More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_01881 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_01901  NifS-like aminotransferase class-V  96.33 
 
 
381 aa  743    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01881  NifS-like aminotransferase class-V  100 
 
 
381 aa  765    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0172  nifS-like aminotransferase class-V  89.5 
 
 
381 aa  697    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01991  NifS-like aminotransferase class-V  75.07 
 
 
381 aa  592  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.117256  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01881  NifS-like aminotransferase class-V  53.02 
 
 
390 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27201  NifS-like aminotransferase class-V  49.21 
 
 
402 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02451  NifS-like aminotransferase class-V  55.32 
 
 
382 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1538  NifS-like aminotransferase class-V  55.12 
 
 
382 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2429  NifS-like aminotransferase class-V  48.59 
 
 
354 aa  367  1e-100  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0534136  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2109  NifS-like aminotransferase class-V  47.56 
 
 
354 aa  348  9e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2558  cysteine desulfurase NifS  42.82 
 
 
388 aa  323  3e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.947611  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  43.04 
 
 
405 aa  306  6e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  43.23 
 
 
407 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  43.23 
 
 
407 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  43.23 
 
 
407 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  44.27 
 
 
407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  43.49 
 
 
407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  43.04 
 
 
405 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  43.23 
 
 
407 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  43.23 
 
 
407 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2144  cysteine desulfurase IscS  42.52 
 
 
406 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124025 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  42.71 
 
 
407 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  43.04 
 
 
407 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2177  cysteine desulfurase IscS  42.26 
 
 
430 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  42.78 
 
 
407 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  42.52 
 
 
407 aa  301  9e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  42.52 
 
 
407 aa  301  9e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  42.52 
 
 
407 aa  301  9e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  42.97 
 
 
407 aa  301  9e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  42.52 
 
 
407 aa  301  9e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2178  cysteine desulfurase IscS  42.52 
 
 
405 aa  301  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000963732  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  42.52 
 
 
407 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  42.52 
 
 
407 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3449  cysteine desulfurase  41.45 
 
 
389 aa  300  2e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  42.52 
 
 
406 aa  301  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  41.21 
 
 
407 aa  300  3e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  41.21 
 
 
421 aa  300  3e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2142  cysteine desulfurase IscS  42.26 
 
 
406 aa  300  4e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  42.26 
 
 
405 aa  299  6e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  42.26 
 
 
407 aa  299  6e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2262  cysteine desulfurase  42.26 
 
 
406 aa  298  7e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  40.52 
 
 
436 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1063  aminotransferase class V  41.6 
 
 
388 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  40.52 
 
 
403 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  40.52 
 
 
436 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1638  cysteine desulfurase IscS  42.26 
 
 
406 aa  297  2e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  40.26 
 
 
403 aa  297  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  42.56 
 
 
404 aa  297  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  42.82 
 
 
408 aa  296  3e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  41.45 
 
 
389 aa  296  3e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1092  Cysteine desulfurase  41.6 
 
 
388 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.71 
 
 
388 aa  296  6e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1047  cysteine desulfurase IscS  42.78 
 
 
411 aa  295  7e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  41.73 
 
 
405 aa  295  8e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  41.73 
 
 
405 aa  295  8e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  40.99 
 
 
405 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0717  cysteine desulfurase  42.23 
 
 
406 aa  295  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  42.3 
 
 
404 aa  293  3e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2059  cysteine desulfurase IscS  41.71 
 
 
407 aa  293  4e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0733618  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2443  cysteine desulfurase IscS  41.47 
 
 
406 aa  292  6e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1487  cysteine desulfurase IscS  41.67 
 
 
406 aa  292  7e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000124631  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  42.08 
 
 
403 aa  292  7e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1950  cysteine desulfurase IscS  41.99 
 
 
405 aa  291  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000843977  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  41.78 
 
 
404 aa  291  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3999  cysteine desulfurase IscS  42.26 
 
 
406 aa  290  4e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102036  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0410  cysteine desulfurase  44.27 
 
 
422 aa  288  1e-76  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0629  cysteine desulfurase  42.93 
 
 
410 aa  288  2e-76  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  42.3 
 
 
404 aa  287  2e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1493  cysteine desulfurase IscS  42.26 
 
 
419 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0808  cysteine desulfurase IscS  41.41 
 
 
405 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000772731  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0830  cysteine desulfurase IscS  41.19 
 
 
407 aa  286  4e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.184128 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2373  cysteine desulfurase IscS  40.94 
 
 
406 aa  286  4e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.934758  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  39.84 
 
 
388 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0469  cysteine desulfurase IscS  41.99 
 
 
419 aa  286  5.999999999999999e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00221025  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  40.99 
 
 
507 aa  284  1.0000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2264  cysteine desulfurase  41.78 
 
 
404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1164  cysteine desulfurase IscS  42.89 
 
 
402 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000196201  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1238  cysteine desulfurase IscS  42.56 
 
 
407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.01856  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0616  aminotransferase class V  38.79 
 
 
408 aa  283  5.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.327538  normal  0.0437001 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0247  cysteine desulfurase  41.99 
 
 
403 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1324  cysteine desulfurase IscS  41.25 
 
 
403 aa  281  1e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00549463  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0637  cysteine desulfurase  39.58 
 
 
404 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.273964 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  38.6 
 
 
399 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  41.78 
 
 
404 aa  280  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  39.84 
 
 
403 aa  281  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1293  cysteine desulfurase  40.67 
 
 
404 aa  280  3e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0405061 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  41.51 
 
 
404 aa  280  4e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2149  cysteine desulfurase  42.3 
 
 
404 aa  279  5e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00291634  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  41.42 
 
 
384 aa  279  6e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2317  cysteine desulfurase  40.99 
 
 
404 aa  278  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.459864  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  40.93 
 
 
404 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  41.25 
 
 
404 aa  277  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  41.69 
 
 
384 aa  277  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1488  cysteine desulfurase  41.78 
 
 
404 aa  276  4e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.645778  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  40.93 
 
 
404 aa  276  4e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0303  cysteine desulfurase  41.88 
 
 
402 aa  276  4e-73  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1739  cysteine desulfurase  41.25 
 
 
404 aa  276  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125789  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  40.67 
 
 
404 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2397  cysteine desulfurase  42.3 
 
 
404 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0798953  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1819  cysteine desulfurase  41.25 
 
 
404 aa  276  5e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00929317  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>