More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3524 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3524  glutamine amidotransferase class-II  100 
 
 
302 aa  610  9.999999999999999e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0234475 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5261  glutamine amidotransferase, class-II  55.15 
 
 
298 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.228434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4893  glutamine amidotransferase, class-II  55.15 
 
 
298 aa  322  4e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4982  glutamine amidotransferase, class-II  55.15 
 
 
298 aa  322  4e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1299  glutamine amidotransferase, class-II  54.79 
 
 
302 aa  322  6e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0375941  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4806  glutamine amidotransferase class-II  54.49 
 
 
298 aa  320  9.999999999999999e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5510  glutamine amidotransferase, class-II  53.8 
 
 
302 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623211  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1575  glutamine amidotransferase class-II  50.17 
 
 
316 aa  292  4e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1656  glutamine amidotransferase class-II  49.33 
 
 
311 aa  290  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.670859  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1938  glutamine amidotransferase class-II  49.33 
 
 
311 aa  290  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210707  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3467  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  48.7 
 
 
299 aa  285  5e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.836717  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2583  glutamine amidotransferase, class-II protein  47.74 
 
 
306 aa  285  9e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0230258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2274  glutamine amidotransferase, class-II  48.17 
 
 
306 aa  285  9e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0107042 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2248  glutamine amidotransferase class-II  47.23 
 
 
301 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.280725 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1942  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  49.5 
 
 
297 aa  279  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1346  glutamine amidotransferase, class-II  47.4 
 
 
299 aa  278  7e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1870  putative glutamine amidotransferase  47.35 
 
 
308 aa  278  7e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117624  normal  0.828633 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5638  glutamine amidotransferase class-II  47.19 
 
 
301 aa  277  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.52916  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6575  glutamine amidotransferase class-II  46.86 
 
 
302 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0505165 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4695  glutamine amidotransferase class-II  48.01 
 
 
299 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.903048 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4810  glutamine amidotransferase class-II  51 
 
 
297 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  hitchhiker  0.00206329 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1699  glutamine amidotransferase class-II  44.37 
 
 
296 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3291  glutamine amidotransferase class-II  48.84 
 
 
301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5749  amidophosphoribosyltransferase  46.56 
 
 
301 aa  273  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6008  glutamine amidotransferase class-II  46.51 
 
 
301 aa  268  5.9999999999999995e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362161  decreased coverage  0.00354269 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0457  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  42.38 
 
 
298 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.598323  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2632  glutamine amidotransferase class-II  46.58 
 
 
299 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1138  glutamine amidotransferase, class-II  45.89 
 
 
298 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.16804 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5919  glutamine amidotransferase class-II  43.65 
 
 
302 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3033  glutamine amidotransferase, class-II  43.56 
 
 
302 aa  252  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2499  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  42.19 
 
 
305 aa  252  5.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0167  glutamine amidotransferase class-II  40.85 
 
 
302 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  29.89 
 
 
488 aa  88.6  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0558  glutamine amidotransferase, class-II  28.5 
 
 
374 aa  87.4  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0439  amidophosphoribosyltransferase  29.7 
 
 
459 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  31.28 
 
 
465 aa  83.6  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0468  amidophosphoribosyltransferase  27.88 
 
 
456 aa  83.2  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.350158  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0536  glutamine amidotransferase class-II  27.73 
 
 
372 aa  82.8  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0522  glutamine amidotransferase, class-II  27.73 
 
 
395 aa  82.4  0.000000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0396  amidophosphoribosyltransferase  28.48 
 
 
459 aa  82.4  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3044  amidophosphoribosyltransferase  29.79 
 
 
478 aa  82  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1523  amidophosphoribosyltransferase  28.48 
 
 
459 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0119394  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1778  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  32.93 
 
 
602 aa  81.3  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.285931  normal  0.0291099 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0980  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  34.13 
 
 
599 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2026  glutamine amidotransferase, class-II  28.14 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805771  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  31.21 
 
 
480 aa  80.1  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5427  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  38.02 
 
 
611 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.15944  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0228  amidophosphoribosyltransferase  29.38 
 
 
478 aa  79.3  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.629689  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1160  amidophosphoribosyltransferase  35.29 
 
 
503 aa  78.2  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.904998  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0230  amidophosphoribosyltransferase  30.54 
 
 
463 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0884272  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1236  hypothetical protein  26.91 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1815  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  27.4 
 
 
364 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1300  glutamine amidotransferase class-II  24.18 
 
 
361 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0772  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  37.12 
 
 
608 aa  77.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1309  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  35.33 
 
 
605 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0983  amidophosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
490 aa  78.2  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.592161  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5481  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  32.56 
 
 
605 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.536522  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3627  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  32.56 
 
 
605 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3498  amidophosphoribosyltransferase  30.17 
 
 
477 aa  77  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349457  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0780  glutamine amidotransferase, class-II  28.18 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0619068  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0846  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  35.33 
 
 
605 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1327  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  35.33 
 
 
605 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  28.8 
 
 
487 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4125  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  37.06 
 
 
609 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.513895  normal  0.539293 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  25.68 
 
 
474 aa  77  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0292  amidophosphoribosyltransferase  29.35 
 
 
459 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  30 
 
 
487 aa  76.6  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4892  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  37.06 
 
 
609 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.664271  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0672  amidophosphoribosyltransferase  34.38 
 
 
475 aa  76.6  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.546073  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  36.36 
 
 
609 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0665  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  26.87 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1753  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  26.24 
 
 
373 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2491  glutamine amidotransferase, class-II  28.36 
 
 
371 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0824  amidophosphoribosyltransferase  28.96 
 
 
488 aa  76.3  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5409  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  41.35 
 
 
611 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323982  hitchhiker  0.00848262 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5291  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  41.35 
 
 
611 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268199  normal  0.456401 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4012  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  37.06 
 
 
609 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0405163  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0953  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.52 
 
 
599 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.590452  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2179  amidophosphoribosyltransferase  30 
 
 
462 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4097  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  37.19 
 
 
609 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.2941 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3920  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  37.06 
 
 
609 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121785  normal  0.0336662 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1693  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  33.54 
 
 
600 aa  75.5  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.457589  normal  0.0574833 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4192  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  37.19 
 
 
609 aa  75.5  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4238  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  37.19 
 
 
609 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2407  amidophosphoribosyltransferase  28.4 
 
 
487 aa  74.7  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.848054  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0507  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  38.71 
 
 
612 aa  74.3  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00435471 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  29.94 
 
 
469 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1000  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  31.1 
 
 
602 aa  74.7  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4244  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  37.19 
 
 
609 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.517855  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0545  glutamine amidotransferase class-II  26.94 
 
 
369 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405824 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1419  amidophosphoribosyltransferase  30.11 
 
 
461 aa  75.1  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0127132  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5196  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  36.44 
 
 
611 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.118188  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3944  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  37.19 
 
 
609 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13473  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  39.32 
 
 
624 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0148882  hitchhiker  0.00269614 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3743  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  37.76 
 
 
609 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4136  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  36.09 
 
 
609 aa  74.7  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0361576  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4265  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  37.19 
 
 
609 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03557  hypothetical protein  37.19 
 
 
609 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1766  amidophosphoribosyltransferase  30.53 
 
 
488 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0501857 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3639  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  37.21 
 
 
609 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000255668  normal  0.139839 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>