More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0580 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0580  penicillin-binding protein transpeptidase  100 
 
 		 445 aa  911    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000287741  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0593  penicillin-binding protein transpeptidase  93.03 
 
 		 444 aa  807    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000288758 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0637  penicillin-binding protein, transpeptidase  57.71 
 
 		 449 aa  537  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00435072  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2778  penicillin-binding protein, transpeptidase  54.53 
 
 		 455 aa  499  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000140543  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2458  penicillin-binding protein, putative  64.39 
 
 		 337 aa  457  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2896  penicillin-binding protein, transpeptidase  53.07 
 
 		 465 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.427253  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2919  penicillin-binding protein transpeptidase  47.62 
 
 		 428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.599052  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4043  penicillin-binding protein, transpeptidase  40.41 
 
 		 415 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.185678  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4186  penicillin-binding protein transpeptidase  38.26 
 
 		 417 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.203028  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4159  penicillin-binding protein transpeptidase  38.26 
 
 		 417 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0386  penicillin-binding protein transpeptidase  36.87 
 
 		 403 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.213828  hitchhiker  0.0005856 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  31.7 
 
 		 504 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1370  FtsI-like cell division protein  27.62 
 
 		 461 aa  138  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2368  penicillin-binding protein transpeptidase  28.57 
 
 		 437 aa  129  9.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0864167  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  30.12 
 
 		 485 aa  128  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  28.15 
 
 		 713 aa  123  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.16 
 
 		 489 aa  121  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.14 
 
 		 485 aa  120  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.84 
 
 		 483 aa  119  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.38 
 
 		 478 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  29.97 
 
 		 487 aa  117  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  29.69 
 
 		 487 aa  117  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  28.7 
 
 		 740 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  28.93 
 
 		 489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.07 
 
 		 485 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.18 
 
 		 483 aa  113  6e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  28.24 
 
 		 649 aa  113  9e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  26.57 
 
 		 490 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  28.61 
 
 		 553 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  30.11 
 
 		 723 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  30.53 
 
 		 491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  28.57 
 
 		 461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  30.53 
 
 		 491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  30.53 
 
 		 491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  29.03 
 
 		 682 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.62 
 
 		 491 aa  110  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.92 
 
 		 472 aa  110  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.76 
 
 		 484 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  29.41 
 
 		 480 aa  109  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  30.79 
 
 		 489 aa  109  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  28.86 
 
 		 482 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  26.7 
 
 		 471 aa  108  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  27.2 
 
 		 972 aa  107  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  27.35 
 
 		 470 aa  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0902  peptidoglycan glycosyltransferase  28.03 
 
 		 566 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133887  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  28.36 
 
 		 711 aa  106  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  28.08 
 
 		 490 aa  106  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.22 
 
 		 458 aa  103  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  28.31 
 
 		 708 aa  103  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.33 
 
 		 493 aa  103  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0023  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.99 
 
 		 488 aa  103  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0951925  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  27.86 
 
 		 695 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.71 
 
 		 704 aa  101  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1048  stage V sporulation protein D  24.54 
 
 		 708 aa  100  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00770  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  27.94 
 
 		 481 aa  100  6e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0919  peptidoglycan glycosyltransferase  30.25 
 
 		 553 aa  99.8  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0272604  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0810  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.21 
 
 		 491 aa  99  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.4 
 
 		 487 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  28.09 
 
 		 705 aa  98.2  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1434  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.85 
 
 		 549 aa  97.4  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2628  peptidoglycan glycosyltransferase  28.8 
 
 		 655 aa  97.4  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.19 
 
 		 480 aa  97.4  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0027  penicillin-binding protein transpeptidase  26.2 
 
 		 495 aa  97.1  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  25 
 
 		 644 aa  95.9  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  26.45 
 
 		 504 aa  95.9  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  27.17 
 
 		 486 aa  96.3  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  25.96 
 
 		 476 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  27.71 
 
 		 485 aa  95.5  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.43 
 
 		 503 aa  95.5  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0495  penicillin-binding protein 2  27.73 
 
 		 775 aa  94.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  26.74 
 
 		 488 aa  94  5e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1352  penicillin-binding protein  26.43 
 
 		 617 aa  93.6  7e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  28.42 
 
 		 645 aa  93.6  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0489  peptidoglycan glycosyltransferase  26.2 
 
 		 568 aa  93.6  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000313702  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  27.9 
 
 		 482 aa  93.2  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  26.78 
 
 		 657 aa  93.2  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1272  stage V sporulation protein D  30.06 
 
 		 645 aa  93.2  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.144454  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.94 
 
 		 490 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2260  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.23 
 
 		 559 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116507 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  26.26 
 
 		 640 aa  92.4  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  28.65 
 
 		 600 aa  91.3  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.27 
 
 		 547 aa  91.7  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  24.57 
 
 		 719 aa  91.3  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  27.34 
 
 		 647 aa  91.3  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  25.68 
 
 		 646 aa  91.3  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2304  peptidoglycan glycosyltransferase  26.96 
 
 		 610 aa  90.9  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.34 
 
 		 924 aa  90.9  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  25.96 
 
 		 933 aa  90.9  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0551  penicillin-binding protein 2  28.57 
 
 		 612 aa  90.5  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0568  penicillin-binding protein 2  28.57 
 
 		 612 aa  90.5  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.116785  normal  0.658129 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  27.76 
 
 		 921 aa  90.1  7e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2899  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.57 
 
 		 680 aa  90.1  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0113727  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  25.19 
 
 		 701 aa  90.1  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1011  peptidoglycan glycosyltransferase  25.61 
 
 		 551 aa  90.1  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.362727  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3961  sporulation specific penicillin-binding protein  28.96 
 
 		 638 aa  89  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1014  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.55 
 
 		 737 aa  89  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  26.27 
 
 		 643 aa  89  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0478  penicillin-binding protein transpeptidase  25.13 
 
 		 734 aa  88.2  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  24.59 
 
 		 574 aa  88.2  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  26.01 
 
 		 481 aa  87.8  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>