38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1501 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1219  regulatory protein, FmdB family  100 
 
 		 76 aa  160  7e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000778963 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1501  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  160  7e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1459  hypothetical protein  56.16 
 
 		 78 aa  91.3  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501931 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4413  hypothetical protein  58.9 
 
 		 75 aa  90.5  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.945619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0420  hypothetical protein  54.05 
 
 		 75 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.865694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5314  regulatory protein, FmdB family  54.67 
 
 		 75 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0261  hypothetical protein  50.68 
 
 		 77 aa  84.7  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4703  hypothetical protein  58.67 
 
 		 75 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4303  FmdB family regulatory protein  55.41 
 
 		 75 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3238  hypothetical protein  48.65 
 
 		 80 aa  79  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.882851  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1427  FmdB family regulatory protein  45.21 
 
 		 80 aa  77.4  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2352  FmdB family regulatory protein  46.58 
 
 		 83 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2706  FmdB family regulatory protein  45.83 
 
 		 79 aa  73.9  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.589032 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2310  regulatory protein, FmdB family  48.68 
 
 		 78 aa  72  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0545212 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4252  hypothetical protein  56.58 
 
 		 76 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.79426  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7750  FmdB family regulatory protein  50.68 
 
 		 80 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.572116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1009  hypothetical protein  41.67 
 
 		 73 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0112421  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0583  regulatory protein, FmdB family  45.1 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301653 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1286  regulatory protein, FmdB family  47.92 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497457  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2576  cytochrome c family protein, putative  38.46 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00231924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2088  regulatory protein, FmdB family  34.85 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0524  regulatory protein, FmdB family  46.34 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0687  regulatory protein, FmdB family  46.67 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.406646  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2748  cytochrome c family protein, putative  36.96 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0512  regulatory protein, FmdB family  45.24 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3407  FmdB family regulatory protein  43.48 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200356  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1274  FmdB family regulatory protein  45 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3203  hypothetical protein  46.34 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1775  FmdB family regulatory protein  43.14 
 
 		 69 aa  41.6  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1995  FmdB family regulatory protein  42.5 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.013154  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0721  FmdB family regulatory protein  39.13 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.538439  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0746  hypothetical protein  36.73 
 
 		 70 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4161  FmdB family regulatory protein  34.25 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00024614  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1521  FmdB family regulatory protein  41.3 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10251 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2577  regulatory protein, FmdB family  38.3 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.923683  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2673  regulatory protein, FmdB family  38.3 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0890211  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0778  regulatory protein, FmdB family  36.73 
 
 		 71 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1259  hypothetical protein  38 
 
 		 70 aa  40  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>