76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4158 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011879  Achl_4158  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 225 aa  428  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.904391 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  40.4 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0875  Type II secretory pathway prepilin signal peptidase PulO and related peptidase  41.18 
 
 		 324 aa  68.6  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.141711 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2954  peptidase A24A prepilin type IV  38.16 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000298652  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3020  peptidase A24A domain protein  36.5 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  30.06 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3210  peptidase A24A, prepilin type IV  39.72 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0842795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  35.57 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.57 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1698  peptidase A24A prepilin type IV  35.11 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194935  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0501  peptidase A24A prepilin type IV  37.12 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1143  type IV prepilin leader peptidase  30.67 
 
 		 300 aa  55.1  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00336201  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1089  hypothetical protein  35.81 
 
 		 268 aa  55.1  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2211  peptidase A24A prepilin type IV  46.15 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144961  normal  0.829698 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1173  peptidase A24A domain-containing protein  29.63 
 
 		 244 aa  52.4  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000679312  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0200  peptidase A24A prepilin type IV  33.12 
 
 		 166 aa  51.6  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.267087 
 
 
-
 
NC_002936  DET1362  type IV prepilin leader peptidase family protein  30.71 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000297795  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1177  peptidase A24A, prepilin type IV  38.36 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632906  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  37.01 
 
 		 288 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2018  peptidase A24A prepilin type IV  34.35 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0479  prepilin peptidase  32.26 
 
 		 303 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.508512  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5490  prepilin peptidase  32.35 
 
 		 294 aa  49.7  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16559  normal  0.184138 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  31.48 
 
 		 302 aa  49.3  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  33.58 
 
 		 303 aa  49.3  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  32.72 
 
 		 291 aa  49.3  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0504  prepilin peptidase  32.26 
 
 		 303 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.613081  normal  0.615675 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  31.58 
 
 		 304 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  32.37 
 
 		 250 aa  48.9  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  32.57 
 
 		 288 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  32.64 
 
 		 318 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  32 
 
 		 266 aa  47.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  31.58 
 
 		 308 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  40 
 
 		 261 aa  47.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  31.58 
 
 		 308 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1314  peptidase A24A domain-containing protein  39.38 
 
 		 262 aa  47.8  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.410004  normal  0.0147639 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  32 
 
 		 266 aa  47.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2657  prepilin peptidase  32.64 
 
 		 309 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2919  peptidase A24A, prepilin type IV  37.16 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07790  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  36.64 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.409927  normal  0.37383 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0843  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.39 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120524  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  32.89 
 
 		 304 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  37.32 
 
 		 275 aa  47  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  33.33 
 
 		 287 aa  46.6  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4449  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme PilD  31.85 
 
 		 301 aa  46.2  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0062  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.52 
 
 		 299 aa  46.6  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0184  peptidase A24A, prepilin type IV  30.26 
 
 		 166 aa  45.8  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0397814  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2321  peptidase A24A prepilin type IV  35.61 
 
 		 145 aa  45.8  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  34.97 
 
 		 283 aa  45.8  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  32.67 
 
 		 283 aa  45.4  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2273  signal peptidase type IV  24.16 
 
 		 247 aa  45.1  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1248  peptidase A24A prepilin type IV  36.36 
 
 		 186 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.43 
 
 		 288 aa  44.7  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0768  prepilin peptidase  31.16 
 
 		 283 aa  44.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.312939  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2571  Type IV leader peptidase family protein  24.16 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.45 
 
 		 283 aa  44.7  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3661  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.66 
 
 		 303 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  32 
 
 		 289 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6538  prepilin peptidase  34.13 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  hitchhiker  0.00290802 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0546  prepilin peptidase  30.66 
 
 		 303 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204548  normal  0.0306295 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  43.94 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0094  prepilin peptidase  30.66 
 
 		 303 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  28.65 
 
 		 300 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0576  prepilin peptidase  30.66 
 
 		 303 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251238  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2904  prepilin peptidase  32.45 
 
 		 280 aa  43.5  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2022  prepilin peptidase  34.76 
 
 		 296 aa  43.1  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0169642  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  31.43 
 
 		 303 aa  42.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0149  peptidase A24A domain-containing protein  29.65 
 
 		 306 aa  42.7  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0378  peptidase A24A prepilin type IV  30.97 
 
 		 225 aa  42.4  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0378  peptidase A24A prepilin type IV  30.97 
 
 		 225 aa  42  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.735955 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1014  prepilin peptidase  30.14 
 
 		 280 aa  42  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3259  prepilin peptidase  30.14 
 
 		 301 aa  42  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000482568  hitchhiker  0.0000000000000925794 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3529  type 4 prepilin peptidase  30.97 
 
 		 225 aa  42  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.645409  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0963  type IV prepilin peptidase  30.14 
 
 		 277 aa  42  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2411  peptidase A24A, prepilin type IV  31.69 
 
 		 242 aa  42.4  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.322927  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3921  prepilin peptidase  30.2 
 
 		 294 aa  42  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  26.58 
 
 		 274 aa  41.6  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>