36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0092 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0092  response regulator receiver protein  100 
 
 
383 aa  751  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170556  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  52.17 
 
 
584 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3242  hypothetical protein  54.07 
 
 
325 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6204  TIR protein  44.14 
 
 
260 aa  156  5e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.396579  normal 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0023  hypothetical protein  48.21 
 
 
320 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5724  TIR protein  46.31 
 
 
942 aa  152  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00541848 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2742  TIR protein  41.01 
 
 
320 aa  146  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000609469  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4818  TIR protein  39.57 
 
 
327 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1783  TIR protein  46.05 
 
 
316 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3816  hypothetical protein  48 
 
 
135 aa  122  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  9.6587e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3815  hypothetical protein  37.41 
 
 
364 aa  102  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00546269  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1920  TIR protein  37.67 
 
 
250 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5406  TIR protein  33.01 
 
 
249 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0088  TIR protein  36.99 
 
 
245 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0832287  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1921  Toll-interleukin receptor  31.97 
 
 
851 aa  87.4  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.504102  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0269  hypothetical protein  32.43 
 
 
195 aa  77.4  3e-13  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.108769  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0273  TIR protein  31.88 
 
 
342 aa  75.1  2e-12  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1477  TIR protein  26.57 
 
 
183 aa  73.2  7e-12  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.475025  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1625  hypothetical protein  32.52 
 
 
290 aa  72.4  1e-11  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1089  TIR protein  33.68 
 
 
585 aa  71.6  2e-11  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0814211  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2180  response regulator receiver protein  36.48 
 
 
227 aa  66.2  1e-09  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0566  hypothetical protein  28.87 
 
 
552 aa  65.5  2e-09  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0583  hypothetical protein  29.58 
 
 
552 aa  65.5  2e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2324  response regulator receiver protein  35.71 
 
 
256 aa  59.3  1e-07  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.618998 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0418  putative transcriptional regulator, CadC  36.55 
 
 
297 aa  59.3  1e-07  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  1.26623e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1547  response regulator receiver protein  34.38 
 
 
256 aa  58.5  2e-07  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00304895  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3795  transcriptional regulator, CadC  31.75 
 
 
325 aa  56.2  9e-07  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.264433  decreased coverage  4.26063e-07 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3128  response regulator receiver protein  34.38 
 
 
270 aa  55.8  1e-06  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0104  hypothetical protein  32.28 
 
 
386 aa  51.2  3e-05  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0066  hypothetical protein  32.19 
 
 
384 aa  50.4  5e-05  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0701  transcriptional regulator, CadC  36.47 
 
 
308 aa  50.4  5e-05  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  34.91 
 
 
1868 aa  50.1  7e-05  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0468  putative transcriptional regulator, CadC  31.76 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  29.14 
 
 
398 aa  47  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  29.14 
 
 
398 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  22.5 
 
 
1266 aa  44.3  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>