More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0731 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0633  phosphoglycerate kinase  78.82 
 
 
408 aa  677    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0744  phosphoglycerate kinase  79.66 
 
 
411 aa  691    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.333208 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0731  phosphoglycerate kinase  100 
 
 
408 aa  823    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1711  phosphoglycerate kinase  80.3 
 
 
408 aa  682    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0322554 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1789  phosphoglycerate kinase  43.47 
 
 
412 aa  318  9e-86  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0925666  normal  0.515243 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1614  Phosphoglycerate kinase  42.18 
 
 
415 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1653  phosphoglycerate kinase  40.05 
 
 
407 aa  285  8e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.973793  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1600  Phosphoglycerate kinase  42.26 
 
 
408 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0845  phosphoglycerate kinase  39.8 
 
 
414 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37156  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0817  phosphoglycerate kinase  38.6 
 
 
404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1251  phosphoglycerate kinase  39.75 
 
 
405 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0780  phosphoglycerate kinase  40.8 
 
 
414 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.281028  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3327  Phosphoglycerate kinase  41.29 
 
 
404 aa  277  2e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1808  phosphoglycerate kinase  39.95 
 
 
412 aa  276  6e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1138  phosphoglycerate kinase  39.41 
 
 
414 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.927128  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2342  phosphoglycerate kinase  37.9 
 
 
404 aa  273  4.0000000000000004e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.480216 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0043  phosphoglycerate kinase  39.55 
 
 
414 aa  272  7e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.212818  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0773  phosphoglycerate kinase  41.31 
 
 
409 aa  271  2e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.1233  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1345  phosphoglycerate kinase  37.76 
 
 
413 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3562  phosphoglycerate kinase  38.52 
 
 
413 aa  270  4e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.300765 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0290  phosphoglycerate kinase  40.26 
 
 
388 aa  268  2e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0495  phosphoglycerate kinase  37.22 
 
 
419 aa  267  2e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2674  phosphoglycerate kinase  36.71 
 
 
407 aa  258  2e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.667783 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1194  phosphoglycerate kinase  37.4 
 
 
408 aa  257  2e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.622987  normal  0.0429324 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0500  phosphoglycerate kinase  38.56 
 
 
408 aa  253  5.000000000000001e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0608  Phosphoglycerate kinase  37.09 
 
 
409 aa  249  7e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3795  Phosphoglycerate kinase  35.04 
 
 
402 aa  228  2e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2372  phosphoglycerate kinase  35.42 
 
 
407 aa  224  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.504326 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2549  Phosphoglycerate kinase  34.41 
 
 
407 aa  218  1e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  35.59 
 
 
655 aa  199  7.999999999999999e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  33 
 
 
396 aa  199  9e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2059  Phosphoglycerate kinase  35.75 
 
 
395 aa  196  5.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0612926  normal  0.253988 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1134  phosphoglycerate kinase  33.33 
 
 
389 aa  195  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0534  Phosphoglycerate kinase  32.41 
 
 
405 aa  195  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70067  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  34.01 
 
 
394 aa  193  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0229  Phosphoglycerate kinase  32.75 
 
 
399 aa  193  5e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0693093  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  30.89 
 
 
392 aa  192  9e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0798  phosphoglycerate kinase  31.98 
 
 
396 aa  191  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.226782  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0814  phosphoglycerate kinase  31.98 
 
 
396 aa  191  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  33.58 
 
 
402 aa  191  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  34.32 
 
 
399 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  34.07 
 
 
399 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  32.07 
 
 
396 aa  189  5e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1307  phosphoglycerate kinase  32.58 
 
 
403 aa  190  5e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  31.23 
 
 
397 aa  186  5e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  32.49 
 
 
394 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3709  phosphoglycerate kinase  34 
 
 
402 aa  186  7e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  31.06 
 
 
646 aa  186  8e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0303  phosphoglycerate kinase  33.5 
 
 
393 aa  186  9e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  29.48 
 
 
394 aa  186  9e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0803  phosphoglycerate kinase  32.32 
 
 
398 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0739  phosphoglycerate kinase  32.93 
 
 
395 aa  184  3e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000102804  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  33.58 
 
 
395 aa  183  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07140  phosphoglycerate kinase  31.39 
 
 
398 aa  183  6e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.954732  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1167  phosphoglycerate kinase  30.86 
 
 
398 aa  182  8.000000000000001e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13120  phosphoglycerate kinase  32.76 
 
 
398 aa  182  8.000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.459632  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  31.3 
 
 
394 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  33.17 
 
 
395 aa  182  9.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2704  phosphoglycerate kinase  33.92 
 
 
407 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0443  phosphoglycerate kinase  32.66 
 
 
396 aa  182  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3328  phosphoglycerate kinase  31.67 
 
 
391 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.465511  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2018  phosphoglycerate kinase  32.24 
 
 
394 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  33.17 
 
 
396 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0754  phosphoglycerate kinase  31.36 
 
 
391 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.729853  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3335  phosphoglycerate kinase  33.09 
 
 
397 aa  180  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515635 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002472  phosphoglycerate kinase  32.07 
 
 
386 aa  180  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03158  3-phosphoglycerate kinase  32.19 
 
 
391 aa  180  4.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0879  Phosphoglycerate kinase  32.99 
 
 
393 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.436803  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0944  Phosphoglycerate kinase  31.75 
 
 
395 aa  179  7e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  31.04 
 
 
394 aa  179  8e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2283  Phosphoglycerate kinase  30.64 
 
 
407 aa  179  9e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.836007 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0057  phosphoglycerate kinase  30.1 
 
 
393 aa  178  1e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2445  phosphoglycerate kinase  32.58 
 
 
407 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.637803  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  33.08 
 
 
394 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2405  phosphoglycerate kinase  32.58 
 
 
407 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2451  phosphoglycerate kinase  32.58 
 
 
407 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.404703 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  30.53 
 
 
394 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3533  phosphoglycerate kinase  31.33 
 
 
398 aa  177  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0030  phosphoglycerate kinase  31.06 
 
 
392 aa  177  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0377211  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0876  phosphoglycerate kinase  31.77 
 
 
391 aa  176  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236749  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  30.53 
 
 
394 aa  177  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29157  predicted protein  32.25 
 
 
441 aa  176  5e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.122862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  30.53 
 
 
394 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  30.53 
 
 
394 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2336  phosphoglycerate kinase  32.41 
 
 
396 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2388  Phosphoglycerate kinase  31.02 
 
 
392 aa  176  7e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0790  phosphoglycerate kinase  30.69 
 
 
391 aa  176  7e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250302  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  31.04 
 
 
394 aa  176  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03315  phosphoglycerate kinase  30.86 
 
 
420 aa  176  7e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0778  phosphoglycerate kinase  31.84 
 
 
405 aa  176  7e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000119701  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  30.28 
 
 
394 aa  176  8e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0432  phosphoglycerate kinase  32.33 
 
 
401 aa  176  8e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  30.28 
 
 
394 aa  176  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1085  phosphoglycerate kinase  32.02 
 
 
391 aa  176  8e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00353094  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  31.63 
 
 
392 aa  176  8e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03565  phosphoglycerate kinase  31.57 
 
 
386 aa  176  8e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  31.62 
 
 
401 aa  176  9e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  30.28 
 
 
394 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  30.03 
 
 
394 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3038  phosphoglycerate kinase  31.04 
 
 
386 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.586189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>