104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1202 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 
403 aa  804  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1950  hypothetical protein  27.93 
 
 
408 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5034  saccharopine dehydrogenase  29.26 
 
 
407 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5327  saccharopine dehydrogenase  29.39 
 
 
407 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0356987  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4946  saccharopine dehydrogenase  29.26 
 
 
407 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1941  Saccharopine dehydrogenase  29.38 
 
 
446 aa  98.2  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3221  saccharopine dehydrogenase  25.32 
 
 
407 aa  97.4  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4677  Saccharopine dehydrogenase  29.06 
 
 
401 aa  94.7  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3295  Saccharopine dehydrogenase  30.91 
 
 
403 aa  90.5  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.886794  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0572  saccharopine dehydrogenase  23.67 
 
 
398 aa  74.3  3e-12  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1081  saccharopine dehydrogenase  25.75 
 
 
399 aa  73.9  5e-12  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706576  normal  0.0928318 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2539  saccharopine dehydrogenase  23.78 
 
 
398 aa  73.2  7e-12  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  24.92 
 
 
398 aa  72.4  1e-11  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  23.85 
 
 
415 aa  72.8  1e-11  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2320  Saccharopine dehydrogenase  23.06 
 
 
396 aa  71.6  2e-11  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2289  saccharopine dehydrogenase  24.84 
 
 
405 aa  70.1  6e-11  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.772575  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0902  saccharopine dehydrogenase  23.45 
 
 
397 aa  68.9  1e-10  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  1.68136e-06 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0125  Saccharopine dehydrogenase  24.76 
 
 
403 aa  68.2  2e-10  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1922  saccharopine dehydrogenase  26.59 
 
 
392 aa  68.2  3e-10  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00339893 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0438  saccharopine dehydrogenase  22.04 
 
 
426 aa  67.4  4e-10  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0417875  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0352  hypothetical protein  23.99 
 
 
413 aa  67  5e-10  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  30.07 
 
 
378 aa  67  6e-10  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1676  Saccharopine dehydrogenase  23.4 
 
 
398 aa  66.6  7e-10  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0203222  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1790  saccharopine dehydrogenase  25.49 
 
 
401 aa  65.1  2e-09  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2137  saccharopine dehydrogenase  21.61 
 
 
414 aa  65.1  2e-09  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0299628  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02740  hypothetical protein  22.61 
 
 
417 aa  64.7  3e-09  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003102  carboxynorspermidine dehydrogenase putative  22.61 
 
 
414 aa  64.7  3e-09  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1535  Saccharopine dehydrogenase  24.21 
 
 
396 aa  64.3  4e-09  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.82797 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2095  saccharopine dehydrogenase-like protein  23.05 
 
 
399 aa  63.9  4e-09  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2607  saccharopine dehydrogenase  24.17 
 
 
398 aa  63.5  6e-09  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0335  hypothetical protein  23.68 
 
 
413 aa  63.2  8e-09  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1231  hypothetical protein  22.93 
 
 
414 aa  63.2  8e-09  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.292e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2516  saccharopine dehydrogenase  23.44 
 
 
396 aa  63.2  9e-09  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.558897  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  24.76 
 
 
385 aa  62.8  1e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1597  Acyl carrier protein (ACP)  25.78 
 
 
399 aa  61.6  2e-08  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30891  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2888  Saccharopine dehydrogenase  22.82 
 
 
403 aa  61.6  2e-08  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.120454 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0527  saccharopine dehydrogenase  24.42 
 
 
347 aa  62  2e-08  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1555  Saccharopine dehydrogenase  22.88 
 
 
401 aa  61.2  3e-08  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.42738e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  23.61 
 
 
384 aa  61.6  3e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1307  Saccharopine dehydrogenase  22.8 
 
 
399 aa  61.6  3e-08  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.84986e-15 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  22.47 
 
 
413 aa  60.8  4e-08  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0148  Saccharopine dehydrogenase  22.85 
 
 
409 aa  60.5  5e-08  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2918  Saccharopine dehydrogenase  22.4 
 
 
398 aa  60.5  5e-08  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  22.13 
 
 
367 aa  60.1  6e-08  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2142  Saccharopine dehydrogenase  26.44 
 
 
404 aa  60.1  6e-08  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0677  saccharopine dehydrogenase  20.74 
 
 
397 aa  59.3  1e-07  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.10466 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0981  saccharopine dehydrogenase  23.79 
 
 
398 aa  58.9  1e-07  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0620633  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1622  saccharopine dehydrogenase  23.51 
 
 
348 aa  58.5  2e-07  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.871276  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1380  saccharopine dehydrogenase  21.93 
 
