  hypothetical protein  31.16 
 
 
196 aa  45.4  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370045  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2325  twin-arginine translocation pathway signal  28.74 
 
 
191 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00153358  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2057  twin-arginine translocation pathway signal  21.35 
 
 
187 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2091  twin-arginine translocation pathway signal  23.97 
 
 
186 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0577412  hitchhiker  0.0000798401 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1949  putative lipoprotein  29.37 
 
 
195 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0421  hypothetical protein  25.71 
 
 
194 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0010  hypothetical protein  27.68 
 
 
186 aa  43.5  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.019528  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1051  putative lipoprotein  28.26 
 
 
195 aa  42.4  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670756  normal  0.850413 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2253  putative lipoprotein  28.15 
 
 
195 aa  42.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176921  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2672  hypothetical protein  27.42 
 
 
183 aa  42  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0481  putative lipoprotein  26.14 
 
 
194 aa  42  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3716  hypothetical protein  28.15 
 
 
194 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663624  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1497  hypothetical protein  28.57 
 
 
185 aa  42  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.92763  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4555  hypothetical protein  28.15 
 
 
194 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.162066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3808  hypothetical protein  28.15 
 
 
194 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5534  hypothetical protein  25.74 
 
 
194 aa  41.6  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>