143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0309 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0309  ABC-type Fe3+ transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 		 354 aa  627  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.698872  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0298  ABC-type Fe3+ transporter, periplasmic ligand binding protein  98.87 
 
 		 354 aa  618  1e-176  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0287  ABC-type Fe3+ transporter, periplasmic ligand binding protein  91.77 
 
 		 364 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0312  ABC-type Fe3+ transporter, periplasmic ligand binding protein  62.38 
 
 		 321 aa  265  8e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2521  extracellular solute-binding protein  29.56 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4631  extracellular solute-binding protein family 1  32.55 
 
 		 336 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3947  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 338 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000383863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  28.78 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1439  extracellular solute-binding protein  29.86 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1463  extracellular solute-binding protein  30.66 
 
 		 338 aa  72.8  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  28.04 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0783  periplasmic iron-binding protein  24.89 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.27536  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1431  extracellular solute-binding protein  28.3 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452816  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2479  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2093  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 		 374 aa  59.3  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  25.76 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  25.76 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1093  extracellular solute-binding protein  31.75 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4318  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  31.28 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434511  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1093  extracellular solute-binding protein  31.75 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002574  ferric iron ABC transporter iron-binding protein  25.94 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000722094  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 		 346 aa  57  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1183  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 		 347 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0923795  normal  0.478437 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2534  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03435  hypothetical protein  25.28 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5196  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  26.46 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3699  extracellular solute-binding protein family 1  33.04 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0769  extracellular solute-binding protein  30.93 
 
 		 347 aa  55.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.302389  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0730  extracellular solute-binding protein  29.69 
 
 		 347 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1210  extracellular solute-binding protein  29.69 
 
 		 347 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13233  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1557  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 		 336 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2521  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1436  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  23.05 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1235  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.05 
 
 		 358 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1212  iron ABC transporter solute-binding protein  23.05 
 
 		 358 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1214  iron ABC transporter solute-binding protein  23.05 
 
 		 358 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1337  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.05 
 
 		 358 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0811  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 		 351 aa  54.7  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1476  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.05 
 
 		 358 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1411  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.05 
 
 		 358 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0742  extracellular solute-binding protein family 1  27.45 
 
 		 333 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5103  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3824  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 338 aa  55.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04877  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  26.01 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1359  extracellular solute-binding protein family 1  27.4 
 
 		 338 aa  54.3  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2913  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.15 
 
 		 336 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1990  putative regulatory lipoprotein  31.85 
 
 		 419 aa  54.3  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.307134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0844  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 335 aa  54.7  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.680673  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0861  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 335 aa  53.5  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5021  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 333 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5256  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 		 333 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3970  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.71 
 
 		 358 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0606  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 335 aa  53.1  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4877  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 		 340 aa  53.1  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  0.38801 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0314  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  25 
 
 		 333 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1526  ABC transporter, periplasmic binding protein  21.95 
 
 		 334 aa  52.4  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000766  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.34 
 
 		 336 aa  52.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4447  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 337 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.181234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1346  extracellular solute-binding protein family 1  29.44 
 
 		 349 aa  52  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0473337  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2416  extracellular solute-binding protein family 1  27.93 
 
 		 349 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000133122  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0744  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  25.84 
 
 		 335 aa  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  25.12 
 
 		 374 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  24.89 
 
 		 350 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 336 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2989  extracellular solute-binding protein family 1  29.65 
 
 		 348 aa  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1374  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.71 
 
 		 358 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  24.89 
 
 		 350 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5861  extracellular solute-binding protein  30.81 
 
 		 345 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3347  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 335 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1588  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 368 aa  51.2  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2919  extracellular solute-binding protein family 1  26.94 
 
 		 338 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0570  extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 		 341 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0244  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 		 333 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  23.45 
 
 		 349 aa  50.4  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3227  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 335 aa  50.1  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1092  extracellular solute-binding protein  24.87 
 
 		 337 aa  50.1  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000221625  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5962  putative iron ABC transporter binding protein subunit  25 
 
 		 332 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3817  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 335 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5874  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 		 341 aa  49.7  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47300  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  25.79 
 
 		 334 aa  49.3  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2430  extracellular solute-binding protein family 1  27.52 
 
 		 338 aa  49.3  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334988  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0579  extracellular solute-binding protein family 1  31.1 
 
 		 341 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  28.21 
 
 		 366 aa  49.3  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3517  extracellular solute-binding protein  28.47 
 
 		 335 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1554  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.202841  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1586  extracellular solute-binding protein family 1  26.59 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1350  iron(III) ABC transporter, permease protein, periplasmic iron(III)-binding protein  27.71 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.379147  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2710  iron(III)-binding periplasmic protein  27.49 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.452654  normal  0.0367844 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06280  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  27.5 
 
 		 363 aa  48.1  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.124476  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2856  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  30.87 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143151  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  21.9 
 
 		 349 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68900  putative binding protein component of ABC iron transporter  25.85 
 
 		 332 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.940616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  22.82 
 
 		 345 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3693  extracellular solute-binding protein  28.47 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0002551  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2070  extracellular solute-binding protein family 1  28.36 
 
 		 345 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>