 
412 aa  57.8  3e-07  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000104449  normal  0.291708 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0186  saccharopine dehydrogenase  23.95 
 
 
401 aa  57  5e-07  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0999  saccharopine dehydrogenase  22.48 
 
 
405 aa  57  5e-07  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0445398  hitchhiker  0.00533099 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6504  Saccharopine dehydrogenase  22.09 
 
 
395 aa  57  6e-07  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752719  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1128  Saccharopine dehydrogenase  21.26 
 
 
399 aa  57  6e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.785881  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0165  saccharopine dehydrogenase  23.95 
 
 
401 aa  57  7e-07  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4440  saccharopine dehydrogenase  22.71 
 
 
401 aa  56.6  9e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2884  saccharopine dehydrogenase  23.46 
 
 
412 aa  55.8  1e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0208  saccharopine dehydrogenase  23.57 
 
 
401 aa  55.8  1e-06  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.69447  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1243  saccharopine dehydrogenase  30.52 
 
 
365 aa  55.5  2e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  24.24 
 
 
384 aa  55.1  2e-06  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3519  Saccharopine dehydrogenase  22.52 
 
 
405 aa  54.7  3e-06  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0988  saccharopine dehydrogenase  22.71 
 
 
413 aa  54.3  3e-06  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  5.77497e-06 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1791  saccharopine dehydrogenase  24.17 
 
 
392 aa  54.7  3e-06  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1715  saccharopine dehydrogenase  21.17 
 
 
422 aa  54.7  3e-06  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  6.59439e-10  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03351  Carboxynorspermidine dehydrogenase  21.19 
 
 
400 aa  53.9  4e-06  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00142848  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  25 
 
 
369 aa  54.3  4e-06  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0458  saccharopine dehydrogenase  23.58 
 
 
401 aa  53.9  5e-06  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1181  saccharopine dehydrogenase  21.21 
 
 
394 aa  53.5  6e-06  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.886294  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0647  saccharopine dehydrogenase  23.44 
 
 
348 aa  53.1  8e-06  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0748  saccharopine dehydrogenase  20.4 
 
 
400 aa  52.8  1e-05  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1201  saccharopine dehydrogenase  22.19 
 
 
402 aa  51.6  2e-05  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.150944  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  24.29 
 
 
376 aa  52  2e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  6.91069e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4157  saccharopine dehydrogenase  21.52 
 
 
413 aa  52.4  2e-05  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.83779 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2268  Saccharopine dehydrogenase  30.26 
 
 
365 aa  52  2e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87049  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0657  saccharopine dehydrogenase  23.26 
 
 
346 aa  51.6  3e-05  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0126  saccharopine dehydrogenase  22.83 
 
 
412 aa  51.2  3e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.281282 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1475  saccharopine dehydrogenase family protein  22.83 
 
 
412 aa  51.2  3e-05  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1992  putative saccharopine dehydrogenase, NAD-binding  34.55 
 
 
365 aa  50.8  4e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899138  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2764  saccharopine dehydrogenase  21.31 
 
 
414 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114818  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2928  saccharopine dehydrogenase  21.31 
 
 
414 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2955  saccharopine dehydrogenase  21.15 
 
 
407 aa  48.9  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0028  saccharopine dehydrogenase  19.38 
 
 
412 aa  48.1  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0572  saccharopine dehydrogenase  22.36 
 
 
388 aa  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0061  saccharopine dehydrogenase  22.19 
 
 
403 aa  48.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5844  hypothetical protein  21.58 
 
 
413 aa  47.4  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1482  hypothetical protein  22.53 
 
 
394 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1219  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  22.76 
 
 
394 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.182404  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2125  saccharopine dehydrogenase  21.31 
 
 
399 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3052  saccharopine dehydrogenase  20.33 
 
 
399 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1242  saccharopine dehydrogenase  20.61 
 
 
394 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2844  saccharopine dehydrogenase  20.98 
 
 
399 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.241943 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1379  hypothetical protein  19.85 
 
 
394 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2269  saccharopine dehydrogenase  32.93 
 
 
366 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.044171  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0747  saccharopine dehydrogenase  22.94 
 
 
403 aa  44.7  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  4.18334e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2080  saccharopine dehydrogenase  32.93 
 
 
366 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.599315  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0976  hypothetical protein  32.93 
 
 
366 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175424  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2136  saccharopine dehydrogenase  32.93 
 
 
366 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112826  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2308  hypothetical protein  32.93 
 
 
366 aa  43.5  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2081  saccharopine dehydrogenase  28.85 
 
 
371 aa  43.1  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.484567  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6355  saccharopine dehydrogenase  31.71 
 
 
366 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1723  saccharopine dehydrogenase  31.71 
 
 
366 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>