More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3463 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3463  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 305 aa  586  1e-166  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.600683 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4358  transcriptional regulator, LysR family  61.49 
 
 		 289 aa  333  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261709  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3079  LysR family transcriptional regulator  54.28 
 
 		 345 aa  288  5.0000000000000004e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2879  LysR family transcriptional regulator  54.15 
 
 		 292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4073  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 322 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3809  LysR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 291 aa  264  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.22688  hitchhiker  0.00755616 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0352  LysR family transcriptional regulator  48.97 
 
 		 297 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0627  transcriptional regulator, LysR family  48.83 
 
 		 295 aa  259  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.133406  normal  0.406767 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4176  LysR family transcriptional regulator  51.19 
 
 		 290 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4698  LysR family transcriptional regulator  51.19 
 
 		 290 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.981446 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0919  LysR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 290 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3575  LysR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 290 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441848  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5490  LysR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 290 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.19276 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4792  LysR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 290 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0718  LysR family transcriptional regulator  46.95 
 
 		 294 aa  232  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.235527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4630  transcriptional regulator, LysR family  45.21 
 
 		 290 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0185  LysR family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0482  transcriptional regulator, LysR family  30.69 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0438  transcriptional regulator, LysR family  30.69 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0717  transcriptional regulator, LysR family  36.13 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1284  LysR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 283 aa  132  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32576  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0384  LysR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 316 aa  132  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2337  LysR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2757  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49640  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 300 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.097129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4236  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 309 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.999782  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5774  transcriptional regulator LysR family  30.77 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3226  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60856 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0745  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 287 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5304  transcriptional regulator, LysR family  34.56 
 
 		 289 aa  122  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0301  LysR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 294 aa  122  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1467  LysR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21400  Transcriptional regulator, LysR family  31.97 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2346  transcriptional regulator, LysR family  30.53 
 
 		 293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1273  transcriptional regulator, LysR family  28.72 
 
 		 309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0230632  normal  0.266535 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2626  transcriptional regulator, LysR family  31.23 
 
 		 290 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.117522  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2002  transcriptional regulator, LysR family  34.31 
 
 		 292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4590  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1647  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 289 aa  119  6e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1683  LysR substrate-binding  34.31 
 
 		 292 aa  119  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5238  LysR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0877  transcriptional regulator, LysR family  32.85 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5621  LysR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5448  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 288 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.778769 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0070  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2713  LysR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 281 aa  115  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0696841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2665  transcriptional regulator LrhA  30.26 
 
 		 312 aa  115  8.999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0194806  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3428  transcriptional regulator LrhA  30.26 
 
 		 312 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0286077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2582  transcriptional regulator LrhA  30.26 
 
 		 312 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.210285  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4898  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 288 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02214  DNA-binding transcriptional repressor of flagellar, motility and chemotaxis genes  29.89 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1367  transcriptional regulator, LysR family  30.26 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.189941  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2444  transcriptional regulator LrhA  29.89 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.531383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02174  hypothetical protein  29.89 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2391  transcriptional regulator, LysR family  32.64 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.586074 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2438  transcriptional regulator LrhA  29.89 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.340717  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1363  LysR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.556937 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0765  LysR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4609  LysR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46805  hitchhiker  0.000318313 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2995  LysR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2551  transcriptional regulator, LysR family  30.21 
 
 		 311 aa  113  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.405251  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1393  transcriptional regulator, LysR family  30.21 
 
 		 309 aa  113  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1845  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102688 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0106  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2046  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 287 aa  112  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396353  normal  0.96684 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3167  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 283 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2469  HTH-type transcriptional regulator PecT  30.63 
 
 		 312 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000182505  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2514  HTH-type transcriptional regulator PecT  30.63 
 
 		 312 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00051335  normal  0.704874 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1578  LysR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 367 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.170227  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2676  HTH-type transcriptional regulator PecT  30.63 
 
 		 312 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00370653  normal  0.784227 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3534  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 293 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154456  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3040  LysR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 282 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2239  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 293 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0160  transcriptional regulator, LysR family  32.53 
 
 		 291 aa  112  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1319  transcriptional regulator, LysR family  33.66 
 
 		 299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.131151 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1867  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1448  LysR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2558  HTH-type transcriptional regulator PecT  30.28 
 
 		 312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000175067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0618  LysR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 286 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1252  LysR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 286 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1478  LysR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 286 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3573  hypothetical protein  32.34 
 
 		 288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0535  LysR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 286 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.605661  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7471  LysR family transcriptional regulator  32.36 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3081  LysR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2833  LysR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000597917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1911  LysR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1817  LysR-family transcriptional regulatory protein  28.32 
 
 		 309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2773  transcriptional regulator, LysR family  30.07 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.785949  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1452  transcriptional regulator LrhA  28.32 
 
 		 309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1559  LysR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.30474  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2354  LysR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2053  LysR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4409  LysR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1238  LysR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.804975  normal  0.249608 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0785  LysR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1156  LysR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.243733 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4450  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3319  transcriptional regulator, LysR family  30.88 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1266  LysR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>