More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2989 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  100 
 
 
397 aa  803    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2849  hypothetical protein  98.74 
 
 
397 aa  794    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  47.61 
 
 
397 aa  366  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0746  protein of unknown function DUF214  36.23 
 
 
407 aa  241  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3734  hypothetical protein  33.86 
 
 
412 aa  218  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637974  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  34.47 
 
 
405 aa  212  7.999999999999999e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  33.17 
 
 
405 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  32.93 
 
 
405 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5199  putative permease of ABC transporter  33.08 
 
 
423 aa  206  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0520248  normal  0.0790722 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60780  ABC transporter permease  32.57 
 
 
397 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4095  hypothetical protein  32.48 
 
 
406 aa  199  9e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.591324  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5233  ABC transporter permease  31.81 
 
 
397 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  30.77 
 
 
406 aa  194  2e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  31.84 
 
 
401 aa  192  6e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  32.6 
 
 
391 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  32.85 
 
 
409 aa  191  2e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  32.93 
 
 
407 aa  191  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  32.57 
 
 
402 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  31.25 
 
 
405 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  33.09 
 
 
400 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  33.25 
 
 
409 aa  189  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  32.43 
 
 
409 aa  188  1e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3982  protein of unknown function DUF214  31.33 
 
 
406 aa  187  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4027  protein of unknown function DUF214  29.1 
 
 
404 aa  187  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  32.69 
 
 
408 aa  187  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  30.47 
 
 
402 aa  186  6e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  30.79 
 
 
406 aa  186  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  30.47 
 
 
402 aa  186  6e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  31.28 
 
 
400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  33.17 
 
 
402 aa  183  5.0000000000000004e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  32.27 
 
 
400 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  31.41 
 
 
409 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  34.14 
 
 
404 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  32.12 
 
 
406 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  30.98 
 
 
409 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  31.63 
 
 
405 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  29.53 
 
 
400 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  31.23 
 
 
392 aa  179  7e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  34.38 
 
 
410 aa  179  7e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  31.8 
 
 
408 aa  179  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  30.52 
 
 
647 aa  178  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  33.73 
 
 
409 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  29.25 
 
 
417 aa  178  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  31.51 
 
 
649 aa  177  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  31.88 
 
 
405 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  31.88 
 
 
405 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  29.13 
 
 
406 aa  177  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  31.45 
 
 
409 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  31.45 
 
 
409 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  31.22 
 
 
398 aa  176  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  31.5 
 
 
401 aa  176  6e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  33.41 
 
 
403 aa  176  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  31.36 
 
 
696 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  29.24 
 
 
405 aa  174  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  30.67 
 
 
400 aa  173  5.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  31.06 
 
 
394 aa  172  5.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  30.98 
 
 
410 aa  172  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  30.98 
 
 
410 aa  172  9e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  31.51 
 
 
650 aa  172  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  30.47 
 
 
412 aa  170  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  30.32 
 
 
405 aa  170  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  31.22 
 
 
651 aa  169  9e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  29.22 
 
 
412 aa  168  1e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  29.6 
 
 
403 aa  169  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  29.9 
 
 
657 aa  169  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  32.92 
 
 
394 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  30.15 
 
 
400 aa  167  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  29.68 
 
 
413 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  30.5 
 
 
403 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  29.37 
 
 
658 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  30.08 
 
 
401 aa  166  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.36 
 
 
678 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  31.07 
 
 
707 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  31.17 
 
 
653 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  31.36 
 
 
678 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  31.36 
 
 
678 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  31.75 
 
 
394 aa  164  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  29.7 
 
 
401 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  29.41 
 
 
656 aa  164  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  29.7 
 
 
401 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  29.53 
 
 
652 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  31.63 
 
 
398 aa  163  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3269  hypothetical protein  33.41 
 
 
417 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392624  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  30.86 
 
 
409 aa  163  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  29.75 
 
 
399 aa  163  6e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  30.12 
 
 
443 aa  162  9e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  29.06 
 
 
418 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  30.4 
 
 
643 aa  162  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2918  protein of unknown function DUF214  31.3 
 
 
405 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.393852  normal  0.599334 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7079  protein of unknown function DUF214  28.54 
 
 
452 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  31.54 
 
 
409 aa  161  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  30.28 
 
 
644 aa  161  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  30.51 
 
 
406 aa  160  3e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  32.01 
 
 
415 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  31.59 
 
 
409 aa  159  7e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  30.79 
 
 
670 aa  159  8e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0223  hypothetical protein  33.66 
 
 
401 aa  159  9e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  32.16 
 
 
408 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  29.33 
 
 
402 aa  158  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1452  hypothetical protein  32.14 
 
 
410 aa  158  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>