108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0042 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0042  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 		 866 aa  1762    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0345  VanW family protein  24.05 
 
 		 781 aa  135  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1823  hypothetical protein  24.29 
 
 		 569 aa  97.1  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2665  VanW family protein  24.37 
 
 		 686 aa  92.4  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000623276  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1251  hypothetical protein  21.97 
 
 		 591 aa  88.6  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0768  VanW family protein  23.01 
 
 		 636 aa  88.2  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.865985  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0036  VanW family protein  22.12 
 
 		 636 aa  83.6  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0004  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.04 
 
 		 171 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1425  VanW family protein  27.23 
 
 		 617 aa  83.2  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8063  vancomycin resistance protein- like protein  22.36 
 
 		 690 aa  81.6  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.470172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10350  hypothetical protein  32.37 
 
 		 507 aa  80.1  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.228348  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1933  VanW family protein  23.49 
 
 		 633 aa  78.2  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945976  hitchhiker  0.000000296122 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2153  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.3 
 
 		 398 aa  77.4  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0525  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.84 
 
 		 155 aa  75.9  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4950  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.37 
 
 		 206 aa  75.5  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2755  VanW family protein  24.39 
 
 		 670 aa  74.7  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.56 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2449  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.67 
 
 		 170 aa  72.8  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4187  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.82 
 
 		 407 aa  73.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2379  VanW family protein  21.83 
 
 		 675 aa  72  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.548137 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0879  VanW family protein  24.89 
 
 		 580 aa  71.2  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1613  VanW family protein  25.47 
 
 		 594 aa  69.7  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0632012  normal  0.156067 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.11 
 
 		 257 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1958  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24.58 
 
 		 498 aa  69.3  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00199371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.09 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3315  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.36 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.322288  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1018  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.89 
 
 		 481 aa  65.9  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.333846  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.85 
 
 		 370 aa  65.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0524  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.84 
 
 		 177 aa  66.2  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139747  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1220  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.71 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.68044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1106  VanW family protein  26.13 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000710478  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.59 
 
 		 171 aa  63.9  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.550997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.87 
 
 		 396 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3246  VanW family protein  22.57 
 
 		 677 aa  63.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2263  VanW family protein  26.83 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000431466 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0846  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.56 
 
 		 559 aa  61.6  0.00000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.203875 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0912  hypothetical protein  27.52 
 
 		 574 aa  61.2  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000369378  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0917  VanW family protein  24.75 
 
 		 491 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.361573  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0204  VanW family protein  23.23 
 
 		 604 aa  59.3  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4019  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.56 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4059  VanW family protein  22.52 
 
 		 642 aa  58.9  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.40506  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1099  VanW family protein  27.88 
 
 		 458 aa  58.9  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0429527  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28220  uncharacterized vancomycin resistance protein  22.04 
 
 		 550 aa  58.5  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09580  Ykud domain-containing protein  29.5 
 
 		 514 aa  58.2  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00711473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.57 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1593  VanW  29.75 
 
 		 565 aa  57.8  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.620025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2208  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.75 
 
 		 552 aa  57  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.827056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1420  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24.05 
 
 		 470 aa  55.8  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1300  VanW family protein  27.95 
 
 		 491 aa  55.1  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00126458  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03640  Ykud domain-containing protein  26.11 
 
 		 521 aa  54.7  0.000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000350594  normal  0.0100407 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4281  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.55 
 
 		 628 aa  54.3  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4125  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.58 
 
 		 201 aa  54.3  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.793652  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1062  VanW  24.43 
 
 		 481 aa  53.9  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3298  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.86 
 
 		 263 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0078311  normal  0.0928852 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1178  VanW family protein  24.17 
 
 		 467 aa  53.1  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0607  hypothetical protein  24.63 
 
 		 531 aa  53.5  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0906909  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3025  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.37 
 
 		 492 aa  53.1  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.379639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0186  VanW family protein  25.9 
 
 		 608 aa  52  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.953695 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3666  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.98 
 
 		 345 aa  52  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19490  uncharacterized vancomycin resistance protein  24.35 
 
 		 682 aa  51.6  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0459635  decreased coverage  0.00355972 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2468  VanW family protein  23.48 
 
 		 579 aa  51.6  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1911  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.69 
 
 		 464 aa  51.2  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.462593  normal  0.780803 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1520  vanW-like family protein  24.24 
 
 		 520 aa  50.8  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.516908  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0777  VanW family protein  24.64 
 
 		 456 aa  50.8  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309113  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2244  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.68 
 
 		 476 aa  50.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111887  decreased coverage  0.00847254 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4659  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24.27 
 
 		 261 aa  50.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0138559  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1638  VanW  24.66 
 
 		 436 aa  50.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1161  VanW family protein  21.52 
 
 		 580 aa  50.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3019  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.4 
 
 		 266 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258239  normal  0.464077 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1021  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.71 
 
 		 417 aa  50.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.451264  normal  0.540486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11462  hypothetical protein  32.41 
 
 		 271 aa  48.9  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.891259 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1022  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24.24 
 
 		 411 aa  48.5  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.575167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0758  VanW family protein  26.67 
 
 		 1355 aa  48.5  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.115824 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0460  hypothetical protein  19.64 
 
 		 410 aa  48.1  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000335843  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1397  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.53 
 
 		 276 aa  48.1  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.261472 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0633  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.28 
 
 		 253 aa  47.8  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00165646  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1758  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.2 
 
 		 400 aa  47.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1128  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.57 
 
 		 425 aa  47  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.514766  normal  0.810512 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2825  putative vancomycin resistance protein  22.59 
 
 		 652 aa  47.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2386  VanW  21.99 
 
 		 569 aa  46.6  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3554  VanW family protein  24.13 
 
 		 748 aa  46.6  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.650443  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2124  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  26.15 
 
 		 216 aa  45.8  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1124  VanW family protein  24.31 
 
 		 582 aa  45.8  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0405605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4515  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.32 
 
 		 256 aa  46.2  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1258  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.85 
 
 		 294 aa  46.2  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.818065  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6965  VanW family protein  26.09 
 
 		 892 aa  46.2  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0796  VanW family protein  19.53 
 
 		 847 aa  45.8  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.823779 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3002  VanW family protein  23.71 
 
 		 591 aa  46.2  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0965  VanW family protein  22.78 
 
 		 776 aa  45.8  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.964336  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1284  hypothetical protein  28.57 
 
 		 418 aa  45.8  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257674  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28770  hypothetical protein  29.45 
 
 		 399 aa  45.4  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.132574 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2395  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.01 
 
 		 254 aa  45.8  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0161854  decreased coverage  0.00139428 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1397  vanW-related protein  19.91 
 
 		 420 aa  45.4  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000158977  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1310  vanW-like family protein  36.99 
 
 		 518 aa  45.4  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5256  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.35 
 
 		 524 aa  45.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10117  hypothetical protein  28.28 
 
 		 251 aa  45.4  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2947  hypothetical protein  22.65 
 
 		 481 aa  45.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0687281  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2989  hypothetical protein  23.2 
 
 		 482 aa  44.7  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2161  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.63 
 
 		 439 aa  44.7  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3224  hypothetical protein  22.65 
 
 		 498 aa  44.7  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>