210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0951 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  100 
 
 
271 aa  559  1e-158  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  97.79 
 
 
271 aa  548  1e-155  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  58.8 
 
 
268 aa  293  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  55.51 
 
 
272 aa  274  1e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0240  hypothetical protein  29.15 
 
 
278 aa  124  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  33.48 
 
 
322 aa  122  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  31.64 
 
 
285 aa  122  7e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  37.02 
 
 
273 aa  122  8e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  29.39 
 
 
257 aa  121  1e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  33.48 
 
 
322 aa  120  2e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  34.56 
 
 
270 aa  118  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4400  hypothetical protein  35.16 
 
 
279 aa  117  2e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374202  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  30.91 
 
 
249 aa  117  2e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  30.45 
 
 
234 aa  116  4e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  30.45 
 
 
249 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2659  hypothetical protein  30.45 
 
 
249 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238854  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  30.45 
 
 
249 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0825  hypothetical protein  30.45 
 
 
249 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  30.45 
 
 
249 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3205  tol-pal system protein YbgF  30.45 
 
 
249 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  32.77 
 
 
265 aa  115  7e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  35.98 
 
 
271 aa  114  1e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0730  tol-pal system protein YbgF  31.82 
 
 
261 aa  114  2e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0686  tol-pal system protein YbgF  31.82 
 
 
261 aa  114  2e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379534  normal  0.398306 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0797  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 
252 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146467  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0675  hypothetical protein  30.32 
 
 
249 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0840445  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0757  tol-pal system protein YbgF  30.32 
 
 
252 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677323  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0692  tol-pal system protein YbgF  30.32 
 
 
249 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000467208  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2589  tol-pal system protein YbgF  30 
 
 
249 aa  111  1e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1627  transmembrane protein  31.08 
 
 
284 aa  111  1e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  35.64 
 
 
268 aa  110  2e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  35.64 
 
 
268 aa  110  2e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3922  putative transmembrane protein  30.32 
 
 
249 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111011  hitchhiker  0.00736661 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  35.64 
 
 
268 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  34.08 
 
 
304 aa  109  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2457  tol-pal system protein YbgF  30.45 
 
 
249 aa  108  9e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2673  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 
252 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423772  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0737  hypothetical protein  29.55 
 
 
274 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790435  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0798  hypothetical protein  28.96 
 
 
249 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00161054  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  32.72 
 
 
254 aa  107  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0767  tol-pal system protein YbgF  28.96 
 
 
249 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0348274  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0315  hypothetical protein  28.96 
 
 
249 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00113686  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  33.33 
 
 
274 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.28207e-08  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  32.29 
 
 
243 aa  105  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3887  hypothetical protein  28.51 
 
 
249 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  31.98 
 
 
274 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
248 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2048  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 
253 aa  102  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2094  tetratricopeptide TPR_2  28.18 
 
 
259 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0273  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 
243 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0105531  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  29.82 
 
 
251 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1697  tetratricopeptide domain-containing protein  29.01 
 
 
258 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  5.38849e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  31.88 
 
 
272 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2017  tol system periplasmic component  29.55 
 
 
305 aa  99.8  5e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.2216  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0177  tol-pal system protein YbgF  29.55 
 
 
300 aa  99.4  6e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.46859  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  38.46 
 
 
487 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  27.73 
 
 
253 aa  97.8  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0301  tol-pal system protein YbgF  25.77 
 
 
243 aa  97.4  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.658955  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  27.48 
 
 
262 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1348  putative transmembrane protein  28.18 
 
 
263 aa  95.9  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  27.08 
 
 
276 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3404  TPR repeat-containing protein  30.45 
 
 
268 aa  94  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0537  tol-pal system protein YbgF  27.39 
 
 
321 aa  93.6  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0780  tol-pal system protein YbgF  31.19 
 
 
265 aa  93.2  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2694  tol-pal system protein YbgF  28.57 
 
 
249 aa  92.4  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 
265 aa  92.4  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  30.4 
 
 
263 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  3.29093e-08  normal  0.329929 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  30.4 
 
 
263 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  4.22433e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  30.4 
 
 
263 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  6.12768e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  30.4 
 
 
263 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  9.73622e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  30.4 
 
 
263 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  30.4 
 
 
263 aa  90.5  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.23566e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  26.52 
 
 
261 aa  90.9  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  1.08782e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  30 
 
 
263 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.28041e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2337  tetratricopeptide region  27.39 
 
 
274 aa  90.5  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  1.23403e-08  normal  0.0632651 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 
265 aa  89.7  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  30 
 
 
263 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  1.35641e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2219  tetratricopeptide domain-containing protein  26.48 
 
 
252 aa  89.4  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85463  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  36.8 
 
 
269 aa  89.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  36.8 
 
 
269 aa  89.4  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.06098e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  36.8 
 
 
269 aa  89.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  6.55346e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1733  TPR domain-containing protein  25.1 
 
 
263 aa  89  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  30 
 
 
263 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
269 aa  88.6  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  1.1862e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  25.09 
 
 
275 aa  87.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  4.41439e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  26.13 
 
 
301 aa  87.8  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  39.47 
 
 
236 aa  87  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  37.61 
 
 
248 aa  86.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  30.77 
 
 
264 aa  86.7  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  2.29086e-08  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  29.55 
 
 
262 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.80184e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  29.55 
 
 
262 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  26.14 
 
 
254 aa  85.9  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  3.61839e-09  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  29.55 
 
 
262 aa  85.9  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  6.91126e-05  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  29.55 
 
 
262 aa  85.9  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1979  tol-pal system protein YbgF  28.05 
 
 
261 aa  85.5  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1725  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 
261 aa  85.5  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.039074 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3396  tol-pal system protein YbgF  25.91 
 
 
260 aa  85.1  1e-15  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14649  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  29.96 
 
 
262 aa  84.3  2e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  1.19726e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  26.95 
 
 
283 aa  84.3  2e-15  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  1.2222e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  36.44 
 
 
285 aa  83.6  3e-15  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>