More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1412 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1412  transcription elongation factor NusA  100 
 
 		 344 aa  664    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000474551  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  72.67 
 
 		 344 aa  504  9.999999999999999e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  72.38 
 
 		 344 aa  503  1e-141  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0735  transcription elongation factor NusA  71.68 
 
 		 344 aa  482  1e-135  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000302084  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0530  transcription elongation factor NusA  55.85 
 
 		 341 aa  362  4e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  51.03 
 
 		 346 aa  333  3e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  51.92 
 
 		 404 aa  330  3e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  51.18 
 
 		 362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  48.67 
 
 		 365 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  51.03 
 
 		 384 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  49.56 
 
 		 383 aa  322  8e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  49.26 
 
 		 493 aa  322  9.000000000000001e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  49.26 
 
 		 382 aa  320  3e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07820  NusA antitermination factor  50.74 
 
 		 377 aa  316  4e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3191  transcription elongation factor NusA  49.26 
 
 		 381 aa  315  6e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000141994  normal  0.115207 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0923  transcription elongation factor NusA  49.26 
 
 		 359 aa  315  9e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000194155  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  49.56 
 
 		 382 aa  305  8.000000000000001e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  44.25 
 
 		 373 aa  301  8.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3854  transcription elongation factor NusA  47.49 
 
 		 368 aa  300  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000110606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3667  transcription elongation factor NusA  47.49 
 
 		 368 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3557  transcription elongation factor NusA  47.49 
 
 		 368 aa  300  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3575  transcription elongation factor NusA  47.49 
 
 		 368 aa  300  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000544237  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3828  transcription elongation factor NusA  47.49 
 
 		 368 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3953  transcription elongation factor NusA  47.49 
 
 		 368 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3863  transcription elongation factor NusA  47.49 
 
 		 368 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000188549  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  49.38 
 
 		 380 aa  300  3e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  47.2 
 
 		 368 aa  299  6e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1330  transcription elongation factor NusA  46.61 
 
 		 368 aa  297  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000381059  hitchhiker  0.000133045 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2468  transcription elongation factor NusA  47.2 
 
 		 366 aa  296  3e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000156927  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  44.57 
 
 		 423 aa  296  3e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  46.61 
 
 		 368 aa  295  6e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  45.03 
 
 		 442 aa  294  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0607  NusA antitermination factor  43.82 
 
 		 433 aa  292  4e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  45.03 
 
 		 442 aa  292  5e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0912  NusA antitermination factor  44.77 
 
 		 372 aa  290  3e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0996  NusA antitermination factor  44.9 
 
 		 369 aa  287  2e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000936712  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1206  NusA antitermination factor  46.13 
 
 		 360 aa  285  5.999999999999999e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876177  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2777  NusA antitermination factor  46.76 
 
 		 354 aa  285  7e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000726051  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0473  NusA antitermination factor  43.44 
 
 		 444 aa  285  9e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000679634  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  43.15 
 
 		 537 aa  282  7.000000000000001e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3683  NusA antitermination factor  45.06 
 
 		 442 aa  281  9e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00388019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0897  transcription elongation factor NusA  44.84 
 
 		 378 aa  281  1e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0054777  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0166  transcription elongation factor NusA  42.86 
 
 		 538 aa  280  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1049  NusA antitermination factor  47.13 
 
 		 357 aa  278  7e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  43.49 
 
 		 381 aa  276  3e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1661  transcription elongation factor NusA  46.51 
 
 		 366 aa  276  3e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  41.67 
 
 		 535 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1943  transcription elongation factor NusA  46.22 
 
 		 366 aa  276  4e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1227  transcription elongation factor NusA  41.89 
 
 		 449 aa  276  5e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000158035  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  41.67 
 
 		 537 aa  275  9e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  41.67 
 
 		 537 aa  275  9e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  41.67 
 
 		 536 aa  275  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  41.37 
 
 		 533 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1475  transcription termination factor NusA  42.41 
 
 		 393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000477736  unclonable  0.00000325116 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  41.67 
 
 		 535 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  41.67 
 
 		 532 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1586  transcription elongation factor NusA  42.6 
 
 		 385 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00876176  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  41.67 
 
 		 552 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  41.42 
 
 		 383 aa  273  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  41.67 
 
 		 538 aa  273  3e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  41.07 
 
 		 534 aa  273  3e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2412  transcription elongation factor NusA  42.31 
 
 		 441 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.659924  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0696  NusA antitermination factor  43.56 
 
 		 395 aa  272  6e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000696258  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  41.07 
 
 		 572 aa  272  6e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1234  transcription elongation factor NusA  42.48 
 
 		 395 aa  272  7e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000227935  normal  0.970518 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0295  transcription elongation factor NusA  41.67 
 
 		 531 aa  270  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0917388  normal  0.0106159 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  40.99 
 
 		 506 aa  269  5.9999999999999995e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  41.76 
 
 		 392 aa  268  8.999999999999999e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0833  transcription elongation factor NusA  41.96 
 
 		 407 aa  266  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.792423  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4616  NusA antitermination factor  41.07 
 
 		 536 aa  266  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831604  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0961  transcription elongation factor NusA  42.9 
 
 		 401 aa  266  4e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462921  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1300  transcription elongation factor NusA  42.01 
 
 		 383 aa  265  7e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000861889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2983  transcription elongation factor NusA  42.01 
 
 		 382 aa  265  7e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0049800000000001e-28 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2613  NusA antitermination factor  41.37 
 
 		 544 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109477  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  41.07 
 
 		 545 aa  264  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  41.07 
 
 		 545 aa  264  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3729  NusA antitermination factor  41.07 
 
 		 545 aa  264  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0217708 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0876  transcription elongation factor NusA  42.06 
 
 		 491 aa  263  3e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0313079  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2515  transcription elongation factor NusA  40.24 
 
 		 443 aa  263  4e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  41 
 
 		 406 aa  262  4.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0378  transcription elongation factor NusA  39.27 
 
 		 383 aa  262  6.999999999999999e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.138784  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2821  NusA antitermination factor  40.48 
 
 		 560 aa  262  8e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1326  transcription elongation factor NusA  42.26 
 
 		 391 aa  261  8.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1352  transcription elongation factor NusA  42.26 
 
 		 391 aa  261  8.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1667  transcription elongation factor NusA  43.84 
 
 		 385 aa  261  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0985  transcription elongation factor NusA  42.06 
 
 		 491 aa  260  2e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00150789  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  39.88 
 
 		 475 aa  261  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3779  transcription elongation factor NusA  41.19 
 
 		 516 aa  260  3e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530973  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0380  transcription elongation factor NusA  39.08 
 
 		 391 aa  259  3e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.078834  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1139  NusA antitermination factor  38.48 
 
 		 556 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3564  NusA antitermination factor  39.24 
 
 		 365 aa  259  6e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0133345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  39.94 
 
 		 537 aa  259  6e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0233  transcription elongation factor NusA  39.64 
 
 		 540 aa  258  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_857  transcription elongation factor  42.06 
 
 		 487 aa  258  1e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000272174  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0029  transcription elongation factor NusA  39.35 
 
 		 536 aa  258  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1410  NusA antitermination factor  41.76 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1358  transcription elongation factor  41.98 
 
 		 365 aa  258  1e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.946051  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1517  transcription elongation factor NusA  42.2 
 
 		 348 aa  258  1e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1160  NusA antitermination factor  38.48 
 
 		 557 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1308  NusA antitermination factor  40.18 
 
 		 421 aa  257  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>