17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0460 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0460  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  832    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000335843  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4437  VanW family protein  23.64 
 
 		 503 aa  90.1  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3560  VanW family protein  22.9 
 
 		 435 aa  69.3  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101582  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1300  VanW family protein  18.75 
 
 		 491 aa  57.8  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00126458  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1099  VanW family protein  19.32 
 
 		 458 aa  57  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0429527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0777  VanW family protein  21.21 
 
 		 456 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309113  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1062  VanW  19 
 
 		 481 aa  53.1  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2755  VanW family protein  21.36 
 
 		 670 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1106  VanW family protein  19.87 
 
 		 439 aa  52  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000710478  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1178  VanW family protein  19.61 
 
 		 467 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0042  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  19.64 
 
 		 866 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1520  vanW-like family protein  18.94 
 
 		 520 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.516908  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0887  hypothetical protein  26.92 
 
 		 442 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0472  hypothetical protein  29.09 
 
 		 510 aa  44.3  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000143149  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1310  vanW-like family protein  18.71 
 
 		 518 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38770  hypothetical protein  23.11 
 
 		 415 aa  43.9  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0917  VanW family protein  22.61 
 
 		 491 aa  43.1  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.361573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>