148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000832 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000832  outer membrane protein C precursor  100 
 
 		 331 aa  671    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0331596  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001437  non-specific porin  53.98 
 
 		 352 aa  346  3e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.524484  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0427  putative outer membrane pore protein  53.64 
 
 		 340 aa  338  7e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06284  hypothetical protein  54.6 
 
 		 352 aa  335  5e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06741  hypothetical protein  49.85 
 
 		 330 aa  298  9e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0666  porin  45.05 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00111405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3669  porin  31.25 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0276  porin  31.25 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3873  porin  31.25 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0642035 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0312  outer membrane porin, putative  31.25 
 
 		 384 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04813  hypothetical protein  27.2 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4055  porin  29.89 
 
 		 384 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4173  porin  29.89 
 
 		 384 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3060  outer membrane porin, putative  28.12 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1515  porin  31.43 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000337456  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2761  outer membrane porin protein C  31.43 
 
 		 371 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000019147  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05099  porin  28.01 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1444  outer membrane porin protein C  31.43 
 
 		 371 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000996913  normal  0.640308 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2839  outer membrane porin protein C  31.43 
 
 		 371 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001232  outer membrane protein OmpU  26.05 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0870457  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1487  porin  27.68 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.911374 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4086  porin  29.31 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3977  porin Gram-negative type  29.31 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3681  porin  27.75 
 
 		 384 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3336  outer membrane porin, putative  31.68 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2229  porin  28.41 
 
 		 382 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.218103  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2283  porin  23.79 
 
 		 385 aa  67  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2434  porin  26.79 
 
 		 389 aa  67  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.775403  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3264  outer membrane porin protein C  29.11 
 
 		 370 aa  67  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00668257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0680  porin  30.73 
 
 		 388 aa  67  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.424836  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2197  outer membrane protein  27.3 
 
 		 357 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1679  porin  26.95 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512961  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2557  porin  28.49 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.40328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3084  porin  29.61 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  decreased coverage  0.00000268212 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001436  non-specific porin  26.93 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154506  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1654  porin  29.71 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000730706  normal  0.12603 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1631  porin  29.71 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000133613  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2723  porin Gram-negative type  29.71 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000866519  hitchhiker  0.00000818773 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3603  porin  27.24 
 
 		 402 aa  62.8  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000908733  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1620  porin  29.71 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000207941  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1641  outer membrane protein N  27.04 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  0.976453 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2839  porin  30.05 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00468418 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3366  porin  25 
 
 		 385 aa  62  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2481  porin  29.63 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000211873  hitchhiker  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2553  porin  26.5 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.437604 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1730  porin  31.72 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00293132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2778  outer membrane protein N  27.23 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.704962  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2857  porin  27.23 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454817  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1821  outer membrane porin, putative  30.97 
 
 		 398 aa  59.7  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1322  outer membrane protein C2  27.23 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2083  gram-negative porin family protein  27.19 
 
 		 366 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1750  outer membrane porin protein LC  27.27 
 
 		 362 aa  59.3  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.778273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1689  outer membrane porin protein LC  27.27 
 
 		 362 aa  59.3  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1687  outer membrane porin protein LC  27.27 
 
 		 362 aa  59.3  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.535168 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1770  outer membrane porin protein LC  27.27 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2654  porin  27.37 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.157647  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1665  porin Gram-negative type  25.78 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000257252  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2468  porin  30.92 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000293387  hitchhiker  0.000118178 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2536  porin  30.92 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000566311  unclonable  0.0000300208 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1784  porin Gram-negative type  26.18 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00154811  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2057  porin  26.39 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1702  porin family protein  27.19 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0189246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1448  porin  26.99 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0593743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1568  porin  25.42 
 
 		 403 aa  57  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  hitchhiker  0.00000152354 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1458  porin  29.41 
 
 		 365 aa  57  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2115  outer membrane protein N  27.88 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.829511  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2514  outer membrane protein N  27.88 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.127891 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2224  porin  27.88 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575083  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2628  porin  30.26 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000106502  hitchhiker  0.00000892589 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1251  outer membrane porin, putative  26.74 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000429036  hitchhiker  0.000137517 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06287  hypothetical protein  28.5 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2354  outer membrane porin protein C  26.41 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00268594  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1435  outer membrane porin protein C  26.41 
 
 		 376 aa  55.8  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.974185  normal  0.210914 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2559  outer membrane protein F  26.72 
 
 		 360 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000037634  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1037  outer membrane protein F  26.87 
 
 		 362 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000488881  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2667  outer membrane protein F  26.87 
 
 		 362 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000513703  normal  0.141925 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0295  outer membrane phosphoporin protein E  26.49 
 
 		 351 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00372368 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0724  outer membrane porin protein C  26.41 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.140015  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00238  outer membrane phosphoporin protein E  26.32 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.86907  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3366  porin Gram-negative type  26.12 
 
 		 351 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2451  outer membrane porin protein C  25.07 
 
 		 378 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487875 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0767  outer membrane phosphoporin protein E  25.47 
 
 		 350 aa  55.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0774266 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0230  putative outer membrane protein  24.51 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0273  outer membrane phosphoporin protein E  26.12 
 
 		 351 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.664027  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00241  hypothetical protein  26.32 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.693331  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2610  outer membrane porin protein C  25.07 
 
 		 378 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.440954 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0286  outer membrane phosphoporin protein E  26.12 
 
 		 351 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.172379  normal  0.530203 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2507  outer membrane porin protein C  25.07 
 
 		 378 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0209108 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1701  outer membrane protein N  26.72 
 
 		 388 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.265921  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0268  outer membrane phosphoporin protein E  26.12 
 
 		 351 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3340  outer membrane phosphoporin protein E  26.12 
 
 		 351 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1666  porin Gram-negative type  31.77 
 
 		 379 aa  54.3  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000017605  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1968  porin  26.12 
 
 		 378 aa  53.9  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2795  outer membrane porin protein C  27.7 
 
 		 372 aa  53.9  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00922509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2514  outer membrane porin protein C  26.09 
 
 		 363 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000192905  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2191  outer membrane protein F  26.75 
 
 		 357 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.145959  normal  0.466733 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0238  outer membrane phosphoporin protein E  25.75 
 
 		 351 aa  53.9  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1582  outer membrane protein N  27.04 
 
 		 383 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.640646  normal  0.720278 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3353  outer membrane porin protein C  26.2 
 
 		 367 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.128498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2649  porin  27.91 
 
 		 360 aa  53.1  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000040387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>