49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1547 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1547  response regulator receiver protein  100 
 
 		 256 aa  528  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00304895  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2324  response regulator receiver protein  96.09 
 
 		 256 aa  480  1e-135  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.618998 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3128  response regulator receiver protein  77.38 
 
 		 270 aa  413  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2180  response regulator receiver protein  48.65 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2701  hypothetical protein  52.22 
 
 		 270 aa  95.9  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3795  transcriptional regulator, CadC  41.44 
 
 		 325 aa  89.7  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.264433  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0418  putative transcriptional regulator, CadC  41 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000126623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0468  putative transcriptional regulator, CadC  36.84 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0701  transcriptional regulator, CadC  34.82 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3408  response regulator receiver protein  35.16 
 
 		 215 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000203949  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0092  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 383 aa  58.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170556  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0126  hypothetical protein  33.7 
 
 		 190 aa  52.4  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0059  transcriptional regulatory protein KdpE  32.29 
 
 		 229 aa  49.3  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0051  two component transcriptional regulator  32.29 
 
 		 229 aa  48.9  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0059  two component transcriptional regulator  32.29 
 
 		 229 aa  48.9  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000152099 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0053  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  48.9  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000176822 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 686 aa  48.5  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0051  two component transcriptional regulator  32.29 
 
 		 229 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030378 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4228  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.37 
 
 		 1011 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 		 628 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 764 aa  46.6  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5499  hypothetical protein  32 
 
 		 238 aa  46.6  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 656 aa  45.4  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1709  putative PAS/PAC sensor protein  31.96 
 
 		 669 aa  45.4  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0628445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1708  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.63 
 
 		 869 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1875  histidine kinase  28.16 
 
 		 785 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0661847  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 		 955 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3990  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.51 
 
 		 666 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4377  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.51 
 
 		 666 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  28.43 
 
 		 785 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3840  histidine kinase  28.16 
 
 		 785 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0989388  normal  0.369399 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5978  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.51 
 
 		 656 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.410257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4640  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.7 
 
 		 1194 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0814409  normal  0.0127622 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 781 aa  42.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2174  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 		 633 aa  42.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.634157  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 783 aa  42.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.66 
 
 		 1478 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2827  response regulator receiver protein  32.56 
 
 		 137 aa  42.7  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.51 
 
 		 720 aa  42.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2382  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30 
 
 		 454 aa  42.7  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.598165  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2452  histidine kinase  34.25 
 
 		 459 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4303  two component transcriptional regulator  30.21 
 
 		 229 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.205089  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0056  two component transcriptional regulator  30.21 
 
 		 229 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000725059 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1026  putative PAS/PAC sensor protein  30.12 
 
 		 559 aa  42  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3017  RcsC  28.43 
 
 		 1083 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0055  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.21 
 
 		 229 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2668  response regulator receiver protein  27.18 
 
 		 675 aa  42  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1034  two component transcriptional regulator, winged helix family  30 
 
 		 219 aa  42  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.171933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4479  two component transcriptional regulator  30.21 
 
 		 229 aa  42  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.874583  hitchhiker  0.00000000145831 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>