More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2011 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  100 
 
 		 662 aa  1346    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  72.56 
 
 		 319 aa  412  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  54.55 
 
 		 300 aa  286  9e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22710  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  45.4 
 
 		 345 aa  283  8.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3470  periplasmic binding protein  47.49 
 
 		 356 aa  282  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00150315  hitchhiker  0.00510017 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0418  twin-arginine translocation pathway signal  46.8 
 
 		 347 aa  281  3e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0419  periplasmic binding protein  50.88 
 
 		 344 aa  278  3e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.182541  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5065  periplasmic binding protein  45.85 
 
 		 336 aa  270  5.9999999999999995e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  40.24 
 
 		 324 aa  263  8.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4288  periplasmic binding protein  46.86 
 
 		 359 aa  261  3e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515343  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  43.88 
 
 		 324 aa  256  7e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  38.25 
 
 		 322 aa  251  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  37.65 
 
 		 322 aa  249  8e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  45.85 
 
 		 310 aa  249  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  44.44 
 
 		 309 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  41.5 
 
 		 321 aa  248  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  40.82 
 
 		 321 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  37.95 
 
 		 321 aa  244  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  37.95 
 
 		 321 aa  244  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  40.61 
 
 		 322 aa  243  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  40.82 
 
 		 321 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  40.82 
 
 		 321 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  40.82 
 
 		 321 aa  239  9e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4230  periplasmic binding protein  40.26 
 
 		 341 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973317  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  37.39 
 
 		 320 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  40.77 
 
 		 320 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  40.77 
 
 		 305 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  40.77 
 
 		 320 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  40.42 
 
 		 320 aa  232  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  40.42 
 
 		 320 aa  231  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  40.42 
 
 		 320 aa  231  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  40.42 
 
 		 320 aa  231  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  42.75 
 
 		 346 aa  231  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  41.07 
 
 		 321 aa  231  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  40.07 
 
 		 320 aa  230  6e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  41.94 
 
 		 316 aa  229  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5337  periplasmic binding protein  40.89 
 
 		 338 aa  221  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  0.734809 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  44.2 
 
 		 298 aa  218  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0133  periplasmic binding protein  43.91 
 
 		 306 aa  218  4e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2437  periplasmic binding protein  38.74 
 
 		 351 aa  213  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.0637289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  41.16 
 
 		 336 aa  208  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2692  periplasmic binding protein  40.21 
 
 		 349 aa  207  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.154596  normal  0.0870735 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5759  periplasmic binding protein  38.59 
 
 		 331 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3935  periplasmic binding protein  36.53 
 
 		 373 aa  204  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.427342  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3865  periplasmic binding protein  39.93 
 
 		 329 aa  200  6e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0853  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  37.16 
 
 		 349 aa  200  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2440  periplasmic binding protein  35.93 
 
 		 348 aa  193  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012115 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3735  periplasmic binding protein  36.68 
 
 		 361 aa  191  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0385  periplasmic binding protein  37.95 
 
 		 365 aa  189  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0375  periplasmic binding protein  36.98 
 
 		 315 aa  188  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  40.49 
 
 		 329 aa  187  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0200  periplasmic binding protein  34.77 
 
 		 322 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0270  twin-arginine translocation pathway signal  38.98 
 
 		 321 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0280  periplasmic binding protein  38.98 
 
 		 321 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0971022 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10269  periplasmic iron-transport lipoprotein  37.24 
 
 		 330 aa  182  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.110209 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0260  periplasmic binding protein  38.98 
 
 		 321 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0807  periplasmic binding protein  39.21 
 
 		 343 aa  182  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07950  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  40 
 
 		 349 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0346758  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0308  periplasmic binding protein  36.92 
 
 		 316 aa  181  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3909  periplasmic binding protein  38.14 
 
 		 341 aa  179  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  38.87 
 
 		 358 aa  178  3e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.311428  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4296  periplasmic binding protein  34.8 
 
 		 346 aa  176  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0463  periplasmic binding protein  37.32 
 
 		 308 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1043  periplasmic binding protein  35.94 
 
 		 340 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2317  periplasmic binding protein  35.76 
 
 		 345 aa  170  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1523  periplasmic binding protein  37.14 
 
 		 313 aa  168  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2940  periplasmic binding protein  35.21 
 
 		 316 aa  167  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1591  periplasmic binding protein  34.88 
 
 		 334 aa  167  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0300116 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3694  periplasmic binding protein  35.45 
 
 		 341 aa  166  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.792098  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  38.7 
 
 		 330 aa  166  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  38.7 
 
 		 330 aa  166  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22070  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  35.5 
 
 		 383 aa  164  6e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.162415 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2580  periplasmic binding protein  34.41 
 
 		 354 aa  163  9e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2827  periplasmic binding protein  31.86 
 
 		 332 aa  163  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.420364  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2670  periplasmic binding protein  34.65 
 
 		 351 aa  160  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30510  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  37.55 
 
 		 326 aa  158  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3331  transport system permease protein  33.12 
 
 		 324 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.411353  normal  0.472078 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2085  periplasmic binding protein  35.29 
 
 		 354 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000968789  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3522  periplasmic binding protein  33.55 
 
 		 333 aa  156  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3636  periplasmic binding protein  33 
 
 		 325 aa  155  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00284754 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4037  periplasmic binding protein  31.54 
 
 		 339 aa  154  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2409  periplasmic binding protein  33.45 
 
 		 333 aa  154  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0140485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3061  periplasmic binding protein  33 
 
 		 325 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260153  normal  0.218558 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3416  ABC Fe+3-siderophore transporter, periplasmic binding protein  32.67 
 
 		 325 aa  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  33.01 
 
 		 347 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.895091  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3759  periplasmic binding protein  33.7 
 
 		 316 aa  149  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.445069  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26550  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  31.8 
 
 		 348 aa  146  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511837  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36350  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  33.75 
 
 		 356 aa  145  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2819  periplasmic binding protein  32.48 
 
 		 349 aa  144  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5939  periplasmic binding protein  34.21 
 
 		 330 aa  140  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587353  normal  0.774281 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4510  periplasmic binding protein  32.19 
 
 		 317 aa  140  8.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  32.26 
 
 		 331 aa  137  5e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06470  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  31.75 
 
 		 353 aa  136  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1806  periplasmic binding protein  33.81 
 
 		 358 aa  136  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455628  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2699  periplasmic binding protein  32 
 
 		 305 aa  134  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.885635  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17020  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  31.85 
 
 		 346 aa  133  9e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.745589 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0269  periplasmic binding protein  32.41 
 
 		 338 aa  133  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1491  putative ABC transporter, periplasmic iron-siderophore binding protein  31.83 
 
 		 347 aa  130  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00253008  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  29.23 
 
 		 314 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2592  periplasmic binding protein  35.91 
 
 		 357 aa  130  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0366339  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>