More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1207 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1207  cysteine synthase  100 
 
 		 322 aa  669    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2745  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit:ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  57.14 
 
 		 685 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278132  normal  0.0380808 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2960  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family/ornithine cyclodeaminase family protein  58.68 
 
 		 707 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.76325  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0339  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  49.51 
 
 		 330 aa  318  6e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.793635 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1884  Cysteine synthase  49.18 
 
 		 333 aa  299  4e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.171295  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3071  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  47.34 
 
 		 363 aa  288  8e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.178624  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1672  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.7 
 
 		 330 aa  279  5e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0103  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  41.94 
 
 		 326 aa  228  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000135752  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0107  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.94 
 
 		 326 aa  228  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000822794  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6948  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.37 
 
 		 333 aa  227  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0590  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.43 
 
 		 336 aa  222  6e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11413  putative cysteine synthase  40.07 
 
 		 325 aa  219  7e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.63655  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0417  cysteine synthase A protein  39.86 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0440499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1117  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, subunit beta  37.7 
 
 		 341 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000129584  normal  0.764642 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3877  Cysteine synthase  41.69 
 
 		 338 aa  211  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1863  cysteine synthase  39.46 
 
 		 340 aa  209  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0366  cysteine synthase  39.38 
 
 		 340 aa  207  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0500011 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4292  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.37 
 
 		 364 aa  189  7e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.713465  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0203  cysteine synthase  36.72 
 
 		 372 aa  189  8e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000292068  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  33.7 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3752  putative cysteine synthase (O-acetylserine sulfhydrylase) (O-acetylserine (thiol)-lyase) (CSase)  33.45 
 
 		 351 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0264452  normal  0.188869 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2368  cysteine synthase  34.05 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  34.78 
 
 		 302 aa  156  4e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  33.45 
 
 		 315 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.23 
 
 		 465 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0383  cysteine synthase  35.13 
 
 		 315 aa  155  9e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0544064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  33.68 
 
 		 461 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  33.21 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  35.38 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  34.62 
 
 		 311 aa  152  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.77 
 
 		 453 aa  152  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3005  cysteine synthase B  34.64 
 
 		 308 aa  152  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.951108  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3163  cysteine synthase  34.36 
 
 		 354 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1096  cysteine synthase  34.02 
 
 		 299 aa  152  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.365638 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1687  cysteine synthase  34.41 
 
 		 315 aa  151  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00358215  hitchhiker  0.00000672149 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0633  putative cysteine synthase (O-acetylserine sulfhydrylase) (O-acetylserine (Thiol)-lyase) (CSase)  32.41 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.343914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  31.71 
 
 		 454 aa  150  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  36.07 
 
 		 307 aa  149  6e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  31.46 
 
 		 346 aa  148  9e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  31.83 
 
 		 345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3871  cysteine synthase  34.05 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3210  cysteine synthase A  33.33 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112501  normal  0.950187 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  36.56 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  32.97 
 
 		 302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  32.86 
 
 		 304 aa  146  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.33 
 
 		 333 aa  146  6e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1358  cysteine synthase  34.52 
 
 		 316 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.34 
 
 		 479 aa  145  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  36.33 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1347  cysteine synthase A  32.66 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0350194 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0178  cysteine synthase A  35.49 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0627608  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0488  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.95 
 
 		 456 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1698  cysteine synthase  33.69 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0137932  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0797  cysteine synthase B  33.56 
 
 		 299 aa  143  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  32.35 
 
 		 479 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2623  cysteine synthase A  34.65 
 
 		 329 aa  143  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1005  cysteine synthase B  34.29 
 
 		 294 aa  144  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.817675  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  30.8 
 
 		 304 aa  143  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  35.67 
 
 		 304 aa  143  4e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  33.92 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0166  cysteine synthase family protein  33.09 
 
 		 302 aa  143  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0964  cysteine synthase B  33.69 
 
 		 297 aa  143  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1255  cysteine synthase B  35.13 
 
 		 312 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152363  hitchhiker  0.00382615 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  33.33 
 
 		 303 aa  142  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  33.8 
 
 		 298 aa  142  6e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2538  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.81 
 
 		 352 aa  142  7e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.655107 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  31.62 
 
 		 326 aa  142  7e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02140  cysteine synthase  32.99 
 
 		 317 aa  142  8e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.445604  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1654  cysteine synthase B  34.77 
 
 		 299 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0738123  normal  0.776685 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1899  cysteine synthase B  34.52 
 
 		 295 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.512952  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  33.33 
 
 		 305 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1804  cysteine synthase A  31.14 
 
 		 334 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  36.11 
 
 		 309 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4064  cysteine synthase B  34.77 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.606315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1636  cysteine synthase B  33.33 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2678  cysteine synthase  32.5 
 
 		 318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  36.11 
 
 		 309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3277  cysteine synthase B  34.02 
 
 		 293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3903  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.49 
 
 		 338 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  32.13 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1215  cysteine synthase B  34.41 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1228  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1362  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  31.23 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.314138  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0938  cysteine synthase  33.81 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.685376 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2304  cysteine synthase  35.23 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  30.99 
 
 		 455 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  32.63 
 
 		 290 aa  140  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03155  cystathionine beta-synthase  30.8 
 
 		 464 aa  140  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140599  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  33.45 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  36.84 
 
 		 317 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1861  cysteine synthase B  35.23 
 
 		 295 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  32.79 
 
 		 456 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1967  cysteine synthase  32.97 
 
 		 326 aa  139  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.237562  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5856  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.01 
 
 		 368 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.977841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7559  cysteine synthase  32.39 
 
 		 315 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1770  cystathionine beta-synthase  32.41 
 
 		 456 aa  139  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00709311  hitchhiker  0.000202602 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  33.56 
 
 		 454 aa  139  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  32.41 
 
 		 454 aa  139  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  31.25 
 
 		 291 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1632  cysteine synthase A  32.28 
 
 		 349 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>