More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0400 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0400  ABC transporter  100 
 
 
568 aa  1137    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.429151  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0690  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  49.47 
 
 
581 aa  543  1e-153  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.212037  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0313  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  48.77 
 
 
580 aa  514  1e-144  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.532143  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2069  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  39.72 
 
 
597 aa  432  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1461  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38 
 
 
605 aa  419  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.74 
 
 
601 aa  410  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451102  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.19 
 
 
580 aa  411  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.74 
 
 
632 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3238  ABC transporter related  38.33 
 
 
594 aa  408  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00207534  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1442  ABC transporter related  38.39 
 
 
606 aa  404  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  37.63 
 
 
619 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3434  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.49 
 
 
582 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1370  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.8 
 
 
598 aa  401  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15083  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4203  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  37.5 
 
 
650 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.089699 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.85 
 
 
608 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3546  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  38.64 
 
 
600 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  38.01 
 
 
586 aa  397  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.12 
 
 
627 aa  393  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.99 
 
 
641 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0332  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.74 
 
 
586 aa  393  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3249  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  37.75 
 
 
600 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2662  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.07 
 
 
597 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.66 
 
 
639 aa  392  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.74 
 
 
619 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3493  ABC transporter related  38.35 
 
 
594 aa  391  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.68417  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2950  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  37.88 
 
 
589 aa  387  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.183404  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3884  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.13 
 
 
597 aa  388  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1512  ABC transporter related  39.16 
 
 
611 aa  388  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00861332  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3098  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.39 
 
 
606 aa  386  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1830  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  37.65 
 
 
589 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01701  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  35.97 
 
 
625 aa  382  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2936  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.46 
 
 
593 aa  384  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3544  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.52 
 
 
629 aa  384  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  36.63 
 
 
598 aa  384  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  37.41 
 
 
586 aa  385  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1262  ABC transporter-related protein  37.65 
 
 
601 aa  385  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140001 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  36.92 
 
 
596 aa  382  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  38.4 
 
 
634 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2096  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  40.56 
 
 
616 aa  379  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.163444  hitchhiker  0.0014118 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0955  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.71 
 
 
644 aa  379  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  35.56 
 
 
601 aa  376  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.27279 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0969  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.71 
 
 
613 aa  375  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2021  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.28 
 
 
589 aa  379  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.47227  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3335  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  36.71 
 
 
634 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.509209  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1636  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  40.36 
 
 
568 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663719  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1024  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.71 
 
 
634 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2242  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  39.4 
 
 
595 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35119  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2049  ABC transporter, transmembrane region  37.95 
 
 
616 aa  376  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3140  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.36 
 
 
613 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15358  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1057  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.71 
 
 
644 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.681718  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  37.3 
 
 
593 aa  376  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.703712 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3665  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  35.49 
 
 
595 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3189  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  39.07 
 
 
601 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2002  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  39.4 
 
 
597 aa  372  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0160  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.48 
 
 
606 aa  372  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2086  ABC transporter related  35.8 
 
 
597 aa  369  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2119  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.15 
 
 
587 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.075672 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0882  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.84 
 
 
613 aa  372  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3232  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.05 
 
 
618 aa  371  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.012084  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  35.9 
 
 
594 aa  370  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3087  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.28 
 
 
620 aa  368  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1657  ABC transporter, ATP binding/permease protein  37.26 
 
 
681 aa  367  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1715  ABC transporter, ATP binding/permease protein  37.26 
 
 
599 aa  368  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.6745  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3622  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.07 
 
 
587 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.368262 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2914  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.41 
 
 
608 aa  369  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.502763  normal  0.227266 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1828  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.1 
 
 
600 aa  366  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.924491 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0008  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.17 
 
 
590 aa  366  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38 
 
 
603 aa  365  1e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4001  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.31 
 
 
617 aa  365  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.530118 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2515  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.87 
 
 
587 aa  363  3e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.296095 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49970  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  36.82 
 
 
588 aa  362  9e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0923957 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.08 
 
 
628 aa  362  1e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  35.74 
 
 
603 aa  361  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1659  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.9 
 
 
600 aa  359  6e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.184934 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  35.9 
 
 
598 aa  358  1.9999999999999998e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3698  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.97 
 
 
637 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0078  ABC transporter related  32.91 
 
 
643 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.503479  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0844  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38 
 
 
605 aa  356  7.999999999999999e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2153  ABC transporter ATP-binding protein  34.21 
 
 
586 aa  356  7.999999999999999e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  34.91 
 
 
601 aa  355  8.999999999999999e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.71 
 
 
614 aa  355  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2067  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.39 
 
 
586 aa  355  1e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1202  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  39.16 
 
 
608 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238414  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2254  ABC efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  39.8 
 
 
578 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0852  lipid A ABC exporter family  38.22 
 
 
602 aa  353  4e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00564413  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  35.09 
 
 
614 aa  353  4e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1985  ABC transporter related  35.25 
 
 
597 aa  353  5.9999999999999994e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.384542  normal  0.0512994 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0918  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.43 
 
 
616 aa  353  7e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.624051  normal  0.180079 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2313  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  36.64 
 
 
622 aa  352  7e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0680321 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1607  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  33.8 
 
 
590 aa  352  8.999999999999999e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.343192 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3237  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  39.15 
 
 
631 aa  351  2e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0279116 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3326  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  37.17 
 
 
600 aa  351  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  36.17 
 
 
600 aa  350  3e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2635  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  38.08 
 
 
618 aa  350  4e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.239281 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01193  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.84 
 
 
589 aa  349  9e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.169603  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0928  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  39.8 
 
 
595 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.141758 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0646  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.53 
 
 
592 aa  348  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.35294  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2356  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.88 
 
 
618 aa  348  2e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  34.38 
 
 
618 aa  344  2e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  33.9 
 
 
579 aa  343  4e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>