More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0450 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
365 aa  752  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  33.9 
 
 
350 aa  233  4e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0170  glycosyl transferase, group 1  34.55 
 
 
391 aa  216  4e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  33.24 
 
 
358 aa  209  6e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.88 
 
 
360 aa  182  6e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4843  glycosyl transferase, group 1  30.37 
 
 
395 aa  168  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000641905  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 
373 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  31.75 
 
 
351 aa  151  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5302  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
351 aa  149  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3693  glycosyl transferase, group 1  35.31 
 
 
371 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.419352 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  31.34 
 
 
363 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1066  glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 
368 aa  144  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0173089  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1885  glycosyl transferase, group 1  31.93 
 
 
389 aa  143  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  29.01 
 
 
384 aa  140  5e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6235  glycosyl transferase group 1  35.34 
 
 
381 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93613  normal  0.352956 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6431  glycosyl transferase group 1  33.92 
 
 
380 aa  132  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 
363 aa  130  4e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
384 aa  129  1e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  38.98 
 
 
360 aa  125  9e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0058  glycosyl transferase group 1  32.27 
 
 
366 aa  115  2e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145995  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  32.33 
 
 
398 aa  111  2e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  37.43 
 
 
396 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 
409 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  38 
 
 
355 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  39.25 
 
 
739 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2519  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  36.96 
 
 
384 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 
377 aa  103  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
378 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 
366 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 
373 aa  103  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  38.22 
 
 
374 aa  102  8e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0730  glycosyl transferase group 1  32.25 
 
 
343 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00119132  hitchhiker  0.00102221 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  34.32 
 
 
408 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  34.32 
 
 
408 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  32.97 
 
 
373 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  34.32 
 
 
408 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  43.2 
 
 
351 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  33.71 
 
 
401 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  35.61 
 
 
405 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  36.41 
 
 
389 aa  100  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 
360 aa  99.8  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 
424 aa  99.8  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  33.67 
 
 
401 aa  99.4  8e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2978  glycosyltransferase-like protein  27.27 
 
 
357 aa  99.4  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  32.95 
 
 
376 aa  98.6  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
414 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 
377 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  3.08882e-10 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1254  glycosyl transferase, group 1  37.32 
 
 
398 aa  98.2  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163689  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  34.34 
 
 
356 aa  98.2  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 
380 aa  98.2  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 
377 aa  97.4  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  33.89 
 
 
399 aa  97.4  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2859  glycosyl transferase, group 1  32.58 
 
 
354 aa  97.1  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
360 aa  97.1  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  28.33 
 
 
745 aa  96.7  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.56 
 
 
371 aa  96.7  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  35 
 
 
426 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 
378 aa  96.3  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 
374 aa  96.3  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  32.96 
 
 
378 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 
421 aa  96.3  8e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 
394 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  36.07 
 
 
394 aa  95.5  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 
414 aa  95.9  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 
369 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  34.46 
 
 
381 aa  94.7  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 
378 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3481  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 
344 aa  94.4  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  29.24 
 
 
403 aa  94  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  35.52 
 
 
391 aa  94  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4435  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 
400 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  28.66 
 
 
388 aa  94  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5718  glycosyl transferase, group 1  32.83 
 
 
411 aa  94  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
408 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  33.14 
 
 
381 aa  93.6  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 
410 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0244  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 
393 aa  93.2  6e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
407 aa  92.8  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  32.02 
 
 
353 aa  93.2  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  33.71 
 
 
371 aa  93.2  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.41 
 
 
378 aa  92.8  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0358  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 
310 aa  92.8  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  34.46 
 
 
350 aa  92.8  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1099  glycosyl transferase, group 1  32.32 
 
 
411 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.593469  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  27.55 
 
 
361 aa  91.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  36.94 
 
 
371 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 
377 aa  91.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  32.79 
 
 
379 aa  91.7  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3483  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 
385 aa  91.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0885784 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12393  Glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 
336 aa  90.9  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
372 aa  90.9  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  32 
 
 
403 aa  90.9  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 
377 aa  90.9  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  33.14 
 
 
414 aa  90.5  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2261  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 
430 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253326 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1381  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 
397 aa  90.5  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.17179e-10 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
419 aa  90.5  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 
374 aa  90.5  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  32.66 
 
 
403 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
904 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>