More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_03176 on replicon BN001306
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001306  ANIA_03176  ATP-dependent rRNA helicase spb4 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B8F4]  100 
 
 
638 aa  1308    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.541811  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62830  ATP dependent RNA helicase  41.07 
 
 
617 aa  432  1e-120  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0490658 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02690  ATP-dependent RNA helicase, putative  39.75 
 
 
748 aa  404  1e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_1733  predicted protein  37.56 
 
 
583 aa  360  6e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0224275 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9989  predicted protein  36.93 
 
 
620 aa  313  9e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.860977  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25999  predicted protein  33.46 
 
 
485 aa  260  5.0000000000000005e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46259  predicted protein  33.95 
 
 
589 aa  259  8e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81459  RNA-dependent helicase  33.95 
 
 
567 aa  259  1e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.3042 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01060  conserved hypothetical protein  36.48 
 
 
607 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0340674  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01949  ATP-dependent RNA helicase has1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBY1]  32.95 
 
 
609 aa  246  6e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.429941  normal  0.205998 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51414  ATP-dependent RNA helicase DBP4 (Helicase CA4) (Helicase UF1)  34.1 
 
 
765 aa  245  1.9999999999999999e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00589  ATP-dependent RNA helicase dbp4 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BFU1]  31.94 
 
 
812 aa  243  5e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42318  predicted protein  33.33 
 
 
481 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.712949  normal  0.0619314 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13235  fructose-bisphosphate aldolase  34.5 
 
 
627 aa  229  1e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00390046  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07420  hypothetical protein  33.13 
 
 
859 aa  213  7.999999999999999e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.592915  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04233  ATP-dependent rRNA helicase rrp3 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B5E7]  34.92 
 
 
465 aa  207  5e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.078552  normal  0.363381 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10125  ATP-dependent RNA helicase (Drs1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14990)  31.99 
 
 
814 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00305342  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0074  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.32 
 
 
450 aa  198  3e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26724  predicted protein  36.29 
 
 
466 aa  196  8.000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.593125  normal  0.152821 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14032  predicted protein  33.68 
 
 
467 aa  196  1e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02850  ATP-dependent RNA helicase, putative  33.95 
 
 
484 aa  195  2e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_28984  predicted protein  34.03 
 
 
433 aa  195  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41606  predicted protein  31.9 
 
 
755 aa  195  3e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.323573 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19237  predicted protein  31.9 
 
 
710 aa  194  3e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.554541  normal  0.150728 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57234  ATP-dependent rRNA helicase RRP3  32.49 
 
 
396 aa  191  4e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0347564  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46542  predicted protein  30.93 
 
 
545 aa  190  8e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.893722  normal  0.156385 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0454  superfamily II DNA/RNA helicase  31.56 
 
 
528 aa  189  1e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.09 
 
 
550 aa  188  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.51 
 
 
584 aa  189  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0079  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.42 
 
 
532 aa  188  3e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2292  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.32 
 
 
482 aa  187  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.229861  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  33.25 
 
 
656 aa  187  7e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05215  putative ATP-dependent RNA helicase  30.97 
 
 
424 aa  186  8e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.190417  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02650  conserved hypothetical protein  32.34 
 
 
808 aa  186  9e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4766  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.51 
 
 
443 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110868  decreased coverage  0.00101931 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0654  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.25 
 
 
439 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000031459  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_1703  nucleolar DEAD-box protein required for synthesis of 60S ribosomal subunits  32.57 
 
 
672 aa  184  3e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0152  DEAD/DEAH box helicase-like  33.5 
 
 
572 aa  185  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1950  DEAD/DEAH box helicase-like protein  33.86 
 
 
522 aa  185  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.95 
 
 
583 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.51 
 
 
443 aa  184  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00319736  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4641  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.25 
 
 
443 aa  183  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00424195  normal  0.0145877 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0522  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.67 
 
 
562 aa  183  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0631  putative ATP-dependent RNA helicase 2  34.02 
 
 
494 aa  182  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.640854  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2582  DEAD/DEAH box helicase-like protein  33.5 
 
 
556 aa  182  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40877  predicted protein  34.56 
 
 
546 aa  182  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.22 
 
 
532 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60418  ATP-dependent RNA helicase DBP7 (DEAD-box protein 7)  27.43 
 
 
733 aa  181  4e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.174628 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.36 
 
 
467 aa  181  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0819  DEAD/DEAH box helicase  32.45 
 
 
461 aa  181  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.295778  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2476  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.45 
 
 
461 aa  181  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.753535  normal  0.196706 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.44 
 
 
565 aa  181  4.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2211  ATP-dependent RNA helicase protein  34.87 
 
 
495 aa  180  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1148  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.16 
 
 
489 aa  180  5.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1052  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.58 
 
 
535 aa  180  7e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1017  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.58 
 
 
535 aa  180  9e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1053  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.73 
 
 
484 aa  179  9e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0902  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.07 
 
 
474 aa  180  9e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.282889  normal  0.164162 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2862  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.83 
 
 
385 aa  179  9e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0981468 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.18 
 
 
448 aa  179  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00759671  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.25 
 
 
466 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0649  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.25 
 
 
532 aa  179  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.73 
 
 
538 aa  179  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3389  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.53 
 
 
590 aa  179  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0359  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.48 
 
 
453 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.992502  normal  0.993295 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16073  predicted protein  31.36 
 
 
474 aa  179  2e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.760064  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0899  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  33.76 
 
 
537 aa  179  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.58 
 
 
531 aa  179  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3036  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  33.33 
 
 
453 aa  178  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.02 
 
 
460 aa  178  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000327397 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3104  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.95 
 
 
539 aa  179  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000955018  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0013  ATP-dependent RNA helicase DbpA  28.98 
 
 
463 aa  179  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12565 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2564  DEAD/DEAH box helicase-like protein  30.35 
 
 
634 aa  179  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347829  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.73 
 
 
484 aa  179  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.716722 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00583  ATP-dependent RNA helicase dbp10 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BFU7]  29.73 
 
 
936 aa  178  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2155  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.13 
 
 
504 aa  178  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.659506  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3577  ATP-dependent RNA helicase DbpA  29.4 
 
 
473 aa  178  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.06 
 
 
465 aa  178  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.509668  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05770  DNA/RNA helicase, superfamily II  33.68 
 
 
551 aa  178  3e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000174624  hitchhiker  0.00467584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0368  ATP-independent RNA helicase  33.03 
 
 
561 aa  178  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2015  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 
493 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73004  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.22 
 
 
528 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  32.22 
 
 
528 aa  177  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3878  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.59 
 
 
486 aa  177  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2624  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.5 
 
 
448 aa  177  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.394652  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  32.22 
 
 
533 aa  177  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.79 
 
 
498 aa  177  4e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0681922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.22 
 
 
528 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1618  DEAD/DEAH box helicase-like  31.92 
 
 
447 aa  177  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  32.22 
 
 
528 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.22 
 
 
525 aa  177  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.47 
 
 
511 aa  177  5e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  32.22 
 
 
528 aa  177  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  32.22 
 
 
525 aa  177  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0919  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  30.5 
 
 
632 aa  177  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  32.47 
 
 
529 aa  177  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3362  ATP-dependent RNA helicase  33.25 
 
 
484 aa  177  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1379  DEAD/DEAH box helicase-like  34.2 
 
 
552 aa  177  6e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0603  DEAD/DEAH box helicase-like protein  31.46 
 
 
591 aa  177  7e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0617  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
479 aa  177  8e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.028654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>