129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1426 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1426  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114392  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1874  hypothetical protein  58.29 
 
 
230 aa  259  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.426873  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1172  hypothetical protein  63.68 
 
 
225 aa  255  4e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1092  hypothetical protein  63.68 
 
 
225 aa  254  6e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2305  hypothetical protein  55.45 
 
 
240 aa  247  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226519  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5017  hypothetical protein  62.26 
 
 
227 aa  247  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0329961  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2189  hypothetical protein  53.49 
 
 
230 aa  239  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2606  hypothetical protein  58.77 
 
 
231 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.328129  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0078  hypothetical protein  63.33 
 
 
226 aa  222  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2866  hypothetical protein  54.76 
 
 
224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1994  hypothetical protein  48.54 
 
 
228 aa  196  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.0755964 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1153  hypothetical protein  44.44 
 
 
211 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.584457  normal  0.680719 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1061  hypothetical protein  43.96 
 
 
211 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1217  hypothetical protein  43.96 
 
 
211 aa  165  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.468458  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5111  hypothetical protein  43.14 
 
 
209 aa  155  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1465  hypothetical protein  42.65 
 
 
209 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.779591  normal  0.530384 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2236  hypothetical protein  45.02 
 
 
209 aa  152  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2084  hypothetical protein  42.51 
 
 
210 aa  148  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.54263  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1343  hypothetical protein  45.59 
 
 
209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2352  hypothetical protein  45.59 
 
 
209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1833  hypothetical protein  45.59 
 
 
209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.542557  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0064  hypothetical protein  45.59 
 
 
209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0152199  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2188  hypothetical protein  45.59 
 
 
209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2226  hypothetical protein  45.59 
 
 
209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628987  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1105  hypothetical protein  45.59 
 
 
209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58844  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2104  hypothetical protein  39.81 
 
 
210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155283  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6269  hypothetical protein  42.65 
 
 
209 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.451549  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1810  hypothetical protein  42.65 
 
 
209 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1834  hypothetical protein  42.65 
 
 
209 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.635423 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2539  hypothetical protein  39.81 
 
 
209 aa  142  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0300828  hitchhiker  0.00124926 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1596  hypothetical protein  39.34 
 
 
209 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0668016  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1418  hypothetical protein  41.18 
 
 
208 aa  141  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0108097 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1748  hypothetical protein  41.67 
 
 
209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1721  hypothetical protein  41.67 
 
 
209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  0.434202 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2375  hypothetical protein  38.92 
 
 
212 aa  138  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.526802  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0666  hypothetical protein  39.44 
 
 
219 aa  138  6e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2983  putative transmembrane protein  39.52 
 
 
212 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1289  hypothetical protein  38.5 
 
 
219 aa  129  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0596  hypothetical protein  35.85 
 
 
213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.383921 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3388  hypothetical protein  39.23 
 
 
214 aa  115  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1616  hypothetical protein  35.92 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000798521 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4599  hypothetical protein  34.54 
 
 
213 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2856  hypothetical protein  32.86 
 
 
218 aa  78.6  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.750067  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02979  putative membrane-associated protein with TPR-like domain  35.71 
 
 
206 aa  77.8  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.364491  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1436  hypothetical protein  34.02 
 
 
213 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279934  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1500  hypothetical protein  25.47 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1250  hypothetical protein  34.02 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.198007  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1483  hypothetical protein  25.47 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4250  hypothetical protein  30.24 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40270  YfgM-like protein  33.51 
 
 
214 aa  75.5  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.118551  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2047  tetratricopeptide repeat family protein  27.37 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.732509  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1392  hypothetical protein  27.81 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1331  hypothetical protein  27.81 
 
 
206 aa  69.7  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0855  hypothetical protein  31.44 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0885  hypothetical protein  31.44 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.17332  normal  0.505215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0898  hypothetical protein  30.93 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.930556  hitchhiker  0.00000414617 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0736  Protein of unknown function DUF2133  29.73 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.78252  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1313  hypothetical protein  32.14 
 
 
214 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14900  hypothetical protein  32.14 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4323  hypothetical protein  32.11 
 
 
213 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000219277 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1292  tetratricopeptide TPR_4  30.56 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0753311  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0623  hypothetical protein  29.65 
 
 
213 aa  63.9  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1787  hypothetical protein  31.5 
 
 
208 aa  63.9  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1358  hypothetical protein  27.8 
 
 
213 aa  63.9  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000250297 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1436  hypothetical protein  24.53 
 
 
238 aa  63.2  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.136443  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3498  hypothetical protein  32.81 
 
 
212 aa  62  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3007  hypothetical protein  30.48 
 
 
206 aa  62  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0374  hypothetical protein  29.02 
 
 
223 aa  60.1  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1660  hypothetical protein  28.64 
 
 
212 aa  60.5  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.324034 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0406  hypothetical protein  27.32 
 
 
203 aa  60.1  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1546  tetratricopeptide TPR_4  29.28 
 
 
206 aa  60.1  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1900  hypothetical protein  26.36 
 
 
278 aa  58.5  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000294416  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0389  hypothetical protein  28.34 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.60534  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1434  tetratricopeptide TPR_4  31.69 
 
 
206 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000778847  normal  0.941681 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1307  tetratricopeptide TPR_4  28.92 
 
 
206 aa  57.4  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000516271  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0684  hypothetical protein  27.54 
 
 
264 aa  56.2  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0020794  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0654  hypothetical protein  27.05 
 
 
264 aa  56.6  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.755605  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2363  hypothetical protein  28.18 
 
 
206 aa  56.6  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00228748  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0731  putative outer membrane protein  28.16 
 
 
203 aa  55.8  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0487  hypothetical protein  32.41 
 
 
227 aa  56.2  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2890  hypothetical protein  27.78 
 
 
211 aa  55.8  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1935  hypothetical protein  28.42 
 
 
203 aa  55.5  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1607  hypothetical protein  28.42 
 
 
203 aa  55.5  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0731714 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0290  hypothetical protein  29.61 
 
 
204 aa  54.7  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3310  hypothetical protein  27.62 
 
 
206 aa  53.5  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1375  hypothetical protein  27.09 
 
 
206 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.684089  normal  0.473029 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2988  hypothetical protein  27.09 
 
 
206 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1777  hypothetical protein  30.39 
 
 
212 aa  52.8  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.922026  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3003  hypothetical protein  27.09 
 
 
206 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0205779  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3146  hypothetical protein  26.6 
 
 
206 aa  51.6  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.895231  normal  0.0225255 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3124  TPR-like domain-containing protein  28 
 
 
207 aa  50.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06110  hypothetical protein  28.5 
 
 
212 aa  50.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172875  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2889  hypothetical protein  31.07 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.696128  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2759  hypothetical protein  31.07 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.248467 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2715  hypothetical protein  31.07 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2543  hypothetical protein  36.76 
 
 
237 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2672  hypothetical protein  31.07 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2778  hypothetical protein  31.07 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01056  hypothetical protein  28.5 
 
 
212 aa  50.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61223  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1713  hypothetical protein  29.9 
 
 
212 aa  51.2  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.165427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>