167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4024 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4024  peptidase M50  100 
 
 		 223 aa  441  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3277  peptidase M50  77.03 
 
 		 222 aa  345  3e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3710  peptidase M50  79.72 
 
 		 222 aa  342  2.9999999999999997e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3437  peptidase M50  77.38 
 
 		 228 aa  334  7.999999999999999e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.418421 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2770  peptidase M50  77.38 
 
 		 228 aa  333  1e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5414  peptidase M50  77.13 
 
 		 260 aa  330  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3239  peptidase M50  72.94 
 
 		 222 aa  324  7e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.345488  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1002  peptidase M50  69.51 
 
 		 222 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693021  hitchhiker  0.000264691 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1430  peptidase M50  64.86 
 
 		 220 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.899335 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1903  M50 family peptidase  62.61 
 
 		 221 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1624  peptidase M50  63.76 
 
 		 227 aa  280  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1681  M50 family peptidase  62.16 
 
 		 221 aa  279  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2183  M50 family peptidase  62.16 
 
 		 221 aa  279  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3134  M50 family peptidase  62.16 
 
 		 221 aa  279  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524339  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2622  M50 family peptidase  62.16 
 
 		 221 aa  279  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1456  M50 family peptidase  62.16 
 
 		 221 aa  279  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.848737  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2568  M50 family peptidase  61.71 
 
 		 221 aa  277  7e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1102  peptidase M50  60.99 
 
 		 221 aa  276  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1582  peptidase M50  62.61 
 
 		 220 aa  276  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453611  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2551  peptidase M50  62.61 
 
 		 220 aa  277  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00369558  normal  0.148044 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0984  peptidase M50  61.29 
 
 		 221 aa  274  7e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0881393 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5404  peptidase M50  61.26 
 
 		 220 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.535457  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5979  peptidase M50  61.54 
 
 		 220 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189316  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2098  peptidase M50  61.54 
 
 		 220 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2116  peptidase M50  61.54 
 
 		 220 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00340207 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1066  peptidase M50  60.99 
 
 		 221 aa  270  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.128232  normal  0.764642 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2135  peptidase M50  60.81 
 
 		 220 aa  270  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1080  peptidase M50  60.37 
 
 		 221 aa  270  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2008  peptidase M50  60.81 
 
 		 220 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672002  hitchhiker  0.0000725285 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1176  peptidase M50  60.36 
 
 		 220 aa  262  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267002 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0475  peptidase M50  61.4 
 
 		 239 aa  257  9e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1339  peptidase M50  60.85 
 
 		 220 aa  239  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000024793 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1142  integral membrane transmembrane protein  54.59 
 
 		 225 aa  235  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1685  peptidase M50  52.11 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.800401  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1526  putative integral membrane transmembrane protein  56.04 
 
 		 234 aa  200  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0750535 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1875  peptidase M50  60.31 
 
 		 213 aa  199  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0980  hypothetical protein  49.02 
 
 		 219 aa  190  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0950  hypothetical protein  49.02 
 
 		 219 aa  190  1e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1465  peptidase M50  54.27 
 
 		 219 aa  184  8e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.658602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1788  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  54.27 
 
 		 219 aa  184  8e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2316  peptidase M50  54.55 
 
 		 216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2016  peptidase M50  47.29 
 
 		 227 aa  179  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0347485  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1456  peptidase M50  49.5 
 
 		 218 aa  175  5e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3219  peptidase M50  52.94 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1229  peptidase M50  47.34 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000442117  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2251  peptidase M50  43.89 
 
 		 226 aa  168  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694823  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1961  peptidase M50  46.61 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1937  peptidase, M50 family protein  45.36 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000010669  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2208  hypothetical protein  45.64 
 
 		 205 aa  166  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1037  peptidase M50  47.14 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.489327  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2248  peptidase M50  52.13 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0256  membrane endopeptidase, M50 family  45.36 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1519  peptidase M50  51.72 
 
 		 234 aa  165  5e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1834  M50 family peptidase  43.04 
 
 		 226 aa  164  9e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143147  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1298  Zn-dependent proteases  48.48 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1776  peptidase M50  47.62 
 
 		 228 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00724949  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1924  peptidase M50  45.25 
 
 		 226 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2299  peptidase M50  44.8 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2460  peptidase M50  49.53 
 
 		 217 aa  159  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.754633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2485  peptidase M50  46.46 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.904327  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3737  peptidase M50  53.55 
 
 		 224 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.893092  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1271  peptidase M50  48.86 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194788  normal  0.0570245 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1686  peptidase M50  44.54 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.156673  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1881  peptidase M50  42.54 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000148344  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0681  peptidase M50  43.93 
 
 		 221 aa  148  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.259408  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2756  peptidase M50  42.48 
 
 		 232 aa  148  7e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0766  peptidase M50  46.99 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.209931  normal  0.716111 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3547  hypothetical protein  50.27 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1036  peptidase M50  43.87 
 
 		 223 aa  142  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.375981  normal  0.481389 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3608  M50 family peptidase  37.74 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1231  peptidase M50  38.5 
 
 		 216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2826  peptidase M50  40.69 
 
 		 224 aa  138  7e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0033  peptidase M50  42.27 
 
 		 224 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0952  peptidase M50  41.67 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2335  peptidase M50  37.93 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1202  peptidase M50  40.31 
 
 		 224 aa  127  9.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0751  peptidase M50  37.63 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1225  peptidase M50  41.45 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.460426  normal  0.363921 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1624  peptidase M50  40.98 
 
 		 225 aa  125  7e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0374548  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3859  peptidase M50  40.68 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1132  peptidase M50  38.61 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.262722  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1301  peptidase M50  45.9 
 
 		 198 aa  122  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1132  peptidase M50  38.2 
 
 		 246 aa  122  4e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1326  peptidase M50  40.56 
 
 		 225 aa  121  8e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38165  normal  0.352309 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0830  M50 family peptidase  44.32 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.115362  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2088  peptidase M50  38.46 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.56108 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1686  peptidase M50  44.24 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0720  peptidase M50  40.87 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.089532  normal  0.0115297 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0386  peptidase M50  36.87 
 
 		 220 aa  118  6e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0579866  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1470  peptidase M50  41 
 
 		 200 aa  118  7.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2170  peptidase M50  44.1 
 
 		 222 aa  118  9e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141859  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5469  peptidase, M50 family  32.73 
 
 		 224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5170  peptidase M50  33.5 
 
 		 224 aa  115  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5225  hypothetical protein  32.73 
 
 		 224 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5625  hypothetical protein  32.73 
 
 		 224 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2259  peptidase M50  37.56 
 
 		 214 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5555  peptidase, M50 family  32.73 
 
 		 224 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5058  membrane protein; metalloprotease  32.27 
 
 		 224 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5073  membrane protein; metalloprotease  32.27 
 
 		 224 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0801  peptidase M50  37.76 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>