222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2613 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2613  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 207 aa  411  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00726257 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2904  transcriptional regulator  66.01 
 
 		 207 aa  241  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1388  transcriptional regulator, MerR family  30.95 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3466  transcriptional regulator, MerR family  30.19 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0193337  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2399  transcriptional regulator, MerR family  29.9 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562399  decreased coverage  0.00011903 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1430  transcriptional regulator, MerR family  30.32 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130007  normal  0.485128 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05650  predicted transcriptional regulator  30.15 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1131  transcriptional regulator, MerR family  31.37 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0349381  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1748  transcriptional regulator, MerR family  28.4 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17422  normal  0.0209835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1547  transcriptional regulator, MerR family  45.59 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2041  putative transcriptional regulator, MerR family  31.48 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3179  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.531372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0557  MerR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 224 aa  62  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000848982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2692  regulatory protein, MerR  28.99 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0457116  normal  0.169515 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0210  putative transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.024863  hitchhiker  0.00385009 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  38.89 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0102  transcriptional regulator  30.52 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.246242  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0028  transcriptional regulator, MerR family  34.72 
 
 		 143 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 137 aa  57  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3230  transcriptional regulator, MerR family  32.73 
 
 		 249 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129557  normal  0.789887 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46190  cadmium responsive transcriptional regulator, merR family  39.73 
 
 		 152 aa  57.4  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719382  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1547  MerR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0186  MerR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0070729  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  43.84 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  38.89 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  38.89 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2975  MerR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.501139  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0151  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  32.88 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636208  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3334  MerR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1564  MerR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3947  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  32.88 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4020  transcriptional regulator CadR  32.88 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3037  MerR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5140  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 147 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5193  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 147 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1155  transcriptional regulator, MerR family  38.27 
 
 		 128 aa  54.7  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0258201  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 147 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3291  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  32.88 
 
 		 143 aa  54.3  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3444  transcriptional regulator, MerR family  34.25 
 
 		 144 aa  54.3  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0123  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 136 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 135 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0113  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0325  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 147 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.634832 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1336  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  53.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200551  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  28.57 
 
 		 129 aa  53.9  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5372  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 149 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4438  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  32.29 
 
 		 186 aa  52.4  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1407  MerR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 134 aa  52.4  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1596  transcriptional regulator, MerR family  28.18 
 
 		 237 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  36.49 
 
 		 143 aa  52  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0137  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 143 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2932  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 143 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327003  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0123  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 143 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169164  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3303  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 143 aa  51.6  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 144 aa  51.2  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0017  transcriptional regulator, MerR family  29.17 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1858  MerR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 226 aa  50.8  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.14067  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  27.82 
 
 		 129 aa  50.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  34.44 
 
 		 129 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3563  transcriptional regulator, MerR family  30.56 
 
 		 143 aa  50.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1103  MerR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 135 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1117  MerR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 135 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2902  MerR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 135 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1604  MerR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 135 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2912  MerR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 135 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0392  MerR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 135 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0882  MerR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 135 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.656142 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  29.17 
 
 		 146 aa  50.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 146 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0470  putative transcriptional regulator, MerR family  34.15 
 
 		 133 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0894  MerR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 135 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0963  DNA-binding transcriptional regulator CueR  35 
 
 		 136 aa  50.1  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.55262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0194  MerR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 135 aa  50.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0220  MerR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 135 aa  50.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4002  MerR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 135 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1402  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 133 aa  50.1  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 137 aa  49.7  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  35.62 
 
 		 133 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  34.04 
 
 		 152 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0122  MerR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 143 aa  49.3  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  34.04 
 
 		 152 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 146 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  34.21 
 
 		 129 aa  48.9  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 152 aa  48.9  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00438  DNA-binding transcriptional activator of copper-responsive regulon genes  32.5 
 
 		 135 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3123  transcriptional regulator, MerR family  32.5 
 
 		 135 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.856714  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0586  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.5 
 
 		 135 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.775911 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0566  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.5 
 
 		 135 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0526  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.5 
 
 		 135 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0422  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.5 
 
 		 135 aa  48.9  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00443  hypothetical protein  32.5 
 
 		 135 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3129  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.5 
 
 		 135 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.943376  hitchhiker  0.0000753695 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1394  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  34.72 
 
 		 151 aa  48.5  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  34.72 
 
 		 151 aa  48.5  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0530  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.5 
 
 		 135 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>