More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2533 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  79.33 
 
 		 387 aa  649    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295013 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2973  3-ketoacyl-CoA thiolase  78.55 
 
 		 387 aa  646    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0022  3-ketoacyl-CoA thiolase  78.29 
 
 		 387 aa  641    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000376188 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0018  3-ketoacyl-CoA thiolase  78.5 
 
 		 387 aa  637    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001989  3-ketoacyl-CoA thiolase  91.43 
 
 		 391 aa  713    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0260  3-ketoacyl-CoA thiolase  79.53 
 
 		 387 aa  647    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.126316 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2533  3-ketoacyl-CoA thiolase  100 
 
 		 387 aa  792    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  79.07 
 
 		 387 aa  646    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00459  3-ketoacyl-CoA thiolase  91.44 
 
 		 374 aa  690    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0031  3-ketoacyl-CoA thiolase  78.24 
 
 		 387 aa  634    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.871061  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3950  3-ketoacyl-CoA thiolase  77.2 
 
 		 387 aa  628  1e-179  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0475823 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4189  3-ketoacyl-CoA thiolase  77.2 
 
 		 387 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4261  3-ketoacyl-CoA thiolase  77.2 
 
 		 387 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  77.46 
 
 		 387 aa  625  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4368  3-ketoacyl-CoA thiolase  77.2 
 
 		 387 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4308  3-ketoacyl-CoA thiolase  77.2 
 
 		 387 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4045  3-ketoacyl-CoA thiolase  75.91 
 
 		 387 aa  625  1e-178  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03736  acetyl-CoA acetyltransferase  76.68 
 
 		 387 aa  621  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03685  hypothetical protein  76.68 
 
 		 387 aa  621  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4212  3-ketoacyl-CoA thiolase  76.94 
 
 		 387 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  77.2 
 
 		 387 aa  623  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000928533 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4226  3-ketoacyl-CoA thiolase  76.94 
 
 		 387 aa  622  1e-177  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.032199  hitchhiker  0.00446338 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0023  3-ketoacyl-CoA thiolase  77.2 
 
 		 387 aa  623  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188213  hitchhiker  0.0000000293236 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4235  3-ketoacyl-CoA thiolase  75.39 
 
 		 387 aa  620  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4315  3-ketoacyl-CoA thiolase  76.68 
 
 		 387 aa  619  1e-176  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.75003  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  76.68 
 
 		 387 aa  619  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  76.68 
 
 		 387 aa  618  1e-176  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0282  3-ketoacyl-CoA thiolase  76.17 
 
 		 387 aa  617  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.185398  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1911  3-ketoacyl-CoA thiolase  76.17 
 
 		 387 aa  617  1e-176  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597206 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4165  3-ketoacyl-CoA thiolase  76.42 
 
 		 387 aa  618  1e-176  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  76.68 
 
 		 387 aa  618  1e-176  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3934  3-ketoacyl-CoA thiolase  76.17 
 
 		 387 aa  617  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  76.68 
 
 		 387 aa  618  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0898923  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5284  3-ketoacyl-CoA thiolase  76.68 
 
 		 387 aa  619  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0377447 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  76.68 
 
 		 387 aa  618  1e-176  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4136  acetyl-CoA C-acyltransferase FadA  76.17 
 
 		 387 aa  614  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4364  3-ketoacyl-CoA thiolase  75.91 
 
 		 387 aa  615  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.367821  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  76.42 
 
 		 387 aa  616  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.237064  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4068  3-ketoacyl-CoA thiolase  76.42 
 
 		 387 aa  617  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.142998  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0014  3-ketoacyl-CoA thiolase  76.68 
 
 		 387 aa  615  1e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0013127  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  75.91 
 
 		 387 aa  615  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3902  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.32 
 
 		 387 aa  594  1e-169  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0917762  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3748  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.54 
 
 		 387 aa  584  1e-166  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03737  3-ketoacyl-CoA thiolase  71.24 
 
 		 387 aa  580  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0202  3-ketoacyl-CoA thiolase  70.47 
 
