22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_06111 on replicon BN001301
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_06111  exosome complex endonuclease 2/ribosomal RNA processing protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08860)  100 
 
 
295 aa  606  9.999999999999999e-173  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000732301  normal  0.0523643 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59559  predicted protein  33.56 
 
 
307 aa  204  1e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02010  exosome complex exonuclease rrp45, putative  40.43 
 
 
281 aa  192  4e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0580  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  30.87 
 
 
272 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0200  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  32.05 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411269  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0168  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  28.45 
 
 
279 aa  112  5e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00118576  normal  0.188024 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1361  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  29.49 
 
 
257 aa  105  8e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.918762  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0181  3' exoribonuclease  32.61 
 
 
270 aa  105  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0578869  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0078  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  27.78 
 
 
280 aa  100  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.175337  hitchhiker  0.00423326 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5981  predicted protein  30.14 
 
 
257 aa  100  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00562126  normal  0.193352 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0433  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  31.6 
 
 
272 aa  97.4  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00701931 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16560  predicted protein  29.63 
 
 
269 aa  95.9  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1791  3' exoribonuclease  32.08 
 
 
275 aa  90.5  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0998927  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2507  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  28.09 
 
 
260 aa  90.1  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.142847  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1938  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  27.56 
 
 
276 aa  85.1  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1380  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  27.83 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0835  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  27.83 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.127977 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0932  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  27.91 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08280  Opa-interacting protein OIP2, putative  32.53 
 
 
297 aa  75.1  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30583  predicted protein  25.62 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0123665 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_55141  ribosomal RNA processing protein  27.41 
 
 
354 aa  57.4  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26622  predicted protein  25.15 
 
 
191 aa  53.9  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.604271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>