More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6146 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 267 aa  549  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154927  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1007  enoyl-CoA hydratase  80.38 
 
 		 268 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0394132  normal  0.416102 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  78.63 
 
 		 263 aa  434  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  74.52 
 
 		 260 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4597  enoyl-CoA hydratase  75.38 
 
 		 270 aa  397  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  69.32 
 
 		 258 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5145  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.149843 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.8 
 
 		 264 aa  178  9e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.71 
 
 		 287 aa  168  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4549  enoyl-CoA hydratase  39.53 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0140  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.4 
 
 		 264 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0194  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.64 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0122  enoyl-CoA hydratase  38.02 
 
 		 264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.65 
 
 		 267 aa  162  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  35.57 
 
 		 259 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2583  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 		 269 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.601041  normal  0.0270036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 		 273 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  35.6 
 
 		 263 aa  159  6e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4044  enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5501  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.38 
 
 		 264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  35.8 
 
 		 259 aa  155  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  36.11 
 
 		 261 aa  153  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  36.12 
 
 		 263 aa  153  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  38.17 
 
 		 263 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  38.17 
 
 		 263 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  38.17 
 
 		 263 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  38.17 
 
 		 263 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  38.17 
 
 		 263 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  38.17 
 
 		 263 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  38.17 
 
 		 263 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1594  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.26 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  34.27 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4185  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.3 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  32.05 
 
 		 265 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.84 
 
 		 267 aa  149  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.85 
 
 		 271 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.58 
 
 		 271 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.29 
 
 		 264 aa  148  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  35.14 
 
 		 262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.94 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  35.88 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.05 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  32.44 
 
 		 264 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  35 
 
 		 263 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 		 260 aa  145  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.87 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  31.92 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.94 
 
 		 264 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  36.82 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0151  enoyl-CoA hydratase  37.1 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  31.54 
 
 		 262 aa  143  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2224  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  34.9 
 
 		 260 aa  142  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549039  hitchhiker  0.0000374036 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0228  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.13 
 
 		 279 aa  142  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.03 
 
 		 255 aa  142  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.82 
 
 		 260 aa  142  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.73 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  34.66 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  33.06 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.91 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  31.75 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.3 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 		 261 aa  140  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.72 
 
 		 256 aa  140  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  34.25 
 
 		 261 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.5 
 
 		 264 aa  140  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  31.4 
 
 		 259 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4765  enoyl-CoA hydratase  36.74 
 
 		 260 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991647  normal  0.447028 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5507  enoyl-CoA hydratase  36.74 
 
 		 260 aa  138  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.24 
 
 		 274 aa  138  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 		 262 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5354  enoyl-CoA hydratase  36.74 
 
 		 260 aa  138  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.7 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2540  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.64 
 
 		 263 aa  138  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.893236  normal  0.33655 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 		 264 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.5 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  32.23 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  31.76 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.5 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  34.47 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  34.3 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.58 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  30.8 
 
 		 267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.34 
 
 		 257 aa  136  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2750  enoyl-CoA hydratase  35.48 
 
 		 254 aa  136  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33170  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  33.48 
 
 		 251 aa  135  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.119109  normal  0.701419 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34 
 
 		 260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  34.85 
 
 		 263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.08 
 
 		 260 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.06 
 
 		 259 aa  135  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.08 
 
 		 260 aa  135  8e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  34.34 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  33.08 
 
 		 266 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.73 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>