More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0063 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.78 
 
 		 462 aa  680    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03616  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.76 
 
 		 460 aa  645    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4235  ATP synthase F1, beta subunit  68.76 
 
 		 460 aa  645    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0564  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.61 
 
 		 464 aa  662    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.257197  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.04 
 
 		 470 aa  670    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5413  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.46 
 
 		 458 aa  636    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.04 
 
 		 470 aa  666    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0012  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.18 
 
 		 460 aa  641    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.09 
 
 		 471 aa  672    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4607  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.25 
 
 		 458 aa  638    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.77 
 
 		 468 aa  671    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0062  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.38 
 
 		 461 aa  637    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.47 
 
 		 465 aa  652    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3956  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.68 
 
 		 463 aa  645    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0165608  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1799  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.67 
 
 		 521 aa  635    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469261  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4747  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.68 
 
 		 463 aa  645    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5599  ATP synthase F1, beta subunit  67.9 
 
 		 459 aa  640    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.18 
 
 		 469 aa  666    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.18 
 
 		 469 aa  666    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.3 
 
 		 476 aa  654    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.18 
 
 		 469 aa  666    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1732  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.67 
 
 		 521 aa  635    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.352683  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3053  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.76 
 
 		 458 aa  636    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2910  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.76 
 
 		 458 aa  636    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3845  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.48 
 
 		 458 aa  651    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208529 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5121  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.9 
 
 		 459 aa  641    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2024  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.03 
 
 		 477 aa  634    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.531003 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.63 
 
 		 470 aa  664    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0538  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.18 
 
 		 464 aa  656    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.120643  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3644  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.33 
 
 		 462 aa  645    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0562091  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3875  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.46 
 
 		 464 aa  644    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2797  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.11 
 
 		 459 aa  639    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0433  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 		 476 aa  645    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.36 
 
 		 482 aa  673    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2430  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.41 
 
 		 458 aa  645    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0681755  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3074  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.55 
 
 		 458 aa  638    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5730  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.46 
 
 		 458 aa  634    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2922  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.83 
 
 		 509 aa  643    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.1 
 
 		 468 aa  662    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.1 
 
 		 468 aa  662    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2201  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.53 
 
 		 475 aa  635    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.43 
 
 		 482 aa  687    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0408  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.39 
 
 		 480 aa  640    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.364668 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.09 
 
 		 462 aa  691    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.59 
 
 		 464 aa  670    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.26 
 
 		 470 aa  672    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.78 
 
 		 470 aa  650    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0467  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 		 475 aa  640    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.83426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.18 
 
 		 469 aa  666    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1105  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.31 
 
 		 517 aa  637    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4365  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.9 
 
 		 463 aa  645    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.58 
 
 		 464 aa  672    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  69.57 
 
 		 482 aa  670    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4366  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.9 
 
 		 463 aa  645    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521445  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1226  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.85 
 
 		 474 aa  640    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.877196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.7 
 
 		 462 aa  707    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16281  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 		 486 aa  636    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.210886  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4348  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.08 
 
 		 482 aa  643    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0265  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 		 476 aa  642    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.08 
 
 		 481 aa  649    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1049  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.72 
 
 		 474 aa  648    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.47 
 
 		 465 aa  652    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.87 
 
 		 471 aa  671    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0174  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.53 
 
 		 476 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0512  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.06 
 
 		 471 aa  656    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399895 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.25 
 
 		 465 aa  650    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3150  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.13 
 
 		 472 aa  663    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3752  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.55 
 
 		 463 aa  649    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00277276  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0559  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 		 476 aa  641    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.29252 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3284  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.26 
 
 		 458 aa  644    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0529  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.53 
 
 		 476 aa  642    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0290  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.02 
 
 		 469 aa  645    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00322689  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1181  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.38 
 
 		 468 aa  664    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.186447  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4332  F0F1 ATP synthase subunit beta  68 
 
 		 480 aa  640    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.551629  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2086  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 		 474 aa  643    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.531544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4462  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.03 
 
 		 458 aa  645    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.718336  hitchhiker  0.0000000225829 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16401  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 		 486 aa  637    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1638  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.75 
 
 		 513 aa  653    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0091219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4295  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.9 
 
 		 461 aa  646    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.797845  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.57 
 
 		 519 aa  661    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.07 
 
 		 465 aa  676    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.28 
 
 		 465 aa  678    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1696  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.55 
 
 		 457 aa  655    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3385  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.2 
 
 		 484 aa  650    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3925  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.46 
 
 		 463 aa  644    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0179078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4017  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.46 
 
 		 463 aa  645    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.436457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2869  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.76 
 
 		 458 aa  642    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.761227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4045  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.68 
 
 		 463 aa  644    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632906  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2382  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.6 
 
 		 476 aa  639    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2802  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.51 
 
 		 479 aa  636    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.472945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6356  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.9 
 
 		 458 aa  637    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73240  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.9 
 
 		 458 aa  637    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4132  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.55 
 
 		 460 aa  645    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.364679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0665  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.41 
 
 		 504 aa  673    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000014903  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1238  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.97 
 
 		 480 aa  648    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1869  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.31 
 
 		 466 aa  646    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0521  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.6 
 
 		 468 aa  642    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00662178  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.06 
 
 		 481 aa  665    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2582  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.24 
 
 		 469 aa  646    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.646569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5295  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.46 
 
 		 458 aa  636    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.122474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>