More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0172 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_0172  30S ribosomal protein S11  100 
 
 		 130 aa  265  2e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.183798 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0627  30S ribosomal protein S11  71.32 
 
 		 129 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5762  30S ribosomal protein S11  74.36 
 
 		 131 aa  192  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3138  30S ribosomal protein S11  73.5 
 
 		 135 aa  187  5e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0205896  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0373  30S ribosomal protein S11  70.16 
 
 		 127 aa  183  7e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1913  30S ribosomal protein S11  73.68 
 
 		 128 aa  179  8.000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05840  30S ribosomal protein S11  73.87 
 
 		 137 aa  179  8.000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0407415  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1640  ribosomal protein S11  68.18 
 
 		 133 aa  173  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.218651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4368  30S ribosomal protein S11  72.8 
 
 		 131 aa  169  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.276482  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  65.45 
 
 		 130 aa  164  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1171  30S ribosomal protein S11  72.97 
 
 		 133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  66.36 
 
 		 131 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 131 aa  161  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  60.8 
 
 		 131 aa  161  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  58.14 
 
 		 129 aa  160  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2271  30S ribosomal protein S11  58.33 
 
 		 127 aa  161  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0715573  hitchhiker  0.00306589 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  58.14 
 
 		 129 aa  160  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  58.14 
 
 		 129 aa  160  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2039  30S ribosomal protein S11  59.17 
 
 		 127 aa  160  6e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000528036  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  64.55 
 
 		 131 aa  160  8.000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  63.96 
 
 		 131 aa  159  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1826  30S ribosomal protein S11  62.73 
 
 		 127 aa  159  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2204  30S ribosomal protein S11  56.67 
 
 		 127 aa  158  3e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000733078  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0314  30S ribosomal protein S11  60.91 
 
 		 127 aa  158  3e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000333021  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0205  30S ribosomal protein S11  60.91 
 
 		 127 aa  157  4e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000759645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2398  30S ribosomal protein S11  60.91 
 
 		 127 aa  157  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000513173  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  57.26 
 
 		 129 aa  155  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  62.73 
 
 		 137 aa  154  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000118735  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  57.26 
 
 		 129 aa  154  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  58.06 
 
 		 129 aa  153  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1112  30S ribosomal protein S11  55.81 
 
 		 130 aa  153  8e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169024  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  57.14 
 
 		 128 aa  152  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1549  ribosomal protein S11  56.92 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  56.45 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0624  30S ribosomal protein S11  55.74 
 
 		 129 aa  150  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000665656  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  56.45 
 
 		 129 aa  150  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  56.45 
 
 		 129 aa  150  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1160  30S ribosomal protein S11  57.81 
 
 		 139 aa  149  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271221  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1655  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  55.3 
 
 		 129 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0608  30S ribosomal protein S11  59.38 
 
 		 134 aa  149  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6585  30S ribosomal protein S11  65.45 
 
 		 135 aa  147  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.713261  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0438  ribosomal protein S11  61.82 
 
 		 183 aa  147  5e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00108118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  55.65 
 
 		 129 aa  147  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0893  30S ribosomal protein S11  58.91 
 
 		 130 aa  147  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494342  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  55.65 
 
 		 129 aa  147  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6024  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 134 aa  147  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0131  30S ribosomal protein S11  58.33 
 
 		 129 aa  147  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000108519  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0498  ribosomal protein S11  52.71 
 
 		 126 aa  146  7e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.423848  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1012  30S ribosomal protein S11  51.94 
 
 		 130 aa  146  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00012191  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1116  ribosomal protein S11  62.73 
 
 		 134 aa  146  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625499  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0082  30S ribosomal protein S11  53.03 
 
 		 129 aa  146  8e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000625128  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01430  ribosomal protein S11  64.55 
 
 		 132 aa  146  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000902694  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  59.09 
 
 		 129 aa  146  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0591  30S ribosomal protein S11  62.73 
 
 		 136 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.648378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1355  30S ribosomal protein S11  59.09 
 
 		 129 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00844113  normal  0.387403 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0566  30S ribosomal protein S11  61.82 
 
 		 129 aa  145  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.628191 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2656  30S ribosomal protein S11  59.68 
 
 		 133 aa  145  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2306  30S ribosomal protein S11  68.18 
 
 		 130 aa  145  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00552164  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1453  30S ribosomal protein S11  59.09 
 
 		 129 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.067537  normal  0.300566 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  58.18 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4001  30S ribosomal protein S11  55.56 
 
 		 138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000341479  hitchhiker  0.000619325 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4292  ribosomal protein S11  57.81 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3161  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.560785  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  59.09 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  59.09 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  60.91 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2941  30S ribosomal protein S11  60.48 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113794  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1580  30S ribosomal protein S11  58.59 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0220248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0867  ribosomal protein S11  59.69 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.322465  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  59.09 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  53.12 
 
 		 129 aa  144  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2685  30S ribosomal protein S11  64.29 
 
 		 138 aa  144  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000312441  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3384  30S ribosomal protein S11  62.73 
 
 		 137 aa  144  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00752  30S ribosomal protein S11  52.71 
 
 		 129 aa  144  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00961  30S ribosomal protein S11  51.16 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000322377  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2151  30S ribosomal protein S11  52.71 
 
 		 129 aa  144  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000057735  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001719  SSU ribosomal protein S11p (S14e)  52.71 
 
 		 129 aa  144  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000259501  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2318  30S ribosomal protein S11  59.09 
 
 		 129 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163155  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  59.09 
 
 		 129 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3877  30S ribosomal protein S11  55.47 
 
 		 135 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4288  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 135 aa  144  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000331944 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0979  30S ribosomal protein S11  54.69 
 
 		 129 aa  144  5e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0952453  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3897  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 135 aa  144  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0424  ribosomal protein S11  58.18 
 
 		 132 aa  144  5e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  51.56 
 
 		 133 aa  144  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4667  30S ribosomal protein S11  51.94 
 
 		 130 aa  144  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000031185  unclonable  0.00000000812252 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  54.62 
 
 		 131 aa  144  5e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5151  30S ribosomal protein S11  57.81 
 
 		 134 aa  143  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.589824 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2619  30S ribosomal protein S11  59.68 
 
 		 134 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04250  SSU ribosomal protein S11P  58.59 
 
 		 135 aa  143  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.333159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  52.34 
 
 		 132 aa  143  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2302  30S ribosomal protein S11  49.61 
 
 		 127 aa  143  8.000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.12621  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1215  30S ribosomal protein S11  60.48 
 
 		 132 aa  143  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0134437 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0181  30S ribosomal protein S11  51.94 
 
 		 130 aa  143  9e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000807145  hitchhiker  0.00156032 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0236  30S ribosomal protein S11  51.94 
 
 		 130 aa  143  9e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000127993  unclonable  0.00000919144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>