 		 386 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0146484  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0392  3-ketoacyl-CoA thiolase  70.21 
 
 		 386 aa  564  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1579  3-ketoacyl-CoA thiolase  69.87 
 
 		 391 aa  535  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30524  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1145  3-ketoacyl-CoA thiolase  67.47 
 
 		 391 aa  530  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112887  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2137  3-ketoacyl-CoA thiolase  65.27 
 
 		 391 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.049086  normal  0.0941424 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3605  3-ketoacyl-CoA thiolase  65.27 
 
 		 391 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1677  3-ketoacyl-CoA thiolase  65.27 
 
 		 391 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213939 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1653  3-ketoacyl-CoA thiolase  65.27 
 
 		 391 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3516  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.23 
 
 		 391 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3289  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.23 
 
 		 391 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3878  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.49 
 
 		 391 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153532  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2146  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.75 
 
 		 391 aa  514  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25090  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.75 
 
 		 391 aa  514  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1581  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.61 
 
 		 391 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.353282 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14450  3-ketoacyl-CoA thiolase  67.54 
 
 		 391 aa  506  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2099  3-ketoacyl-CoA thiolase  65.27 
 
 		 390 aa  503  1e-141  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1933  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.45 
 
 		 390 aa  494  1e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132677  normal  0.226024 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2226  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.19 
 
 		 390 aa  491  9.999999999999999e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.857113  normal  0.149332 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1606  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.45 
 
 		 391 aa  484  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00425712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2392  3-ketoacyl-CoA thiolase  61.88 
 
 		 392 aa  474  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  49.25 
 
 		 403 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  47.9 
 
 		 401 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  45.93 
 
 		 398 aa  332  5e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1756  acetyl-CoA acetyltransferase  49.22 
 
 		 378 aa  332  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.84 
 
 		 391 aa  330  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  45.19 
 
 		 398 aa  330  4e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.15 
 
 		 412 aa  329  5.0000000000000004e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  47.15 
 
 		 400 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  46.91 
 
 		 402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  45.94 
 
 		 394 aa  326  4.0000000000000003e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0085  acetyl-CoA acetyltransferase  46.08 
 
 		 391 aa  326  5e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.78 
 
 		 402 aa  325  6e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2125  acetyl-CoA acetyltransferase  46.98 
 
 		 396 aa  325  7e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533302 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0659  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.9 
 
 		 401 aa  325  7e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.993676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0492  acetyl-CoA acetyltransferase  45.68 
 
 		 402 aa  325  8.000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3795  acetyl-CoA acetyltransferase  47.56 
 
 		 378 aa  325  8.000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  43.84 
 
 		 399 aa  323  3e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  44.95 
 
 		 390 aa  323  5e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6698  acetyl-CoA acetyltransferase  45.04 
 
 		 388 aa  322  7e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1532  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46 
 
 		 401 aa  321  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117462 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  46.63 
 
 		 402 aa  321  1.9999999999999998e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  45.55 
 
 		 400 aa  320  1.9999999999999998e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1743  acetyl-CoA acetyltransferase  48.32 
 
 		 378 aa  320  3e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  44.81 
 
 		 390 aa  320  3e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4393  acetyl-CoA acetyltransferase  46.33 
 
 		 392 aa  319  5e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.93 
 
 		 401 aa  318  1e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.93 
 
 		 401 aa  318  1e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  44.53 
 
 		 392 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.93 
 
 		 401 aa  318  1e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.93 
 
 		 401 aa  317  2e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4698  acetyl-CoA acetyltransferase  45.02 
 
 		 396 aa  317  3e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4085  acetyl-CoA acetyltransferase  46.88 
 
 		 399 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.802435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1508  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.28 
 
 		 401 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0554104  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3707  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.06 
 
 		 405 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.394558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1653  acetyl-CoA acetyltransferase  47.85 
 
 		 402 aa  312  6.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.302534  normal  0.125875 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0574  acetyl-CoA acetyltransferase  47.47 
 
 		 398 aa  311  1e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>