More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4186 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_4159  penicillin-binding protein transpeptidase  99.04 
 
 
417 aa  801    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4043  penicillin-binding protein, transpeptidase  95.68 
 
 
415 aa  736    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.185678  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4186  penicillin-binding protein transpeptidase  100 
 
 
417 aa  809    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.203028  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0386  penicillin-binding protein transpeptidase  64.27 
 
 
403 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.213828  hitchhiker  0.0005856 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2368  penicillin-binding protein transpeptidase  42.28 
 
 
437 aa  238  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0864167  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2458  penicillin-binding protein, putative  40.65 
 
 
337 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0593  penicillin-binding protein transpeptidase  39.89 
 
 
444 aa  212  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000288758 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0580  penicillin-binding protein transpeptidase  37.95 
 
 
445 aa  212  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000287741  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0637  penicillin-binding protein, transpeptidase  39.37 
 
 
449 aa  209  7e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00435072  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2778  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.06 
 
 
455 aa  203  6e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000140543  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2896  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.18 
 
 
465 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.427253  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2919  penicillin-binding protein transpeptidase  35.38 
 
 
428 aa  176  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.599052  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1370  FtsI-like cell division protein  31.73 
 
 
461 aa  163  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  34.88 
 
 
504 aa  139  7e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  31.7 
 
 
470 aa  133  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 
458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.61 
 
 
480 aa  126  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.13 
 
 
472 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  31.11 
 
 
473 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.52 
 
 
491 aa  113  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.83 
 
 
547 aa  113  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  29.67 
 
 
535 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  28.61 
 
 
972 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  33.43 
 
 
482 aa  111  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33.23 
 
 
490 aa  108  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  29.97 
 
 
636 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  27 
 
 
553 aa  106  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  33.24 
 
 
480 aa  106  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.48 
 
 
654 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  31.47 
 
 
485 aa  105  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.43 
 
 
483 aa  105  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1434  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.43 
 
 
549 aa  104  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.65 
 
 
483 aa  103  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  29.56 
 
 
486 aa  103  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.7 
 
 
924 aa  103  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  31.27 
 
 
660 aa  103  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  31 
 
 
476 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.81 
 
 
489 aa  102  8e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.83 
 
 
493 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1801  penicillin-binding protein transpeptidase  32.47 
 
 
560 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  27.35 
 
 
504 aa  101  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  29.87 
 
 
639 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0810  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.1 
 
 
491 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  31.89 
 
 
461 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  30.45 
 
 
485 aa  100  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  30.53 
 
 
643 aa  100  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.45 
 
 
485 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  30.09 
 
 
490 aa  100  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  29.1 
 
 
647 aa  99.8  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0919  peptidoglycan glycosyltransferase  30.41 
 
 
553 aa  99.8  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0272604  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.27 
 
 
503 aa  99.4  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  26.9 
 
 
640 aa  98.2  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  29.23 
 
 
488 aa  99  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  28.45 
 
 
487 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0023  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.49 
 
 
488 aa  97.8  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0951925  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  28.07 
 
 
471 aa  98.2  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0022  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.35 
 
 
486 aa  98.2  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000781199 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  28.45 
 
 
487 aa  97.8  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  27.93 
 
 
645 aa  97.1  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  31.01 
 
 
708 aa  97.1  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  29.65 
 
 
489 aa  96.7  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  29.68 
 
 
657 aa  96.3  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  27.62 
 
 
649 aa  95.9  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.39 
 
 
657 aa  95.1  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  30.03 
 
 
491 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  30.03 
 
 
491 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  30.03 
 
 
491 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0902  peptidoglycan glycosyltransferase  28.33 
 
 
566 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133887  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.03 
 
 
481 aa  94.4  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2121  penicillin-binding protein transpeptidase  31.27 
 
 
608 aa  94.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.84 
 
 
672 aa  94.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.56 
 
 
485 aa  94.4  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  29.36 
 
 
492 aa  93.6  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  28.12 
 
 
642 aa  94  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  28.94 
 
 
657 aa  94  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  29.29 
 
 
933 aa  93.6  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2250  peptidoglycan glycosyltransferase  27.3 
 
 
606 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.49 
 
 
671 aa  92.4  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.15 
 
 
487 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  32.17 
 
 
489 aa  91.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1085  penicillin-binding protein 2  26.94 
 
 
625 aa  90.9  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  27.27 
 
 
646 aa  91.3  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0345  penicillin-binding protein 2  28.46 
 
 
557 aa  91.3  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1590  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.31 
 
 
692 aa  90.9  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150258  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  28.78 
 
 
711 aa  90.9  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1448  penicillin-binding protein transpeptidase  32.26 
 
 
570 aa  90.1  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  27.95 
 
 
921 aa  90.1  6e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1014  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.05 
 
 
737 aa  89.7  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0544  stage V sporulation protein D  24.66 
 
 
721 aa  89.7  9e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6503  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0528  stage V sporulation protein D  24.66 
 
 
728 aa  89.7  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  26.29 
 
 
615 aa  89.4  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2030  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.3 
 
 
606 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.609137  normal  0.0382075 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0742  penicillin-binding protein  29.14 
 
 
599 aa  88.2  2e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.310072  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0327  peptidoglycan glycosyltransferase  29.26 
 
 
557 aa  87.8  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.282636  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.88 
 
 
662 aa  87.8  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1831  stage V sporulation protein D  24.65 
 
 
739 aa  87.4  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  27.25 
 
 
719 aa  87.4  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1727  penicillin-binding protein transpeptidase  33.79 
 
 
540 aa  87.4  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23852  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.75 
 
 
478 aa  87  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  23.53 
 
 
574 aa  87  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>