More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2778 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2778  penicillin-binding protein, transpeptidase  100 
 
 		 455 aa  934    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000140543  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2458  penicillin-binding protein, putative  77.98 
 
 		 337 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0637  penicillin-binding protein, transpeptidase  55.73 
 
 		 449 aa  545  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00435072  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0580  penicillin-binding protein transpeptidase  54.53 
 
 		 445 aa  484  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000287741  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0593  penicillin-binding protein transpeptidase  54.2 
 
 		 444 aa  472  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000288758 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2896  penicillin-binding protein, transpeptidase  50.21 
 
 		 465 aa  431  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.427253  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2919  penicillin-binding protein transpeptidase  44.2 
 
 		 428 aa  352  7e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.599052  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4043  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.35 
 
 		 415 aa  202  7e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.185678  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4159  penicillin-binding protein transpeptidase  37.35 
 
 		 417 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4186  penicillin-binding protein transpeptidase  37.06 
 
 		 417 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.203028  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0386  penicillin-binding protein transpeptidase  36.58 
 
 		 403 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.213828  hitchhiker  0.0005856 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  29.83 
 
 		 504 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  29.91 
 
 		 485 aa  141  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  31.81 
 
 		 480 aa  139  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  30.46 
 
 		 482 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.7 
 
 		 489 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2368  penicillin-binding protein transpeptidase  28.61 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0864167  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.45 
 
 		 480 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  29.45 
 
 		 490 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  29.11 
 
 		 489 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.68 
 
 		 483 aa  126  6e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1370  FtsI-like cell division protein  25.15 
 
 		 461 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  30.5 
 
 		 470 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  29.34 
 
 		 553 aa  124  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  28.65 
 
 		 490 aa  124  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  28.97 
 
 		 488 aa  121  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.82 
 
 		 478 aa  120  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  29.79 
 
 		 461 aa  119  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  27.96 
 
 		 713 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.15 
 
 		 458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.85 
 
 		 483 aa  117  5e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.67 
 
 		 493 aa  116  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  24.15 
 
 		 471 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  30.17 
 
 		 491 aa  114  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  30.17 
 
 		 491 aa  114  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  30.17 
 
 		 491 aa  114  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0023  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.17 
 
 		 488 aa  113  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0951925  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  27.5 
 
 		 708 aa  113  8.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  27.22 
 
 		 723 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.25 
 
 		 485 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.2 
 
 		 503 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  25.98 
 
 		 486 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0022  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.85 
 
 		 486 aa  107  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000781199 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  24.85 
 
 		 740 aa  107  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00770  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  27.38 
 
 		 481 aa  107  6e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  28.98 
 
 		 596 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0544  stage V sporulation protein D  24.72 
 
 		 721 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6503  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0528  stage V sporulation protein D  24.72 
 
 		 728 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  28.29 
 
 		 643 aa  106  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0902  peptidoglycan glycosyltransferase  26.88 
 
 		 566 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133887  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1434  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.45 
 
 		 549 aa  105  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.95 
 
 		 672 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.32 
 
 		 547 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.49 
 
 		 472 aa  104  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.76 
 
 		 582 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.48 
 
 		 490 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  26.14 
 
 		 711 aa  103  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.03 
 
 		 491 aa  103  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  27.79 
 
 		 492 aa  103  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  26.96 
 
 		 574 aa  103  7e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.86 
 
 		 485 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0919  peptidoglycan glycosyltransferase  29.7 
 
 		 553 aa  103  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0272604  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  27.03 
 
 		 504 aa  103  9e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0032  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  27.89 
 
 		 488 aa  102  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.67 
 
 		 493 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  27.57 
 
 		 485 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.38 
 
 		 484 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  28.65 
 
 		 647 aa  102  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0489  peptidoglycan glycosyltransferase  28.26 
 
 		 568 aa  102  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000313702  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  26.29 
 
 		 701 aa  101  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  26.11 
 
 		 487 aa  101  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  25.61 
 
 		 476 aa  101  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  26.37 
 
 		 487 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1352  penicillin-binding protein  26.25 
 
 		 617 aa  100  5e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0027  penicillin-binding protein transpeptidase  28.18 
 
 		 495 aa  99.4  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  28.33 
 
 		 640 aa  98.2  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  24.32 
 
 		 649 aa  98.6  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  26.9 
 
 		 682 aa  99  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.11 
 
 		 487 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  27.83 
 
 		 646 aa  98.2  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  25.53 
 
 		 695 aa  98.2  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  25.07 
 
 		 972 aa  98.2  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  27.87 
 
 		 482 aa  97.8  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1085  penicillin-binding protein 2  25.51 
 
 		 625 aa  96.7  7e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  26.39 
 
 		 481 aa  96.7  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  25.6 
 
 		 489 aa  96.7  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  24.65 
 
 		 473 aa  96.3  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2260  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.32 
 
 		 559 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116507 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0810  penicillin-binding protein, transpeptidase  27.87 
 
 		 491 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1014  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.32 
 
 		 737 aa  95.5  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  23.88 
 
 		 634 aa  95.1  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  23.94 
 
 		 705 aa  95.1  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1048  stage V sporulation protein D  25.3 
 
 		 708 aa  94.7  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1801  penicillin-binding protein transpeptidase  27.54 
 
 		 560 aa  94.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0579  peptidoglycan glycosyltransferase  27.51 
 
 		 578 aa  94  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2896  penicillin-binding protein 2  27 
 
 		 613 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  26.99 
 
 		 639 aa  93.6  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  27.19 
 
 		 600 aa  93.2  9e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2304  peptidoglycan glycosyltransferase  26.88 
 
 		 610 aa  93.2  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  22.64 
 
 		 586 aa  92.8  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>