71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1777 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1777  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  420  1e-117  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.922026  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1713  hypothetical protein  98.11 
 
 		 212 aa  415  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.165427  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1660  hypothetical protein  48.6 
 
 		 212 aa  192  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.324034 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01056  hypothetical protein  51.89 
 
 		 212 aa  188  4e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61223  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06110  hypothetical protein  51.89 
 
 		 212 aa  188  4e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172875  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40270  YfgM-like protein  32.28 
 
 		 214 aa  72  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.118551  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4599  hypothetical protein  33.33 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1250  hypothetical protein  32.09 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.198007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3498  hypothetical protein  32.63 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1313  hypothetical protein  29.95 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1436  hypothetical protein  32.09 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279934  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14900  hypothetical protein  29.95 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0855  hypothetical protein  32.66 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4323  hypothetical protein  31.66 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000219277 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0898  hypothetical protein  31.66 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.930556  hitchhiker  0.00000414617 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0885  hypothetical protein  32.66 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.17332  normal  0.505215 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1358  hypothetical protein  32.43 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000250297 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1129  hypothetical protein  31.8 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004347  hypothetical protein  28.71 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2305  hypothetical protein  28.78 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226519  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4250  hypothetical protein  31.43 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0596  hypothetical protein  30.37 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.383921 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2047  tetratricopeptide repeat family protein  29.44 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.732509  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0736  Protein of unknown function DUF2133  26.06 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.78252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2735  hypothetical protein  26.6 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2189  hypothetical protein  29.28 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2856  hypothetical protein  27.04 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.750067  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01069  hypothetical protein  26.14 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1217  hypothetical protein  30.81 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.468458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0290  hypothetical protein  28.16 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1436  hypothetical protein  30.23 
 
 		 238 aa  52.4  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.136443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1874  hypothetical protein  27.32 
 
 		 230 aa  51.6  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.426873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2539  hypothetical protein  31.58 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0300828  hitchhiker  0.00124926 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1153  hypothetical protein  31.78 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.584457  normal  0.680719 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2890  hypothetical protein  27.4 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1061  hypothetical protein  31.78 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0623  hypothetical protein  26.76 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3607  hypothetical protein  26.96 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.55841 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2375  hypothetical protein  28.9 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.526802  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1418  hypothetical protein  30.1 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0108097 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1994  hypothetical protein  30.24 
 
 		 228 aa  48.5  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.0755964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1596  hypothetical protein  30.05 
 
 		 209 aa  48.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0668016  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0416  hypothetical protein  26.96 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000879075 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1295  hypothetical protein  26.96 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1188  hypothetical protein  26.96 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.358508  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1465  hypothetical protein  29.77 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.779591  normal  0.530384 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1253  hypothetical protein  28.86 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.407109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5111  hypothetical protein  28.64 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2983  putative transmembrane protein  28.51 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3007  hypothetical protein  24.16 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3737  hypothetical protein  28.25 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.446554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0666  hypothetical protein  25.69 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3124  TPR-like domain-containing protein  27.54 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1120  hypothetical protein  29.41 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1260  Protein of unknown function DUF2133  26.24 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02367  hypothetical protein  27.68 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.350495  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1331  hypothetical protein  23.53 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2888  hypothetical protein  27.68 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0840706  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2665  hypothetical protein  27.68 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.296084 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1164  hypothetical protein  27.68 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.122188  normal  0.0219942 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1392  hypothetical protein  23.53 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5017  hypothetical protein  29.52 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0329961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2797  hypothetical protein  27.68 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00154022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2664  hypothetical protein  27.68 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00194573  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02405  hypothetical protein  27.68 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.23251  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1155  conserved hypothetical protein  27.68 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0910904  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3388  hypothetical protein  31.84 
 
 		 214 aa  42.7  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1787  hypothetical protein  28.57 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1616  hypothetical protein  26.36 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000798521 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1426  hypothetical protein  30.62 
 
 		 221 aa  42  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2104  hypothetical protein  27.88 
 
 		 210 aa  41.6  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155283  normal  0.073414 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>