26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_38770 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_38770  hypothetical protein  100 
 
 		 415 aa  800    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28220  uncharacterized vancomycin resistance protein  34.08 
 
 		 550 aa  177  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6965  VanW family protein  33.33 
 
 		 892 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5187  VanW family protein  33.12 
 
 		 576 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1124  VanW family protein  33.12 
 
 		 582 aa  144  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0405605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4452  VanW family protein  29.75 
 
 		 559 aa  97.4  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0991  VanW family protein  29.13 
 
 		 1016 aa  81.6  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.632754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0965  VanW family protein  31.45 
 
 		 776 aa  80.1  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.964336  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0204  VanW family protein  29.02 
 
 		 604 aa  79.7  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3554  VanW family protein  27.48 
 
 		 748 aa  77.4  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.650443  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1161  VanW family protein  30.07 
 
 		 580 aa  72.8  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19490  uncharacterized vancomycin resistance protein  30.18 
 
 		 682 aa  67.4  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0459635  decreased coverage  0.00355972 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1126  VanW family protein  29.41 
 
 		 772 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4909  VanW family protein  33.66 
 
 		 633 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26060  uncharacterized vancomycin resistance protein  26.16 
 
 		 765 aa  61.6  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0186  VanW family protein  24.84 
 
 		 608 aa  62.4  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.953695 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1933  VanW family protein  24.75 
 
 		 567 aa  62  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416962  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8063  vancomycin resistance protein- like protein  27.12 
 
 		 690 aa  60.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.470172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2825  putative vancomycin resistance protein  27.02 
 
 		 652 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3246  VanW family protein  27.52 
 
 		 677 aa  58.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0398  VanW family protein  28.93 
 
 		 620 aa  58.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151032  normal  0.03789 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0796  VanW family protein  27.11 
 
 		 847 aa  56.2  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.823779 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0758  VanW family protein  31.51 
 
 		 1355 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.115824 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0879  VanW family protein  30.46 
 
 		 580 aa  54.7  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3315  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.67 
 
 		 349 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.322288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0460  hypothetical protein  23.11 
 
 		 410 aa  43.5  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000335843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>