More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1106 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1106  ABC transporter related  100 
 
 
314 aa  619  1e-176  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1039  ABC transporter related  92.47 
 
 
304 aa  486  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0313  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.62 
 
 
332 aa  242  7e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5119  putative ABC transporter ATP-binding  48.09 
 
 
327 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal  0.157884 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0434  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.59 
 
 
334 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.542128  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0419  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.59 
 
 
334 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0195088  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3722  ABC transporter related  48.48 
 
 
535 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00680128  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  49.43 
 
 
619 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  50.57 
 
 
537 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  48.48 
 
 
536 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4131  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.86 
 
 
337 aa  237  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5352  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  41.77 
 
 
350 aa  237  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0869  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  48.28 
 
 
343 aa  237  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0416  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.56 
 
 
345 aa  237  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.804704 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0907  putative ATP-binding component of dipeptide transport system  46.39 
 
 
318 aa  236  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000823752  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0614  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.53 
 
 
345 aa  236  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.56 
 
 
540 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.59 
 
 
342 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2365  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.8 
 
 
338 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.115358  normal  0.0275961 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2298  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.98 
 
 
361 aa  235  6e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000138811  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3924  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.33 
 
 
329 aa  235  7e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0138701 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  46.23 
 
 
599 aa  235  7e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4369  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.53 
 
 
336 aa  235  8e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal  0.634457 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3091  nickel ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.19 
 
 
548 aa  235  9e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00987515  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  48.46 
 
 
530 aa  235  9e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5509  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  46.01 
 
 
347 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.435754 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29680  ABC transporter, ATP binding component  48.7 
 
 
537 aa  234  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0246021  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2961  ABC transporter  48.92 
 
 
547 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3723  ABC transporter related  50.19 
 
 
545 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1351  ABC transporter related  45.96 
 
 
544 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  45.91 
 
 
568 aa  233  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  49.43 
 
 
542 aa  233  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0292  ABC transporter, ATPase subunit  48.66 
 
 
545 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  49.24 
 
 
611 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0382  ABC transporter related  48.28 
 
 
543 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  45.08 
 
 
563 aa  232  7.000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1848  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  45.21 
 
 
341 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.980992  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2965  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.63 
 
 
338 aa  231  9e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0868  dipeptide transport ATP-binding protein DppD  44.77 
 
 
336 aa  231  9e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  47.35 
 
 
536 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0941  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.82 
 
 
329 aa  231  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.791517  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  47.91 
 
 
612 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2969  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.74 
 
 
341 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0804764  normal  0.623944 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  46.07 
 
 
549 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1998  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.88 
 
 
333 aa  230  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.120304  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4393  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  44.19 
 
 
338 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4234  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.82 
 
 
338 aa  230  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4246  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.19 
 
 
338 aa  230  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18700  ABC transporter, ATP binding component  49.44 
 
 
542 aa  231  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106187  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4733  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  44.19 
 
 
338 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.42 
 
 
674 aa  230  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.734122 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3115  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.83 
 
 
671 aa  231  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.426861  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4611  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.82 
 
 
338 aa  230  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1146  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  44.81 
 
 
342 aa  230  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.323448 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2823  ABC transporter related  45.9 
 
 
619 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0582166  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  48.11 
 
 
543 aa  230  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1163  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.42 
 
 
329 aa  230  3e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0503612  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  45.52 
 
 
615 aa  229  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  48.46 
 
 
543 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  47.96 
 
 
537 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3821  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.8 
 
 
332 aa  229  5e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.282595  normal  0.751344 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  46.21 
 
 
550 aa  228  7e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1864  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.35 
 
 
350 aa  228  7e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429685  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  46.69 
 
 
541 aa  228  9e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  46.59 
 
 
611 aa  228  9e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1852  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45 
 
 
325 aa  228  9e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  45.61 
 
 
553 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2178  ABC transporter-like  48.11 
 
 
536 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  47.17 
 
 
537 aa  228  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.15 
 
 
357 aa  227  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  46.98 
 
 
611 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  47.13 
 
 
531 aa  227  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1061  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.16 
 
 
330 aa  227  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  45.59 
 
 
575 aa  227  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0529  ABC transporter related  50.19 
 
 
533 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.328091 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  47.19 
 
 
539 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2209  ABC transporter related  49.81 
 
 
542 aa  226  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326804  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1933  ABC transporter related  49.81 
 
 
542 aa  226  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120655  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  48.31 
 
 
543 aa  226  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4210  ABC transporter related  47.89 
 
 
545 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.355372  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0888  ABC transporter related  47.15 
 
 
613 aa  226  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0193  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.66 
 
 
343 aa  226  3e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  43.96 
 
 
576 aa  226  4e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1915  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.13 
 
 
338 aa  226  4e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0882054  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4579  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein  45.08 
 
 
325 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170967  hitchhiker  0.00444636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  46.97 
 
 
541 aa  226  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  45.32 
 
 
573 aa  226  4e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  44.21 
 
 
586 aa  226  5.0000000000000005e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1496  ABC transporter related  44.24 
 
 
532 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04930  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.45 
 
 
335 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00159941  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.25 
 
 
611 aa  226  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  44.44 
 
 
565 aa  226  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00642  ABC transporter ATPase component  44.27 
 
 
285 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3475  ABC transporter related  49.24 
 
 
536 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1578  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.91 
 
 
339 aa  226  5.0000000000000005e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  46.95 
 
 
545 aa  226  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  46.72 
 
 
571 aa  226  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0272  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  44.4 
 
 
319 aa  225  7e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3292  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.3 
 
 
341 aa  225  7e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3271  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.72 
 
 
335 aa  225  7e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>