177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003645 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003645  permease  100 
 
 		 295 aa  572  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.436376  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02200  hypothetical protein  84.21 
 
 		 294 aa  462  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3644  hypothetical protein  66.32 
 
 		 293 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3337  hypothetical protein  70 
 
 		 298 aa  409  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.491654 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0682  hypothetical protein  70.69 
 
 		 299 aa  394  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.095942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2433  hypothetical protein  61.72 
 
 		 294 aa  301  8.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21912  normal  0.079185 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3565  DMT family permease  55.56 
 
 		 291 aa  296  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4124  hypothetical protein  30.86 
 
 		 285 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000621435  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4245  hypothetical protein  30.48 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000122262  hitchhiker  0.00219233 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  29.64 
 
 		 318 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3499  hypothetical protein  31.72 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290777  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0215  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.11 
 
 		 285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000175088  normal  0.378069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  32.11 
 
 		 293 aa  109  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  31.12 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0213  hypothetical protein  30.11 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223398  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4244  PecM protein  30.94 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.1 
 
 		 314 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  29.31 
 
 		 324 aa  97.8  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3933  hypothetical protein  30.97 
 
 		 284 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000367698  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4527  integral membrane domain-containing protein  31.6 
 
 		 284 aa  94.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3735  hypothetical protein  30.86 
 
 		 284 aa  94  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.486754 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3806  hypothetical protein  30.86 
 
 		 284 aa  94  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.305382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25270  predicted permease, DMT superfamily  32.82 
 
 		 291 aa  93.2  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3106  hypothetical protein  28.99 
 
 		 299 aa  92.4  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4094  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.71 
 
 		 317 aa  91.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.466006  normal  0.380638 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.14 
 
 		 302 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  29.63 
 
 		 294 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  29.63 
 
 		 294 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.39 
 
 		 290 aa  89  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  27.99 
 
 		 290 aa  89.4  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0151  putative transmembrane protein  34.57 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0551496  normal  0.867935 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  27.41 
 
 		 307 aa  86.7  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  29.86 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4210  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.99 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.36 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2764  hypothetical protein  31.02 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.876324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0088  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.27 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.529373  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0070  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.21 
 
 		 288 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2401  hypothetical protein  28.26 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2455  hypothetical protein  27.27 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0619  hypothetical protein  27.17 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2545  hypothetical protein  27.9 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3501  hypothetical protein  26.42 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.43 
 
 		 349 aa  65.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  25.76 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  25.76 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  25.76 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0391  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.59 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598398  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2455  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.43 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2279  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.88 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136903  normal  0.215844 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2376  hypothetical protein  27.48 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0860299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.25 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  29.02 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  24.92 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  27.38 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  27 
 
 		 343 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  27 
 
 		 293 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.72 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.81 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  27 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3677  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.38 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  27 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  27.96 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  29.9 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.58 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  27.11 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  27.11 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  27.11 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.56 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.36 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  24.57 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2416  hypothetical protein  23.46 
 
 		 299 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0994864  normal  0.0254261 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3425  hypothetical protein  26.07 
 
 		 297 aa  53.9  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3679  putative integral membrane protein  26.78 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.998633  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01886  hypothetical protein  26.15 
 
 		 292 aa  52.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  22.92 
 
 		 296 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.26 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.76 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3261  hypothetical protein  26.88 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1780  SMR family transporter-like protein  23.34 
 
 		 322 aa  50.8  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  22.92 
 
 		 296 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0178  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  26.04 
 
 		 294 aa  50.4  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  23.08 
 
 		 287 aa  50.1  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2483  hypothetical protein  23.94 
 
 		 293 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0867101 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2612  hypothetical protein  23.94 
 
 		 322 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  25.29 
 
 		 294 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  25.29 
 
 		 294 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  22.26 
 
 		 299 aa  49.7  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0169  hypothetical protein  22.59 
 
 		 311 aa  49.7  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.6 
 
 		 294 aa  49.7  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2080  hypothetical protein  22.57 
 
 		 494 aa  49.7  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2045  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.22 
 
 		 315 aa  49.3  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3173  hypothetical protein  28.09 
 
 		 297 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  0.1324 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1451  hypothetical protein  25.76 
 
 		 307 aa  49.3  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.680814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  24.43 
 
 		 293 aa  49.3  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.51 
 
 		 299 aa  48.9  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.57 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1111  hypothetical protein  24.46 
 
 		 392 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.948246  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  24.64 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>